ADAMTS18

ADAMTS18
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS18, ADAMTS21, KNO2, MMCAT, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18
Зовнішні ІД	OMIM: 607512 MGI: 2442600 HomoloGene: 65241 GeneCards: ADAMTS18
Пов'язані генетичні захворювання
microcornea-myopic chorioretinal atrophy-telecanthus syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • extracellular region Біологічний процес • розвиток ока • negative regulation of platelet aggregation • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	170692	208936
Ensembl	ENSG00000140873	ENSMUSG00000053399
UniProt	Q8TE60	Q4VC17
RefSeq (мРНК)	NM_139054 NM_199355 NM_001326358	NM_172466
RefSeq (білок)	NP_001313287 NP_955387	NP_766054 NP_001390851 NP_001390852 NP_001390853
Локус (UCSC)	Хр. 16: 77.25 – 77.44 Mb	Хр. 8: 114.42 – 114.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS18 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 221 амінокислот, а молекулярна маса — 135 167.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MECALLLACA		FPAAGSGPPR		GLAGLGRVAK		ALQLCCLCCA		SVAAALASDS
SSGASGLNDD		YVFVTPVEVD		SAGSYISHDI		LHNGRKKRSA		QNARSSLHYR
FSAFGQELHL		ELKPSAILSS		HFIVQVLGKD		GASETQKPEV		QQCFYQGFIR
NDSSSSVAVS		TCAGLSGLIR		TRKNEFLISP		LPQLLAQEHN		YSSPAGHHPH
VLYKRTAEEK		IQRYRGYPGS		GRNYPGYSPS		HIPHASQSRE		TEYHHRRLQK
QHFCGRRKKY		APKPPTEDTY		LRFDEYGSSG		RPRRSAGKSQ		KGLNVETLVV
ADKKMVEKHG		KGNVTTYILT		VMNMVSGLFK		DGTIGSDINV		VVVSLILLEQ
EPGGLLINHH		ADQSLNSFCQ		WQSALIGKNG		KRHDHAILLT		GFDICSWKNE
PCDTLGFAPI		SGMCSKYRSC		TINEDTGLGL		AFTIAHESGH		NFGMIHDGEG
NPCRKAEGNI		MSPTLTGNNG		VFSWSSCSRQ		YLKKFLSTPQ		AGCLVDEPKQ
AGQYKYPDKL		PGQIYDADTQ		CKWQFGAKAK		LCSLGFVKDI		CKSLWCHRVG
HRCETKFMPA		AEGTVCGLSM		WCRQGQCVKF		GELGPRPIHG		QWSAWSKWSE
CSRTCGGGVK		FQERHCNNPK		PQYGGLFCPG		SSRIYQLCNI		NPCNENSLDF
RAQQCAEYNS		KPFRGWFYQW		KPYTKVEEED		RCKLYCKAEN		FEFFFAMSGK
VKDGTPCSPN		KNDVCIDGVC		ELVGCDHELG		SKAVSDACGV		CKGDNSTCKF
YKGLYLNQHK		ANEYYPVVLI		PAGARSIEIQ		ELQVSSSYLA		VRSLSQKYYL
TGGWSIDWPG		EFPFAGTTFE		YQRSFNRPER		LYAPGPTNET		LVFEILMQGK
NPGIAWKYAL		PKVMNGTPPA		TKRPAYTWSI		VQSECSVSCG		GGYINVKAIC
LRDQNTQVNS		SFCSAKTKPV		TEPKICNAFS		CPAYWMPGEW		STCSKACAGG
QQSRKIQCVQ		KKPFQKEEAV		LHSLCPVSTP		TQVQACNSHA		CPPQWSLGPW
SQCSKTCGRG		VRKRELLCKG		SAAETLPESQ		CTSLPRPELQ		EGCVLGRCPK
NSRLQWVASS		WSECSATCGL		GVRKREMKCS		EKGFQGKLIT		FPERRCRNIK
KPNLDLEETC		NRRACPAHPV		YNMVAGWYSL		PWQQCTVTCG		GGVQTRSVHC
VQQGRPSSSC		LLHQKPPVLR		ACNTNFCPAP		EKREDPSCVD		FFNWCHLVPQ
HGVCNHKFYG		KQCCKSCTRK		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16