Наноархеоти

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до: навігація, пошук

Наноархеоти (лат. Nanoarchaeota) — четвертий тип в домені Археї[1]. Відкритий в 2002 рік у[2].

Єдиний відомий на сьогодні вид — Nanoarchaeum equitans. Його представники можуть розвиватися тільки сукупно з археями роду Ignicoccus (що належить до типу Crenarchaeota), це є унікальне явище для архей. На одній клітці Ignicoccus селиться від 2 до 4 клітин Nanoarchaeum equitans, діаметр яких 0,35-0,50 мкм. У місці контакту клітин прикріпних структур не виявлено. Відділення Nanoarchaeum equitans від клітинIgnicoccusможе бути викликано м'яким впливом ультразвуку. При спільному культивуванні в штучних умовах на пізній експоненційної фазі росту спостерігалося самостійне відділення близько 80% клітин Nanoarchaeum equitans від Ignicoccus.
Метаболізм Nanoarchaeum equitans поки не відомий. Вони не розмножуються у відсутності живих клітин Ignicoccus. Nanoarchaeum equitansсуворі анаероби. Температура, при якій живуть ці археї становить 90 °C.
Їх геном відсеквентований і становить 490 885 пар основ. Це один з найменших клітинних геномів, який поки що вдалося знайти (менший геном у ендосімбіотіческой бактерії Carsonella). У Nanoarchaeum equitans залишилися тільки гени, що відповідають за біосинтез білка, реплікацію, транскрипцію і трансляцію, 95% геному кодує білки.
Nanoarchaeum equitans не можуть синтезувати ліпіди, нуклеотиди і амінокислоти, отримуючи їх від Ignicoccus. Можливо, вони також залежать від енергетичного метаболізму господаря. Швидкість зростання Ignicoccus у чистій культурі і змішаній культурі при невисокій чисельності Nanoarchaeum equitans не розрізняється, але дуже велике число наноархей (кілька на кожну клітину господаря) пригнічує розвиток Ignicoccus. У зв'язку з цим Nanoarchaeum equitans можна розглядати як паразитів, що робить їх єдиними відомими паразитами серед архей.[3]
Nanoarchaeum equitans, виділені з гарячих сірчаних джерел Серединно-Атлантичного хребта на глибині 106 метрів. Пізніше 16s рРНК наноархей з послідовностями, схожими на Nanoarchaeum equitans, виявили в Тихому океані, в гейзерах Йєллоустоуна і Камчатки. Методом FISH встановлено, що всі Nanoarchaeota прикріплюються до клітин інших архей.

Примітки[ред.ред. код]

  1. Див NCBI Nanoarchaeota. «NCBI taxonomy resources». National Center for Biotechnology Information. Процитовано 2008-01-28. 
  2. H. Huber,et al.(2002) «A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont»,Nature , 417: 63-7. PubMed entry: [1]
  3. E. Waters, et al. (2003) «The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism», PNAS, 100: 12984-8 .

Література[ред.ред. код]

  • Hohn, MJ; Hedlund BP, Huber H (2002). «Detection of 16S rDNA sequences representing the novel phylum 'Nanoarchaeota': indication for a wide distribution in high temperature biotopes». Syst. Appl. Microbiol. 25 (4). с. 551–554. doi:10.1078/07232020260517698. PMID 12583716. 
  • Huber, H; Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2002). «A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont». Nature 417 (6884). с. 63–67. doi:10.1038/417063a. PMID 11986665. 
  • Stackebrandt, E; Frederiksen W, Garrity GM, Grimont PA, Kampfer P, Maiden MC, Nesme X, Rossello-Mora R, Swings J, Truper HG, Vauterin L, Ward AC, Whitman WB (2002). «Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 3). с. 1043–1047. doi:10.1099/ijs.0.02360-0. PMID 12054223. 
  • Christensen, H; Bisgaard M, Frederiksen W, Mutters R, Kuhnert P, Olsen JE (2001). «Is characterization of a single isolate sufficient for valid publication of a new genus or species? Proposal to modify recommendation 30b of the Bacteriological Code (1990 Revision)». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 6). с. 2221–2225. PMID 11760965. 
  • Gurtler, V; Mayall BC (2001). «Genomic approaches to typing, taxonomy and evolution of bacterial isolates». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 1). с. 3–16. PMID 11211268. 
  • Dalevi, D; Hugenholtz P, Blackall LL (2001). «A multiple-outgroup approach to resolving division-level phylogenetic relationships using 16S rDNA data». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2). с. 385–391. PMID 11321083. 
  • Keswani, J; Whitman WB (2001). «Relationship of 16S rRNA sequence similarity to DNA hybridization in prokaryotes». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2). с. 667–678. PMID 11321113. 
  • Young, JM (2001). «Implications of alternative classifications and horizontal gene transfer for bacterial taxonomy». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 3). с. 945–953. PMID 11411719. 
  • Christensen, H; Angen O, Mutters R, Olsen JE, Bisgaard M (2000). «DNA-DNA hybridization determined in micro-wells using covalent attachment of DNA». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50. с. 1095–1102. PMID 10843050. 
  • Xu, HX; Kawamura Y, Li N, Zhao L, Li TM, Li ZY, Shu S, Ezaki T (2000). «A rapid method for determining the G+C content of bacterial chromosomes by monitoring fluorescence intensity during DNA denaturation in a capillary tube». Int. J. Syst.Evol. Microbiol. 50. с. 1463–1469. PMID 10939651. 
  • Young, JM (2000). «Suggestions for avoiding on-going confusion from the Bacteriological Code». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50. с. 1687–1689. PMID 10939677. 
  • Hansmann, S; Martin W (2000). «Phylogeny of 33 ribosomal and six other proteins encoded in an ancient gene cluster that is conserved across prokaryotic genomes: influence of excluding poorly alignable sites from analysis». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50. с. 1655–1663. PMID 10939673. 
  • Tindall, BJ (1999). «Proposal to change the Rule governing the designation of type strains deposited under culture collection numbers allocated for patent purposes». Int. J. Syst. Bacteriol. 49. с. 1317–1319. doi:10.1099/00207713-49-3-1317. PMID 10490293. 
  • Tindall, BJ (1999). «Proposal to change Rule 18a, Rule 18f and Rule 30 to limit the retroactive consequences of changes accepted by the ICSB». Int. J. Syst. Bacteriol. 49. с. 1321–1322. doi:10.1099/00207713-49-3-1321. PMID 10425797. 
  • Palys, T; Nakamura LK, Cohan FM (1997). «Discovery and classification of ecological diversity in the bacterial world: the role of DNA sequence data». Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (4). с. 1145–1156. doi:10.1099/00207713-47-4-1145. PMID 9336922. 
  • Euzeby, JP (1997). «List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet». Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (2). с. 590–592. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655. 
  • Clayton, RA; Sutton G, Hinkle PS Jr, Bult C, Fields C (1995). «Intraspecific variation in small-subunit rRNA sequences in GenBank: why single sequences may not adequately represent prokaryotic taxa». Int. J. Syst. Bacteriol. 45 (3). с. 595–599. doi:10.1099/00207713-45-3-595. PMID 8590690. 
  • Murray, RG; Schleifer KH (1994). «Taxonomic notes: a proposal for recording the properties of putative taxa of procaryotes». Int. J. Syst. Bacteriol. 44 (1). с. 174–176. doi:10.1099/00207713-44-1-174. PMID 8123559. 
  • Winker, S; Woese CR (1991). «A definition of the domains Archaea, Bacteria and Eucarya in terms of small subunit ribosomal RNA characteristics». Syst. Appl. Microbiol. 14 (4). с. 305–310. PMID 11540071. 
  • Woese, CR; Kandler O, Wheelis ML (1990). «Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 (12). с. 4576–4579. doi:10.1073/pnas.87.12.4576. PMC 54159. PMID 2112744. 
  • Achenbach-Richter, L; Woese CR (1988). «The ribosomal gene spacer region in archaebacteria». Syst. Appl. Microbiol. 10. с. 211–214. PMID 11542149. 
  • McGill, TJ; Jurka J, Sobieski JM, Pickett MH, Woese CR, Fox GE (1986). «Characteristic archaebacterial 16S rRNA oligonucleotides». Syst. Appl. Microbiol. 7. с. 194–197. PMID 11542064. 
  • Woese, CR; Olsen GJ (1984). «The phylogenetic relationships of three sulfur dependent archaebacteria». Syst. Appl. Microbiol. 5. с. 97–105. PMID 11541975.