Енциклопедія елементів ДНК

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до: навігація, пошук

Енциклопедія елементів ДНК (англ. Encyclopedia Оf DNA Elements, ENCODE) — відкритий міжнародний науковий проект спрямований на пошук та систематичний дослід усіх функціональних елементів геному людини та модельних організмів. Проект почався у вересні 2003 року за ініціативою Національних інститутів охорони здоров'я США.[1] У 2012 році над проектом працювали понад 440 фахівців в 32 лабораторіях США, Західної Європи, Японії та Сингапуру. В перші 9 років бюджет становив 300 мільйонів доларів.[2]

В пілотній фазі проекту (2003—2007) було проаналізовано 1% геному людини[3] та розроблялися нові методи дослідження функціональних елементів. В продуційній фазі проекту (2007—2012) елементи всього геному людини аналізували в 1600 експериментах на 147 тканинах, використовуючи стандартизовані протоколи. Були створені спеціальні бази даних і програми для їх аналізу, розроблена система координації праці науковців. Результати другої фази проекту були надруковані в інтегральній статті в Nature[4], ще 5 статтях в цьому журналі, 18 статтях в Genome Research і 6 статтях в Genome Biology.

Основний висновок проекту становить що 80% геному людини кодує 4 мільйони перемикачів, які регулюють 21 тисячу генів, що займають лише 1,5% геному, і тим самим спростовано концепцію «сміттєвої ДНК». Цей висновок був відзначений як одне з найвагоміших досягнень десятиріччя в медицині та біології тому що варіації в численних регуляторах, а не тільки в білок-кодуючих генах, впливають на здоров'я і захворювання людини.[5][6][7]

Примітки[ред.ред. код]

  1. The ENCODE Project Consortium The ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) Project // Science. — 306 (2004) (5696) С. 636-640. DOI:10.1126/science.1105136. Процитовано 6 вересня 2012.
  2. National Human Genome Research Institute (September 5, 2012). "ENCODE data describes function of human genome. NHGRI-funded study produces massive data set, novel publishing strategy". Прес-реліз. Переглянутий 6 вересня 2012.
  3. The ENCODE Project Consortium Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project // Nature. — 447 (2007) (7146) С. 799-816. DOI:10.1038/nature05874. Процитовано 6 вересня 2012.
  4. The ENCODE Project Consortium An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome // Nature. — 489 (2012) (7414) С. 57–74. DOI:10.1038/nature11247. Процитовано 6 вересня 2012.
  5. Kolata, Gina (September 5, 2012), «Bits of Mystery DNA, Far From ‘Junk,’ Play Crucial Role», New York Times, http://www.nytimes.com/2012/09/06/science/far-from-junk-dna-dark-matter-proves-crucial-to-health.html?pagewanted=all, процитовано 5 вересня 2012 
  6. 6 вересня 2012. Зроблено ще один крок до розшифровки геному людини [телебачення]. Перший національний.
  7. ЛІГАБізнесІнформ (6 вересня 2012), «Вчені склали саму повну карту ДНК людини», Ліга, http://news.liga.net/ua/news/world/726779-vchen_sklali_samu_povnu_kartu_dnk_lyudini.htm, процитовано 6 вересня 2012 

Зовнішні посилання[ред.ред. код]