AMIGO1

AMIGO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XOT
Ідентифікатори
Символи	AMIGO1, ALI2, AMIGO, AMIGO-1, adhesion molecule with Ig-like domain 1, adhesion molecule with Ig like domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615689 MGI: 2653612 HomoloGene: 46421 GeneCards: AMIGO1
Онтологія гена Молекулярна функція • potassium channel regulator activity Клітинна компонента • integral component of membrane • перикаріон • cell projection • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • neuronal cell body membrane • аксон • дендрит (нейробіологія) • neuronal cell body • pericellular basket Біологічний процес • диференціація клітин • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • аксоноґенеза • positive regulation of axonogenesis • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • адгезія клітин • positive regulation of potassium ion transmembrane transport • myelination • axonal fasciculation • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of synapse assembly • brain development • positive regulation of neuron projection development • neuron projection fasciculation • positive regulation of voltage-gated potassium channel activity • cellular response to L-glutamate Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57463	229715
Ensembl	ENSG00000181754	ENSMUSG00000050947
UniProt	Q86WK6	Q80ZD8
RefSeq (мРНК)	NM_020703	NM_001004293 NM_001287093 NM_146137
RefSeq (білок)	NP_065754	NP_001004293 NP_001274022 NP_666249
Локус (UCSC)	Хр. 1: 109.5 – 109.51 Mb	Хр. 3: 108.09 – 108.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AMIGO1 (англ. Adhesion molecule with Ig like domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 55 239.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHPHRDPRGL		WLLLPSLSLL		LFEVARAGRA		VVSCPAACLC		ASNILSCSKQ
QLPNVPHSLP		SYTALLDLSH		NNLSRLRAEW		TPTRLTQLHS		LLLSHNHLNF
ISSEAFSPVP		NLRYLDLSSN		QLRTLDEFLF		SDLQVLEVLL		LYNNHIMAVD
RCAFDDMAQL		QKLYLSQNQI		SRFPLELVKE		GAKLPKLTLL		DLSSNKLKNL
PLPDLQKLPA		WIKNGLYLHN		NPLNCDCELY		QLFSHWQYRQ		LSSVMDFQED
LYCMNSKKLH		NVFNLSFLNC		GEYKERAWEA		HLGDTLIIKC		DTKQQGMTKV
WVTPSNERVL		DEVTNGTVSV		SKDGSLLFQQ		VQVEDGGVYT		CYAMGETFNE
TLSVELKVHN		FTLHGHHDTL		NTAYTTLVGC		ILSVVLVLIY		LYLTPCRCWC
RGVEKPSSHQ		GDSLSSSMLS		TTPNHDPMAG		GDKDDGFDRR		VAFLEPAGPG
QGQNGKLKPG		NTLPVPEATG		KGQRRMSDPE		SVSSVFSDTP		IVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Kuja-Panula J., Kiiltomaeki M., Yamashiro T., Rouhiainen A., Rauvala H. (2003). AMIGO, a transmembrane protein implicated in axon tract development, defines a novel protein family with leucine-rich repeats. J. Cell Biol. 160: 963—973. PMID 12629050 DOI:10.1083/jcb.200209074
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1