ANKRD17

ANKRD17
Ідентифікатори
Символи	ANKRD17, GTAR, NY-BR-16, MASK2, ankyrin repeat domain 17, CAGS
Зовнішні ІД	OMIM: 615929 MGI: 1932101 HomoloGene: 82403 GeneCards: ANKRD17
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Хроматин • мембрана • клітинне ядро • Ядерна мембрана Біологічний процес • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of cell cycle • positive regulation of RIG-I signaling pathway • defense response to bacterium • positive regulation of MDA-5 signaling pathway • negative regulation of smooth muscle cell differentiation • regulation of DNA replication • процес імунної системи • blood vessel maturation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26057	81702
Ensembl	ENSG00000132466	ENSMUSG00000055204
UniProt	O75179	Q99NH0
RefSeq (мРНК)	NM_001286771 NM_032217 NM_198889 NM_015574	NM_030886 NM_198010 NM_001401341
RefSeq (білок)	NP_001273700 NP_056389 NP_115593 NP_942592	NP_112148 NP_932127 NP_001388270
Локус (UCSC)	Хр. 4: 73.07 – 73.26 Mb	Хр. 5: 90.38 – 90.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ANKRD17 (англ. Ankyrin repeat domain 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 603 амінокислот, а молекулярна маса — 274 258.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEKATVPVAA		ATAAEGEGSP		PAVAAVAGPP		AAAEVGGGVG		GSSRARSASS
PRGMVRVCDL		LLKKKPPQQQ		HHKAKRNRTC		RPPSSSESSS		DSDNSGGGGG
GGGGGGGGGG		TSSNNSEEEE		DDDDEEEEVS		EVESFILDQD		DLENPMLETA
SKLLLSGTAD		GADLRTVDPE		TQARLEALLE		AAGIGKLSTA		DGKAFADPEV
LRRLTSSVSC		ALDEAAAALT		RMRAESTANA		GQSDNRSLAE		ACSEGDVNAV
RKLLIEGRSV		NEHTEEGESL		LCLACSAGYY		ELAQVLLAMH		ANVEDRGIKG
DITPLMAAAN		GGHVKIVKLL		LAHKADVNAQ		SSTGNTALTY		ACAGGYVDVV
KVLLESGASI		EDHNENGHTP		LMEAGSAGHV		EVARLLLENG		AGINTHSNEF
KESALTLACY		KGHLEMVRFL		LEAGADQEHK		TDEMHTALME		ACMDGHVEVA
RLLLDSGAQV		NMPADSFESP		LTLAACGGHV		ELAALLIERG		ASLEEVNDEG
YTPLMEAARE		GHEEMVALLL		GQGANINAQT		EETQETALTL		ACCGGFLEVA
DFLIKAGADI		ELGCSTPLME		AAQEGHLELV		KYLLAAGANV		HATTATGDTA
LTYACENGHT		DVADVLLQAG		ADLEHESEGG		RTPLMKAARA		GHVCTVQFLI
SKGANVNRTT		ANNDHTVLSL		ACAGGHLAVV		ELLLAHGADP		THRLKDGSTM
LIEAAKGGHT		SVVCYLLDYP		NNLLSAPPPD		VTQLTPPSHD		LNRAPRVPVQ
ALPMVVPPQE		PDKPPANVAT		TLPIRNKAAS		KQKSSSHLPA		NSQDVQGYIT
NQSPESIVEE		AQGKLTELEQ		RIKEAIEKNA		QLQSLELAHA		DQLTKEKIEE
LNKTREEQIQ		KKQKILEELQ		KVERELQLKT		QQQLKKQYLE		VKAQRIQLQQ
QQQQSCQHLG		LLTPVGVGEQ		LSEGDYARLQ		QVDPVLLKDE		PQQTAAQMGF
APIQPLAMPQ		ALPLAAGPLP		PGSIANLTEL		QGVIVGQPVL		GQAQLAGLGQ
GILTETQQGL		MVASPAQTLN		DTLDDIMAAV		SGRASAMSNT		PTHSIAASIS
QPQTPTPSPI		ISPSAMLPIY		PAIDIDAQTE		SNHDTALTLA		CAGGHEELVQ
TLLERGASIE		HRDKKGFTPL		ILAATAGHVG		VVEILLDNGA		DIEAQSERTK
DTPLSLACSG		GRQEVVELLL		ARGANKEHRN		VSDYTPLSLA		ASGGYVNIIK
ILLNAGAEIN		SRTGSKLGIS		PLMLAAMNGH		TAAVKLLLDM		GSDINAQIET
NRNTALTLAC		FQGRTEVVSL		LLDRKANVEH		RAKTGLTPLM		EAASGGYAEV
GRVLLDKGAD		VNAPPVPSSR		DTALTIAADK		GHYKFCELLI		GRGAHIDVRN
KKGNTPLWLA		ANGGHLDVVQ		LLVQAGADVD		AADNRKITPL		MAAFRKGHVK
VVRYLVKEVN		QFPSDSECMR		YIATITDKEM		LKKCHLCMES		IVQAKDRQAA
EANKNASILL		EELDLEKLRE		ESRRLALAAK		REKRKEKRRK		KKEEQRRKLE
EIEAKNKENF		ELQAAQEKEK		LKVEDEPEVL		TEPPSATTTT		TIGISATWTT
LAGSHGKRNN		TITTTSSKRK		NRKNKITPEN		VQIIFDDPLP		ISYSQPEKVN
GESKSSSTSE		SGDSDNMRIS		SCSDESSNSN		SSRKSDNHSP		AVVTTTVSSK
KQPSVLVTFP		KEERKSVSGK		ASIKLSETIS		EGTSNSLSTC		TKSGPSPLSS
PNGKLTVASP		KRGQKREEGW		KEVVRRSKKV		SVPSTVISRV		IGRGGCNINA
IREFTGAHID		IDKQKDKTGD		RIITIRGGTE		STRQATQLIN		ALIKDPDKEI
DELIPKNRLK		SSSANSKIGS		SAPTTTAANT		SLMGIKMTTV		ALSSTSQTAT
ALTVPAISSA		STHKTIKNPV		NNVRPGFPVS		LPLAYPPPQF		AHALLAAQTF
QQIRPPRLPM		THFGGTFPPA		QSTWGPFPVR		PLSPARATNS		PKPHMVPRHS
NQNSSGSQVN		SAGSLTSSPT		TTTSSSASTV		PGTSTNGSPS		SPSVRRQLFV
TVVKTSNATT		TTVTTTASNN		NTAPTNATYP		MPTAKEHYPV		SSPSSPSPPA
QPGGVSRNSP		LDCGSASPNK		VASSSEQEAG		SPPVVETTNT		RPPNSSSSSG
SSSAHSNQQQ		PPGSVSQEPR		PPLQQSQVPP		PEVRMTVPPL		ATSSAPVAVP
STAPVTYPMP		QTPMGCPQPT		PKMETPAIRP		PPHGTTAPHK		NSASVQNSSV
AVLSVNHIKR		PHSVPSSVQL		PSTLSTQSAC		QNSVHPANKP		IAPNFSAPLP
FGPFSTLFEN		SPTSAHAFWG		GSVVSSQSTP		ESMLSGKSSY		LPNSDPLHQS
DTSKAPGFRP		PLQRPAPSPS		GIVNMDSPYG		SVTPSSTHLG		NFASNISGGQ
MYGPGAPLGG		APAAANFNRQ		HFSPLSLLTP		CSSASNDSSA		QSVSSGVRAP
SPAPSSVPLG		SEKPSNVSQD		RKVPVPIGTE		RSARIRQTGT		SAPSVIGSNL
STSVGHSGIW		SFEGIGGNQD		KVDWCNPGMG		NPMIHRPMSD		PGVFSQHQAM
ERDSTGIVTP		SGTFHQHVPA		GYMDFPKVGG		MPFSVYGNAM		IPPVAPIPDG
AGGPIFNGPH		AADPSWNSLI		KMVSSSTENN		GPQTVWTGPW		APHMNSVHMN
QLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yeo W.M., Chow V.T.K. (2007). The VP1 structural protein of enterovirus 71 interacts with human ornithine decarboxylase and gene trap ankyrin repeat. Microb. Pathog. 42: 129—137. PMID 17276651 DOI:10.1016/j.micpath.2006.12.002
• Menning M., Kufer T.A. (2013). A role for the Ankyrin repeat containing protein Ankrd17 in Nod1- and Nod2-mediated inflammatory responses. FEBS Lett. 587: 2137—2142. PMID 23711367 DOI:10.1016/j.febslet.2013.05.037

Див. також

• Хромосома 4