Аргонавт (білок)

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
(Перенаправлено з Аргонавт білки)
Перейти до: навігація, пошук
Аргонавт
1u04-argonaute.png
Структура білка Аргонавт архебактерії Pyrococcus furiosus[1].
Ідентифікатори
Символ Argonaute
PDB 1U04
UniProt Q8U3D2
Інша інформація

Аргонавт (англ. Argonaute) – загальна назва білків, що беруть участь у процесі РНК інтерференції. Білки родини Аргонавт формують РНК-індукований комплекс заглушення генів RISC (англ. RNA-induced silencing complex), що виконує функцію специфічного "виключення" генів-мішеней за допомогою коротких некодуючих РНК (мікроРНК, ендо-міРНК та піРНК)[2]. Білки родини аргонавт дуже консервативні у всіх еукаріотів, за винятком дріжджів Saccharomyces cerevisiae, що втратили здатність до РНК інтерференції[3]. Також Аргонавт білки присутні у архей і бактерій, але їхня функція там не до кінця з'ясована.

Підродини сімейства Аргонавт[ред.ред. код]

Білки родини Аргонавт діляться на три підкатегорії: AGO, PIWI (англ. P-element-induced wimpy testis) та WAGO, яка специфічна для круглих червів (Caenorhabditis elegans)[4].

У рослин також є представники родини Аргонавт, AGO1, які схожі на підродину AGO, але в період розвитку ці білки виконують рослинно-специфічні функції.

AGO[ред.ред. код]

AGO підродина білків взаємодіє з мікроРНК та малими інтерферуючими РНК. Для біогенезу таких видів РНК необхідна активність РНКази III.

PIWI[ред.ред. код]

Докладніше: піРНК

PIWI підродина білків взаємодіє з піРНК – малими нкРНК, що походять з ділянок ДНК під назвою піРНК-кластери, біогенез яких не залежить від ферменту РНКази III.

WAGO[ред.ред. код]

Невеликі нкРНК, що взаємодіють з білками підродини WAGO є продуктами прямого синтезу РНК.

Механізм РНК-заглушення[ред.ред. код]

Деякі РНК формуються у вигляді двоспіральних молекул, але лише один ланцюг з'єднується з білком родини Аргонавт – це так званий гід-ланцюг (англ. guide strand), а комплементарний йому називається ланцюг-пасажир (англ. passenger strand). Важливим етапом є вибір саме гіда-ланцюга, оскільки при виборі ланцюга-пасажира будуть деградувати інші мРНК[4].

Примітки[ред.ред. код]

  1. Ji-Joon Song, Stephanie K. Smith, Gregory J. Hannon & Leemor Joshua-Tor Crystal structure of Argonaute and its implications for RISC slicer activity // Science, 305 (September 2004) (5689) С. 1434–1437. — DOI:10.1126/science.1102514. — PMID:15284453.
  2. Gunter Meister Argonaute proteins: functional insights and emerging roles // Nature reviews. Genetics, 14 (July 2013) (7) С. 447–459. — DOI:10.1038/nrg3462. — PMID:23732335.
  3. Ines A. Drinnenberg, David E. Weinberg, Kathleen T. Xie, Jeffrey P. Mower, Kenneth H. Wolfe, Gerald R. Fink & David P. Bartel RNAi in budding yeast // Science, 326 (October 2009) (5952) С. 544–550. — DOI:10.1126/science.1176945. — PMID:19745116.
  4. а б Benjamin Czech & Gregory J. Hannon Small RNA sorting: matchmaking for Argonautes // Nature reviews. Genetics, 12 (January 2011) (1) С. 19–31. — DOI:10.1038/nrg2916. — PMID:21116305.



Сахарин Це незавершена стаття з молекулярної біології.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.