Відмінності між версіями «Ампліфікація ДНК-повторів»

Перейти до навігації Перейти до пошуку
нема опису редагування
(Нова сторінка: '''Ампліфікація ДНК повторів''' — це геномний фінгерпринтинг на основі ПЛР. == Суть методу ...)
 
'''АмпліфікаціяАмпліфіка́ція ДНК повторівповто́рів'''  — це [[геномний фінгерпринтинг]] на основі [[ПЛР]].
 
== Суть методу ==
 
[[Прокаріоти]]чний [[геном]] містить багато коротких послідовностей, що повторюються. Хоча функції їх повністю ще не відомі, вони використовуються як мішень для [[ідентифікація|ідентифікідентифікації ]]ації [[мікроорганізми|мікроорганіз]]мів в навколишньому середовищі. Важливим підкласом цих елементів є [[міжгенні паліндромні повтори]] ([[REP]])  — [[висококонсервативні інвертовані повтори]], що мають загальний вигляд:
 
:::::::: 5'-GCCG/TGAT GGCGG/ACGG/ACGC/T G/ACGC/TCTTATCC/AGGCCTAC- 3'
 
[[REP]] повтори локалізовані в міжгенних ділянках [[хромосома|хром]]осоми, які не траслюються, в кількості від 500 до 11000 копій. Досить поширеними є і ентеробактеріальні ендогенні консенсусні повтори ([[ERIC]]), які також являють собою інвертовані повтори, та [[BOX-елементи]]. Висока консервативність цих повторів дозволила створити комплементарні їм [[праймери]] для [[ампліфікація|ампліфі]]кації з допомогою [[ПЛР]] [[локус]]ів [[бактерії|бактеріальног]]о [[геном]]у, локалізованих між [[REP]] чи двома [[ERIC]] елементами. Результатом цієї реакції є утворення набору [[ДНК]] фрагментів від 200 п. о. до більш ніж 6 т. п. о., розділених в [[агарозний гель|агарозному гелі]], котрі відображають організацію геному даного мікроорганізму.
 
== Значення і використання ==
 
== Література ==
 
#Lupski J. K., Wientsock G. M. Short interspersed repetitive DNA sequences in prokaryotic genomes// J.Bacteriol. – 1992. – 174. – №14. – p. 4525 -4529.
#Versalovic ''Lupski J., Koeuth T K.'', Lupski J''Wientsock G. R M.'' DistributionShort ofinterspersed repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterialprokaryotic genomes// NuclJ.Bacteriol. — Acids Res1992. — – 1991174. — – 19№ 14. — p. 6823 - 6831 4525—4529.
# ''Versalovic J.'', ''Koeuth T.'', ''Lupski J. R.'' Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes// Nucl. Acids Res. — 1991. — 19. — p. 6823 — 6831.
 
[[Категорія:Молекулярна біологія]]
128 291

редагування

Навігаційне меню