-omik
Оміка, -omik (грец . -ομική, жіночий рід; англ. -omics) — це суфікс, який використовується для позначення оміксних технологій — галузей сучасної молекулярної біології та біоінформатики, які займаються аналізом сукупностей подібних окремих елементів — геном, транскриптом, епігеном, епітранскриптом, протеом, метаболом, мета-геном, мета-транскриптом, інтерактом, ліпідом та інші. Інтеграцією цих данних займається мультиоміка[1].
Наприклад, протеоміка має справу, наприклад, з протеомом (англ. proteome) - сукупністю всіх білків, які присутні в клітині, групі клітин, органі чи організмі в певний момент часу. Існує також веб-сайт для картографування протеома — Human Protein Atlas. За аналогією сукупність генів організму називається геномом, а предметна область його дослідження відповідає геноміці.
Деякі з найпоширеніших термінів наведено в таблиці. Однак зараз існує велика кількість інших термінотворів, які майже не потрапили до словникового запасу. Наприклад: Інтерактом-Інтерактомік, Психіом-Психіомік.
Пару термінів топоном-топономіка іноді зараховують до -омік. Це неправильно, тому що тут склад «-ном» утворений від грецького іменника Nomos.
Типи даних[ред. | ред. код]
Основні статті — Біоінформатика, Мультиоміка.
| Сфера знань | Сукупність | Окремий елемент |
|---|---|---|
| епігеноміка | епігеном | Комплекс різних даних: сайти метилювання ДНК, модифікації гістонів, ремоделювання хроматину, некодуючі РНК |
| геноміка | геном | ген |
| транскриптоміка | транскриптом | транскрипт ( мРНК ) |
| протеоміка | протеом | білок |
| ліпідоміка | ліпідом | ліпід |
| глікоміка | глікан | полісахариди |
| метаболоміка | метаболом | метаболіт (продукт метаболізму) |
| інтерактоміка | інтерактом | взаємодія молекул |
| систеоміка[джерело?] | структура впливу | ланка передачі |
| флюксоміка | флюксом | каталізовані перетворення речовини та їх швидкість |
| сенсоміка | сенсометаболом | запах і смак |
| мікробіоміка: метагеноміка, метапротеоміка і т.д. | дані геноміки, протеоміки та інших оміксних технологій в певних екосистемах (таких як певний мікробіом, як-от мікробіота кишківника) | |
| мультиоміка | мультиом, паном | Інтеграція даних всіх (або деяких) даних оміксних технологій разом |
Див. також[ред. | ред. код]
- Мультиоміка
- Молекулярна біологія
- Біоінформатика
- Системна біологія
- Обчислювальна біологія
- Великі дані
Додаткова література[ред. | ред. код]
Журнали[ред. | ред. код]
- OMICS: A Journal of Integrative Biology (Mary Ann Liebert Inc)
- Molecular Omics (Royal Society of Chemistry)
Примітки[ред. | ред. код]
- ↑ Babu, Mohan; Snyder, Michael (2023-06). Multi-Omics Profiling for Health. Molecular & Cellular Proteomics. Т. 22, № 6. с. 100561. doi:10.1016/j.mcpro.2023.100561. ISSN 1535-9476. PMC 10220275. PMID 37119971. Процитовано 13 жовтня 2023.
{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)