ALCAM

ALCAM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A2F
Ідентифікатори
Символи	ALCAM, CD166, MEMD, activated leukocyte cell adhesion molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 601662 MGI: 1313266 HomoloGene: 1229 GeneCards: ALCAM
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cell projection • мембрана • focal adhesion • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex • extracellular region • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • immunological synapse • екзосома • external side of plasma membrane Біологічний процес • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • neuron projection extension • адгезія клітин • motor neuron axon guidance • axon extension involved in axon guidance • GO:0072468 сигнальна трансдукція • retinal ganglion cell axon guidance • axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	214	11658
Ensembl	ENSG00000170017	ENSMUSG00000022636
UniProt	Q13740	Q61490
RefSeq (мРНК)	NM_001627 NM_001243280 NM_001243281 NM_001243283	NM_009655 NM_001331110
RefSeq (білок)	NP_001230209 NP_001230210 NP_001230212 NP_001618	NP_001318039 NP_033785
Локус (UCSC)	Хр. 3: 105.37 – 105.58 Mb	Хр. 16: 52.07 – 52.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ALCAM (англ. Activated leukocyte cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 65 102.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESKGASSCR		LLFCLLISAT		VFRPGLGWYT		VNSAYGDTII		IPCRLDVPQN
LMFGKWKYEK		PDGSPVFIAF		RSSTKKSVQY		DDVPEYKDRL		NLSENYTLSI
SNARISDEKR		FVCMLVTEDN		VFEAPTIVKV		FKQPSKPEIV		SKALFLETEQ
LKKLGDCISE		DSYPDGNITW		YRNGKVLHPL		EGAVVIIFKK		EMDPVTQLYT
MTSTLEYKTT		KADIQMPFTC		SVTYYGPSGQ		KTIHSEQAVF		DIYYPTEQVT
IQVLPPKNAI		KEGDNITLKC		LGNGNPPPEE		FLFYLPGQPE		GIRSSNTYTL
TDVRRNATGD		YKCSLIDKKS		MIASTAITVH		YLDLSLNPSG		EVTRQIGDAL
PVSCTISASR		NATVVWMKDN		IRLRSSPSFS		SLHYQDAGNY		VCETALQEVE
GLKKRESLTL		IVEGKPQIKM		TKKTDPSGLS		KTIICHVEGF		PKPAIQWTIT
GSGSVINQTE		ESPYINGRYY		SKIIISPEEN		VTLTCTAENQ		LERTVNSLNV
SAISIPEHDE		ADEISDENRE		KVNDQAKLIV		GIVVGLLLAA		LVAGVVYWLY
MKKSKTASKH		VNKDLGNMEE		NKKLEENNHK		TEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

• Ikeda K., Quertermous T. (2004). Molecular isolation and characterization of a soluble isoform of activated leukocyte cell adhesion molecule that modulates endothelial cell function. J. Biol. Chem. 279: 55315—55323. PMID 15496415 DOI:10.1074/jbc.M407776200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Skonier J.E., Bowen M.A., Emswiler J., Aruffo A., Bajorath J. (1996). Recognition of diverse proteins by members of the immunoglobulin superfamily: delineation of the receptor binding site in the human CD6 ligand ALCAM. Biochemistry. 35: 12287—12291. PMID 8823162 DOI:10.1021/bi961038k
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
• Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
• Bajorath J., Bowen M.A., Aruffo A. (1995). Molecular model of the N-terminal receptor-binding domain of the human CD6 ligand ALCAM. Protein Sci. 4: 1644—1647. PMID 8520490 DOI:10.1002/pro.5560040822

Див. також

• Хромосома 3