ABCC1

ABCC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CBZ, 4C3Z
Ідентифікатори
Символи	ABCC1, ABC29, ABCC, GS-X, MRP, MRP1, ATP binding cassette subfamily C member 1, DFNA77
Зовнішні ІД	OMIM: 158343 MGI: 102676 HomoloGene: 133779 GeneCards: ABCC1
Онтологія гена Молекулярна функція • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • nucleotide binding • ATPase activity • hydrolase activity • ATP binding • transporter activity • ATPase-coupled inorganic anion transmembrane transporter activity • GO:0102023, GO:0015235 ABC-type vitamin B12 transporter activity • ABC-type xenobiotic transporter activity • ABC-type glutathione S-conjugate transporter activity • glutathione transmembrane transporter activity • GO:0004012 ATPase-coupled intramembrane lipid transporter activity • sphingolipid floppase activity • GO:0022891 transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • basolateral plasma membrane • мембрана • екзосома • integral component of plasma membrane • vacuolar membrane Біологічний процес • cobalamin metabolic process • leukotriene metabolic process • трансмембранний транспорт • cobalamin transport • vitamin transmembrane transport • xenobiotic transmembrane transport • glutathione transmembrane transport • xenobiotic transport • GO:0015915 транспорт • phospholipid translocation • cell chemotaxis • sphingolipid translocation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4363	17250
Ensembl	ENSG00000278183 ENSG00000103222	ENSMUSG00000023088
UniProt	P33527	O35379
RefSeq (мРНК)	NM_004996 NM_019862 NM_019898 NM_019899 NM_019900 NM_019901 NM_019902	NM_008576
RefSeq (білок)	NP_004987	NP_032602
Локус (UCSC)	Хр. 16: 15.95 – 16.14 Mb	Хр. 16: 14.18 – 14.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ABCC1 (англ. ATP binding cassette subfamily C member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 531 амінокислот, а молекулярна маса — 171 591.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALRGFCSAD		GSDPLWDWNV		TWNTSNPDFT		KCFQNTVLVW		VPCFYLWACF
PFYFLYLSRH		DRGYIQMTPL		NKTKTALGFL		LWIVCWADLF		YSFWERSRGI
FLAPVFLVSP		TLLGITMLLA		TFLIQLERRK		GVQSSGIMLT		FWLVALVCAL
AILRSKIMTA		LKEDAQVDLF		RDITFYVYFS		LLLIQLVLSC		FSDRSPLFSE
TIHDPNPCPE		SSASFLSRIT		FWWITGLIVR		GYRQPLEGSD		LWSLNKEDTS
EQVVPVLVKN		WKKECAKTRK		QPVKVVYSSK		DPAQPKESSK		VDANEEVEAL
IVKSPQKEWN		PSLFKVLYKT		FGPYFLMSFF		FKAIHDLMMF		SGPQILKLLI
KFVNDTKAPD		WQGYFYTVLL		FVTACLQTLV		LHQYFHICFV		SGMRIKTAVI
GAVYRKALVI		TNSARKSSTV		GEIVNLMSVD		AQRFMDLATY		INMIWSAPLQ
VILALYLLWL		NLGPSVLAGV		AVMVLMVPVN		AVMAMKTKTY		QVAHMKSKDN
RIKLMNEILN		GIKVLKLYAW		ELAFKDKVLA		IRQEELKVLK		KSAYLSAVGT
FTWVCTPFLV		ALCTFAVYVT		IDENNILDAQ		TAFVSLALFN		ILRFPLNILP
MVISSIVQAS		VSLKRLRIFL		SHEELEPDSI		ERRPVKDGGG		TNSITVRNAT
FTWARSDPPT		LNGITFSIPE		GALVAVVGQV		GCGKSSLLSA		LLAEMDKVEG
HVAIKGSVAY		VPQQAWIQND		SLRENILFGC		QLEEPYYRSV		IQACALLPDL
EILPSGDRTE		IGEKGVNLSG		GQKQRVSLAR		AVYSNADIYL		FDDPLSAVDA
HVGKHIFENV		IGPKGMLKNK		TRILVTHSMS		YLPQVDVIIV		MSGGKISEMG
SYQELLARDG		AFAEFLRTYA		STEQEQDAEE		NGVTGVSGPG		KEAKQMENGM
LVTDSAGKQL		QRQLSSSSSY		SGDISRHHNS		TAELQKAEAK		KEETWKLMEA
DKAQTGQVKL		SVYWDYMKAI		GLFISFLSIF		LFMCNHVSAL		ASNYWLSLWT
DDPIVNGTQE		HTKVRLSVYG		ALGISQGIAV		FGYSMAVSIG		GILASRCLHV
DLLHSILRSP		MSFFERTPSG		NLVNRFSKEL		DTVDSMIPEV		IKMFMGSLFN
VIGACIVILL		ATPIAAIIIP		PLGLIYFFVQ		RFYVASSRQL		KRLESVSRSP
VYSHFNETLL		GVSVIRAFEE		QERFIHQSDL		KVDENQKAYY		PSIVANRWLA
VRLECVGNCI		VLFAALFAVI		SRHSLSAGLV		GLSVSYSLQV		TTYLNWLVRM
SSEMETNIVA		VERLKEYSET		EKEAPWQIQE		TAPPSSWPQV		GRVEFRNYCL
RYREDLDFVL		RHINVTINGG		EKVGIVGRTG		AGKSSLTLGL		FRINESAEGE
IIIDGINIAK		IGLHDLRFKI		TIIPQDPVLF		SGSLRMNLDP		FSQYSDEEVW
TSLELAHLKD		FVSALPDKLD		HECAEGGENL		SVGQRQLVCL		ARALLRKTKI
LVLDEATAAV		DLETDDLIQS		TIRTQFEDCT		VLTIAHRLNT		IMDYTRVIVL
DKGEIQEYGA		PSDLLQQRGL		FYSMAKDAGL		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Cole S.P.C., Deeley R.G. (1993). Multidrug resistance-associated protein: sequence correction. Science. 260: 879—879. PMID 8098549 DOI:10.1126/science.8098549
• Grant C.E., Kurz E.U., Cole S.P.C., Deeley R.G. (1997). Analysis of the intron-exon organization of the human multidrug-resistance protein gene (MRP) and alternative splicing of its mRNA. Genomics. 45: 368—378. PMID 9344662 DOI:10.1006/geno.1997.4950
• Kast C., Gros P. (1997). Topology mapping of the amino-terminal half of multidrug resistance-associated protein by epitope insertion and immunofluorescence. J. Biol. Chem. 272: 26479—26487. PMID 9334225 DOI:10.1074/jbc.272.42.26479
• Kast C., Gros P. (1998). Epitope insertion favors a six transmembrane domain model for the carboxy-terminal portion of the multidrug resistance-associated protein. Biochemistry. 37: 2305—2313. PMID 9485377 DOI:10.1021/bi972332v
• Cui L., Hou Y.-X., Riordan J.R., Chang X.-B. (2001). Mutations of the Walker B motif in the first nucleotide binding domain of multidrug resistance protein MRP1 prevent conformational maturation. Arch. Biochem. Biophys. 392: 153—161. PMID 11469806 DOI:10.1006/abbi.2001.2441
• Ito K., Olsen S.L., Qiu W., Deeley R.G., Cole S.P.C. (2001). Mutation of a single conserved tryptophan in multidrug resistance protein 1 (MRP1/ABCC1) results in loss of drug resistance and selective loss of organic anion transport. J. Biol. Chem. 276: 15616—15624. PMID 11278867 DOI:10.1074/jbc.M011246200

Див. також

• Хромосома 16