Франсуа М'Пеле народився у Браззавілі. Розпочав виступи на футбольних полях у місцевій команді «Стандарт» у 1966 році, у 1969 році перейшов до іншої столичної команди «Інтерклуб». У цьому ж році М'Пеле перебрався до Франції, де розпочав виступи в корсиканському клубі «Аяччо», де відразу став одним із кращих бомбардирів команди, відзначаючись у середньому більш ніж 10 забитими м'ячами за сезон. Щоправда, за підсумками сезону 1972—1973 років «Аяччо» вибув з Ліги 1, і М'Пеле продовжив виступи в корсиканському клубі вже в другому французькому дивізіоні. Протягом сезону конголезький нападник перейшов до складу іншого клубу другого дивізіону «Парі Сен-Жермен», з яким здобув путівку до найвищого французького дивізіону. У складі паризького клубу М'Пеле також був одним із кращих бомбардирів команди, загалом до 1979 року відзначився 67 голами в 177 матчах чемпіонату. У 1979 році футболіст перейшов до складу іншого клубу найвищого французького дивізіону «Ланс», у якому грав до 1981 року. Завершив виступи на футбольних полях М'Пеле у складі клубу другого французького дивізіону «Ренн», у складі якого провів сезон 1981—1982 років.