ARHGAP9

ARHGAP9
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2P0D, 2P0H
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP9, 10C, RGL1, Rho GTPase activating protein 9
Зовнішні ІД	OMIM: 610576 MGI: 2143764 HomoloGene: 13041 GeneCards: ARHGAP9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • цитоплазма Біологічний процес • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • neutrophil degranulation • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64333	216445
Ensembl	ENSG00000123329	ENSMUSG00000040345
UniProt	Q9BRR9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001080156 NM_001080157 NM_032496 NM_001319850 NM_001319851 NM_001319852 NM_001367422 NM_001367423 NM_001367424 NM_001367425 NM_001367426	NM_001285785 NM_146011 NM_001359656 NM_001359657
RefSeq (білок)	NP_001073625 NP_001073626 NP_001306779 NP_001306780 NP_001306781 NP_115885 NP_001354351 NP_001354352 NP_001354353 NP_001354354 NP_001354355 NP_001306779.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 57.47 – 57.49 Mb	Хр. 10: 127.16 – 127.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP9 (англ. Rho GTPase activating protein 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 750 амінокислот, а молекулярна маса — 83 260.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSSRWWPSS		WGILGLGPRS		PPRGSQLCAL		YAFTYTGADG		QQVSLAEGDR
FLLLRKTNSD		WWLARRLEAP		STSRPIFVPA		AYMIEESIPS		QSPTTVIPGQ
LLWTPGPKLF		HGSLEELSQA		LPSRAQASSE		QPPPLPRKMC		RSVSTDNLSP
SLLKPFQEGP		SGRSLSQEDL		PSEASASTAG		PQPLMSEPPV		YCNLVDLRRC
PRSPPPGPAC		PLLQRLDAWE		QHLDPNSGRC		FYINSLTGCK		SWKPPRRSRS
ETNPGSMEGT		QTLKRNNDVL		QPQAKGFRSD		TGTPEPLDPQ		GSLSLSQRTS
QLDPPALQAP		RPLPQLLDDP		HEVEKSGLLN		MTKIAQGGRK		LRKNWGPSWV
VLTGNSLVFY		REPPPTAPSS		GWGPAGSRPE		SSVDLRGAAL		AHGRHLSSRR
NVLHIRTIPG		HEFLLQSDHE		TELRAWHRAL		RTVIERLVRW		VEARREAPTG
RDQGSGDREN		PLELRLSGSG		PAELSAGEDE		EEESELVSKP		LLRLSSRRSS
IRGPEGTEQN		RVRNKLKRLI		AKRPPLQSLQ		ERGLLRDQVF		GCQLESLCQR
EGDTVPSFLR		LCIAAVDKRG		LDVDGIYRVS		GNLAVVQKLR		FLVDRERAVT
SDGRYVFPEQ		PGQEGRLDLD		STEWDDIHVV		TGALKLFLRE		LPQPLVPPLL
LPHFRAALAL		SESEQCLSQI		QELIGSMPKP		NHDTLRYLLE		HLCRVIAHSD
KNRMTPHNLG		IVFGPTLFRP		EQETSDPAAH		ALYPGQLVQL		MLTNFTSLFP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53

Див. також

• Хромосома 12