PTPRT: відмінності між версіями

PTPRT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OOQ
Ідентифікатори
Символи	PTPRT, RPTPrho, protein tyrosine phosphatase, receptor type T, protein tyrosine phosphatase receptor type T, RPTP-rho, R-PTP-T
Зовнішні ІД	OMIM: 608712 MGI: 1321152 HomoloGene: 56924 GeneCards: PTPRT
Пов'язані генетичні захворювання
	періодонтит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein tyrosine phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • beta-catenin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphoprotein phosphatase activity; • hydrolase activity; • alpha-catenin binding; • cadherin binding; • delta-catenin binding; • gamma-catenin binding; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • protein phosphatase binding; • protein homodimerization activity; • STAT family protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell surface; • клітинна мембрана; • мембрана; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation; • адгезія клітин; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • negative regulation of cell migration; • cellular response to interleukin-6; • negative regulation of receptor signaling pathway via STAT; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation involved in inactivation of protein kinase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	11122
	19281
	ENSG00000196090
	ENSMUSG00000053141
	O14522
	Q99M80
	NM_007050; NM_133170; NM_001394024; NM_001394025; NM_001394026
	NM_001291149; NM_001291150; NM_001291151; NM_021464
	NP_008981; NP_573400
	NP_001278078; NP_001278079; NP_001278080; NP_067439
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 11:44, 12 вересня 2017

PTPRT (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type T) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 441 амінокислот, а молекулярна маса — 162 134^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M A S L A A L A L S	L L L R L Q L P P L	P G A R A Q S A A G	G C S F D E H Y S N	C G Y S V A L G T N
G F T W E Q I N T W	E K P M L D Q A V P	T G S F M M V N S S	G R A S G Q K A H L	L L P T L K E N D T
H C I D F H Y Y F S	S R D R S S P G A L	N V Y V K V N G G P	Q G N P V W N V S G	V V T E G W V K A E
L A I S T F W P H F	Y Q V I F E S V S L	K G H P G Y I A V D	E V R V L A H P C R	K A P H F L R L Q N
V E V N V G Q N A T	F Q C I A G G K W S	Q H D K L W L Q Q W	N G R D T A L M V T	R V V N H R R F S A
T V S V A D T A Q R	S V S K Y R C V I R	S D G G S G V S N Y	A E L I V K E P P T	P I A P P E L L A V
G A T Y L W I K P N	A N S I I G D G P I	I L K E V E Y R T T	T G T W A E T H I V	D S P N Y K L W H L
D P D V E Y E I R V	L L T R P G E G G T	G P P G P P L T T R	T K C A D P V H G P	Q N V E I V D I R A
R Q L T L Q W E P F	G Y A V T R C H S Y	N L T V Q Y Q Y V F	N Q Q Q Y E A E E V	I Q T S S H Y T L R
G L R P F M T I R L	R L L L S N P E G R	M E S E E L V V Q T	E E D V P G A V P L	E S I Q G G P F E E
K I Y I Q W K P P N	E T N G V I T L Y E	I N Y K A V G S L D	P S A D L S S Q R G	K V F K L R N E T H
H L F V G L Y P G T	T Y S F T I K A S T	A K G F G P P V T T	R I A T K I S A P S	M P E Y D T D T P L
N E T D T T I T V M	L K P A Q S R G A P	V S V Y Q L V V K E	E R L Q K S R R A A	D I I E C F S V P V
S Y R N A S S L D S	L H Y F A A E L K P	A N L P V T Q P F T	V G D N K T Y N G Y	W N P P L S P L K S
Y S I Y F Q A L S K	A N G E T K I N C V	R L A T K G A S T Q	N S N T V E P E K Q	V D N T V K M A G V
I A G L L M F I I I	L L G V M L T I K R	R R N A Y S Y S Y Y	L K L A K K Q K E T	Q S G A Q R E M G P
V A S A D K P T T K	L S A S R N D E G F	S S S S Q D V N G F	T D G S R G E L S Q	P T L T I Q T H P Y
R T C D P V E M S Y	P R D Q F Q P A I R	V A D L L Q H I T Q	M K R G Q G Y G F K	E E Y E A L P E G Q
T A S W D T A K E D	E N R N K N R Y G N	I I S Y D H S R V R	L L V L D G D P H S	D Y I N A N Y I D G
Y H R P R H Y I A T	Q G P M Q E T V K D	F W R M I W Q E N S	A S I V M V T N L V	E V G R V K C V R Y
W P D D T E V Y G D	I K V T L I E T E P	L A E Y V I R T F T	V Q K K G Y H E I R	E L R L F H F T S W
P D H G V P C Y A T	G L L G F V R Q V K	F L N P P E A G P I	V V H C S A G A G R	T G C F I A I D T M
L D M A E N E G V V	D I F N C V R E L R	A Q R V N L V Q T E	E Q Y V F V H D A I	L E A C L C G N T A
I P V C E F R S L Y	Y N I S R L D P Q T	N S S Q I K D E F Q	T L N I V T P R V R	P E D C S I G L L P
R N H D K N R S M D	V L P L D R C L P F	L I S V D G E S S N	Y I N A A L M D S H	K Q P A A F V V T Q
H P L P N T V A D F	W R L V F D Y N C S	S V V M L N E M D T	A Q F C M Q Y W P E	K T S G C Y G P I Q
V E F V S A D I D E	D I I H R I F R I C	N M A R P Q D G Y R	I V Q H L Q Y I G W	P A Y R D T P P S K
R S L L K V V R R L	E K W Q E Q Y D G R	E G R T V V H C L N	G G G R S G T F C A	I C S V C E M I Q Q
Q N I I D V F H I V	K T L R N N K S N M	V E T L E Q Y K F V	Y E V A L E Y L S S	F

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

McAndrew P.E., Frostholm A., White R.A., Rotter A., Burghes A.H.M. (1998). Identification and characterization of RPTP rho, a novel RPTP mu/kappa-like receptor protein tyrosine phosphatase whose expression is restricted to the central nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 56: 9—21. PMID 9602027 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00014-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Besco J.A., Frostholm A., Popesco M.C., Burghes A.H.M., Rotter A. (2001). Genomic organization and alternative splicing of the human and mouse RPTPrho genes. BMC Genomics. 2: 1—1. PMID 11423001 DOI:10.1186/1471-2164-2-1
Besco J.A., Frostholm A., Popesco M.C., Burghes A.H.M., Rotter A. (2001). BMC Genomics. 2: 5—5. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 11814386 DOI:10.1186/1471-2164-2-5

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9682 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O14522 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PTPRT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9682 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O14522 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

PTPRT: відмінності між версіями

Версія за 11:44, 12 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук