Acidobacteria

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до: навігація, пошук
Acidobacteria
Acidobacterium.jpg
Біологічна класифікація
Домен: Бактерії
Надтип: Fibrobacteres/Acidobacteria
Тип: Acidobacteria
Класи/ряди/родини/роди
Посилання
US-NLM-NCBI-Logo.svg NCBI: 57723

Acidobacteria — недавно визначений тип бактерій. Як вказує назва, відомі види типу ацидофільні. Попри те, що тип вивчений дуже мало, він — важлива складова частина багатьох екосистем, особливо, ґрунтів. Часто, більш ніж 30 % або навіть 50 % послідовностей мікроорганізмів у зразках ґрунту, згідно з аналізом їх 16S рРНК, належали до цього типу [1]. Вони домінували в молекулярних аналізах вологих ґрунтів Вісконсіна, безводих ґрунтів Арізони і в ризосфері масляних культурних рослин [2][3] Окремі послідовності представників Acidobacteria також були виявлені в прісноводих середовищах [4], мікробних матах гарячих джерел [4], густій грязі стічних вод [5], біореакторах очищення стічних вод [6] та інших середовищах.

Хоча тепер тип Acidobacteria містить тільки три описані види: Acidobacterium capsulatum, Geothrix fermentans і Holophaga foetida, та декілька недавно ідентифікованих ізолятів [7], більшість Acidobacteria ще не була культивирована і відома тільки за своїми послідовностями 16S рРНК. Фізіологічні дані про цю групу дуже обмежені. Окрім деяких фенотипичних рис трьох описаних видів, цей тип поки що тільки відомий одним геном і його відповідною послідовністю в суспільних базах даних (ендо-1-4-бета-ксиланаза бактерії A. capsulatum). Засновуючись на філогенетичному аналізі 16S рРНК, Acidobacteria може бути розділеними на шість головних груп [4], які відрізняються до 22 % своїми генами 16S рРНК. Розповсюдженість і велика кількість цих мікроорганізмів піднімає питання їх екологічної ролі і метаболічних процесів, в яких вони беруть участь, особливо в ґрунтових середовищах. Засновуючись на різноманітності їх філогенезу і екологічному розповсюдженні, очікується, що Acidobacteria метаболічно і генетично являють собою дуже різноманітну групу, порівнянну з такими групами, як Протеобактерії або грам-позитивні бактерії [4][1].

Посилання[ред.ред. код]

  1. а б Achim Quaiser, Torsten Ochsenreiter, Christa Lanz, Stephan C. Schuster, Alexander H. Treusch, Jürgen Eck and Christa Schleper Acidobacteria form a coherent but highly diverse group within the bacterial domain: evidence from environmental genomics // Molecular Microbiology, 50(2) (2003) С. 563.
  2. Kuske, C.R., Barns, S.M., and Busch, J.D. Diverse uncultivated bacterial groups from soils of the arid southwestern United States that are present in many geographic regions // Appl Environ Microbiol, (1997) С. 3614–3621.
  3. Dunbar, J., Takala, S., Barns, S.M., Davis, J.A., and Kuske, C.R. Levels of bacterial community diversity in four arid soils compared by cultivation and 16S rRNA gene cloning // Appl Environ Microbiol, 65 (1999) С. 1662–1669.
  4. а б в г Barns, S.M., Takala, S.L., and Kuske, C.R. Wide distribution and diversity of members of the bacterial kingdom Acidobacterium in the environment // Appl Environ Microbiol, 65 (1999) С. 1731–1737.
  5. Layton, A.C., Karanth, P.N., Lajoie, C.A., Meyers, A.J., Gregory, I.R., Stapleton, R.D., et al. Quantification of Hyphomicrobium populations in activated sludge from an industrial wastewater treatment system as determined by 16S rRNA analysis // Appl Environ Microbiol, 66 (2000) С. 1167–1174.
  6. LaPara, T.M., Nakatsu, C.H., Pantea, L., and Alleman, J.E. Phylogenetic analysis of bacterial communities in mesophilic and thermophilic bioreactors treating pharmaceutical wastewater 66 (2000) С. 3951–3959.
  7. Janssen, P.H., Yates, P.S., Grinton, B.E., Taylor, P.M., and Sait, M Improved culturability of soil bacteria and isolation in pure culture of novel members of the divisions Acidobacteria, Actinobacteria, Proteobacteria, and Verrucomicrobia // Appl Environ Microbiol, 68 (2002) С. 2391–2396.