Талін-1

Талін-1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SYQ, 2MWN, 4DJ9
Ідентифікатори
Символи	TLN1, ILWEQ, TLN, talin 1, talin-1
Зовнішні ІД	OMIM: 186745 MGI: 1099832 HomoloGene: 21267 GeneCards: TLN1
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of cytoskeleton • actin filament binding • LIM domain binding • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • vinculin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • actin binding • cadherin binding • phosphatidylserine binding • phosphatidylinositol binding Клітинна компонента • Цитоскелет • cell projection • ruffle membrane • ruffle • гіалоплазма • екзосома • мембрана • cell surface • cell-cell junction • Міжклітинні контакти • focal adhesion • extracellular region • цитоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • cell-substrate junction assembly • IRE1-mediated unfolded protein response • м'язове скорочення • platelet degranulation • platelet aggregation • cell-cell junction assembly • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization • адгезія клітин • GO:0022415 viral process • integrin-mediated signaling pathway • integrin activation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7094	21894
Ensembl	ENSG00000137076	ENSMUSG00000028465
UniProt	Q9Y490	P26039
RefSeq (мРНК)	NM_006289	NM_011602
RefSeq (білок)	NP_006280	NP_035732
Локус (UCSC)	Хр. 9: 35.7 – 35.73 Mb	Хр. 4: 43.53 – 43.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Талін-1 (англ. Talin 1) – білок, який кодується геном TLN1, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 541 амінокислот, а молекулярна маса — 269 767.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVALSLKISI		GNVVKTMQFE		PSTMVYDACR		IIRERIPEAP		AGPPSDFGLF
LSDDDPKKGI		WLEAGKALDY		YMLRNGDTME		YRKKQRPLKI		RMLDGTVKTI
MVDDSKTVTD		MLMTICARIG		ITNHDEYSLV		RELMEEKKEE		ITGTLRKDKT
LLRDEKKMEK		LKQKLHTDDE		LNWLDHGRTL		REQGVEEHET		LLLRRKFFYS
DQNVDSRDPV		QLNLLYVQAR		DDILNGSHPV		SFDKACEFAG		FQCQIQFGPH
NEQKHKAGFL		DLKDFLPKEY		VKQKGERKIF		QAHKNCGQMS		EIEAKVRYVK
LARSLKTYGV		SFFLVKEKMK		GKNKLVPRLL		GITKECVMRV		DEKTKEVIQE
WNLTNIKRWA		ASPKSFTLDF		GDYQDGYYSV		QTTEGEQIAQ		LIAGYIDIIL
KKKKSKDHFG		LEGDEESTML		EDSVSPKKST		VLQQQYNRVG		KVEHGSVALP
AIMRSGASGP		ENFQVGSMPP		AQQQITSGQM		HRGHMPPLTS		AQQALTGTIN
SSMQAVQAAQ		ATLDDFDTLP		PLGQDAASKA		WRKNKMDESK		HEIHSQVDAI
TAGTASVVNL		TAGDPAETDY		TAVGCAVTTI		SSNLTEMSRG		VKLLAALLED
EGGSGRPLLQ		AAKGLAGAVS		ELLRSAQPAS		AEPRQNLLQA		AGNVGQASGE
LLQQIGESDT		DPHFQDALMQ		LAKAVASAAA		ALVLKAKSVA		QRTEDSGLQT
QVIAAATQCA		LSTSQLVACT		KVVAPTISSP		VCQEQLVEAG		RLVAKAVEGC
VSASQAATED		GQLLRGVGAA		ATAVTQALNE		LLQHVKAHAT		GAGPAGRYDQ
ATDTILTVTE		NIFSSMGDAG		EMVRQARILA		QATSDLVNAI		KADAEGESDL
ENSRKLLSAA		KILADATAKM		VEAAKGAAAH		PDSEEQQQRL		REAAEGLRMA
TNAAAQNAIK		KKLVQRLEHA		AKQAAASATQ		TIAAAQHAAS		TPKASAGPQP
LLVQSCKAVA		EQIPLLVQGV		RGSQAQPDSP		SAQLALIAAS		QSFLQPGGKM
VAAAKASVPT		IQDQASAMQL		SQCAKNLGTA		LAELRTAAQK		AQEACGPLEM
DSALSVVQNL		EKDLQEVKAA		ARDGKLKPLP		GETMEKCTQD		LGNSTKAVSS
AIAQLLGEVA		QGNENYAGIA		ARDVAGGLRS		LAQAARGVAA		LTSDPAVQAI
VLDTASDVLD		KASSLIEEAK		KAAGHPGDPE		SQQRLAQVAK		AVTQALNRCV
SCLPGQRDVD		NALRAVGDAS		KRLLSDSLPP		STGTFQEAQS		RLNEAAAGLN
QAATELVQAS		RGTPQDLARA		SGRFGQDFST		FLEAGVEMAG		QAPSQEDRAQ
VVSNLKGISM		SSSKLLLAAK		ALSTDPAAPN		LKSQLAAAAR		AVTDSINQLI
TMCTQQAPGQ		KECDNALREL		ETVRELLENP		VQPINDMSYF		GCLDSVMENS
KVLGEAMTGI		SQNAKNGNLP		EFGDAISTAS		KALCGFTEAA		AQAAYLVGVS
DPNSQAGQQG		LVEPTQFARA		NQAIQMACQS		LGEPGCTQAQ		VLSAATIVAK
HTSALCNSCR		LASARTTNPT		AKRQFVQSAK		EVANSTANLV		KTIKALDGAF
TEENRAQCRA		ATAPLLEAVD		NLSAFASNPE		FSSIPAQISP		EGRAAMEPIV
ISAKTMLESA		GGLIQTARAL		AVNPRDPPSW		SVLAGHSRTV		SDSIKKLITS
MRDKAPGQLE		CETAIAALNS		CLRDLDQASL		AAVSQQLAPR		EGISQEALHT
QMLTAVQEIS		HLIEPLANAA		RAEASQLGHK		VSQMAQYFEP		LTLAAVGAAS
KTLSHPQQMA		LLDQTKTLAE		SALQLLYTAK		EAGGNPKQAA		HTQEALEEAV
QMMTEAVEDL		TTTLNEAASA		AGVVGGMVDS		ITQAINQLDE		GPMGEPEGSF
VDYQTTMVRT		AKAIAVTVQE		MVTKSNTSPE		ELGPLANQLT		SDYGRLASEA
KPAAVAAENE		EIGSHIKHRV		QELGHGCAAL		VTKAGALQCS		PSDAYTKKEL
IECARRVSEK		VSHVLAALQA		GNRGTQACIT		AASAVSGIIA		DLDTTIMFAT
AGTLNREGTE		TFADHREGIL		KTAKVLVEDT		KVLVQNAAGS		QEKLAQAAQS
SVATITRLAD		VVKLGAASLG		AEDPETQVVL		INAVKDVAKA		LGDLISATKA
AAGKVGDDPA		VWQLKNSAKV		MVTNVTSLLK		TVKAVEDEAT		KGTRALEATT
EHIRQELAVF		CSPEPPAKTS		TPEDFIRMTK		GITMATAKAV		AAGNSCRQED
VIATANLSRR		AIADMLRACK		EAAYHPEVAP		DVRLRALHYG		RECANGYLEL
LDHVLLTLQK		PSPELKQQLT		GHSKRVAGSV		TELIQAAEAM		KGTEWVDPED
PTVIAENELL		GAAAAIEAAA		KKLEQLKPRA		KPKEADESLN		FEEQILEAAK
SIAAATSALV		KAASAAQREL		VAQGKVGAIP		ANALDDGQWS		QGLISAARMV
AAATNNLCEA		ANAAVQGHAS		QEKLISSAKQ		VAASTAQLLV		ACKVKADQDS
EAMKRLQAAG		NAVKRASDNL		VKAAQKAAAF		EEQENETVVV		KEKMVGGIAQ
IIAAQEEMLR		KERELEEARK		KLAQIRQQQY		KFLPSELRDE		H

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• Ben-Yosef T., Francomano C.A. (1999). Characterization of the human talin (TLN) gene: genomic structure, chromosomal localization, and expression pattern. Genomics. 62: 316—319. PMID 10610730 DOI:10.1006/geno.1999.6019
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Luo G., Herrera A.H., Horowits R. (1999). Molecular interactions of N-RAP, a nebulin-related protein of striated muscle myotendon junctions and intercalated disks. Biochemistry. 38: 6135—6143. PMID 10320340 DOI:10.1021/bi982395t
• Ling K., Doughman R.L., Firestone A.J., Bunce M.W., Anderson R.A. (2002). Type I gamma phosphatidylinositol phosphate kinase targets and regulates focal adhesions. Nature. 420: 89—93. PMID 12422220 DOI:10.1038/nature01082
• Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Identification of a repeated domain within mammalian alpha-synemin that interacts directly with talin. Exp. Cell Res. 314: 1839—1849. PMID 18342854 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.01.034
• Izard T., Vonrhein C. (2004). Structural basis for amplifying vinculin activation by talin. J. Biol. Chem. 279: 27667—27678. PMID 15070891 DOI:10.1074/jbc.M403076200

Див. також

• Хромосома 9