ARHGEF10L

ARHGEF10L
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF10L, GrinchGEF, Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like
Зовнішні ІД	OMIM: 612494 MGI: 1920004 HomoloGene: 10017 GeneCards: ARHGEF10L
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of Rho protein signal transduction • SREBP signaling pathway • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of stress fiber assembly • actin cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55160	72754
Ensembl	ENSG00000074964	ENSMUSG00000040964
UniProt	Q9HCE6	A2AWP8
RefSeq (мРНК)	NM_001011722 NM_018125 NM_001319837 NM_001319838 NM_001328124	NM_001112722 NM_001112723 NM_001290803 NM_172415
RefSeq (білок)	NP_001011722 NP_001306766 NP_001306767 NP_001315053 NP_060595	NP_001106193 NP_001106194 NP_001277732 NP_766003
Локус (UCSC)	Хр. 1: 17.54 – 17.7 Mb	Хр. 4: 140.24 – 140.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGEF10L (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 279 амінокислот, а молекулярна маса — 140 409.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSNPPPQP		AIGDQLVPGV		PGPSSEAEDD		PGEAFEFDDS		DDEEDTSAAL
GVPSLAPERD		TDPPLIHLDS		IPVTDPDPAA		APPGTGVPAW		VSNGDAADAA
FSGARHSSWK		RKSSRRIDRF		TFPALEEDVI		YDDVPCESPD		AHQPGAERNL
LYEDAHRAGA		PRQAEDLGWS		SSEFESYSED		SGEEAKPEVE		VEPAKHRVSF
QPKLSPDLTR		LKERYARTKR		DILALRVGGR		DMQELKHKYD		CKMTQLMKAA
KSGTKDGLEK		TRMAVMRKVS		FLHRKDVLGD		SEEEDMGLLE		VSVSDIKPPA
PELGPMPEGL		SPQQVVRRHI		LGSIVQSEGS		YVESLKRILQ		DYRNPLMEME
PKALSARKCQ		VVFFRVKEIL		HCHSMFQIAL		SSRVAEWDST		EKIGDLFVAS
FSKSMVLDVY		SDYVNNFTSA		MSIIKKACLT		KPAFLEFLKR		RQVCSPDRVT
LYGLMVKPIQ		RFPQFILLLQ		DMLKNTPRGH		PDRLSLQLAL		TELETLAEKL
NEQKRLADQV		AEIQQLTKSV		SDRSSLNKLL		TSGQRQLLLC		ETLTETVYGD
RGQLIKSKER		RVFLLNDMLV		CANINFKPAN		HRGQLEISSL		VPLGPKYVVK
WNTALPQVQV		VEVGQDGGTY		DKDNVLIQHS		GAKKASASGQ		AQNKVYLGPP
RLFQELQDLQ		KDLAVVEQIT		LLISTLHGTY		QNLNMTVAQD		WCLALQRLMR
VKEEEIHSAN		KCRLRLLLPG		KPDKSGRPIS		FMVVFITPNP		LSKISWVNRL
HLAKIGLREE		NQPGWLCPDE		DKKSKAPFWC		PILACCIPAF		SSRALSLQLG
ALVHSPVNCP		LLGFSAVSTS		LPQGYLWVGG		GQEGAGGQVE		IFSLNRPSPR
TVKSFPLAAP		VLCMEYIPEL		EEEAESRDES		PTVADPSATV		HPTICLGLQD
GSILLYSSVD		TGTQCLVSCR		SPGLQPVLCL		RHSPFHLLAG		LQDGTLAAYP
RTSGGVLWDL		ESPPVCLTVG		PGPVRTLLSL		EDAVWASCGP		WVTVLEATTL
QPQQSFEAHQ		DEAVSVTHMV		KAGSGVWMAF		SSGTSIRLFH		TETLEHLQEI
NIATRTTFLL		PGQKHLCVTS		LLICQGLLWV		GTDQGVIVLL		PVPRLEGIPK
ITGKGMVSLN		GHCGPVAFLA		VATSILAPDI		LRSDQEEAEG		PRAEEDKPDG
QAHEPMPDSH		VGRELTRKKG		ILLQYRLRST		AHLPGPLLSM		REPAPADGAA
LEHSEEDGSI		YEMADDPDIW		VRSRPCARDA		HRKEICSVAI		ISGGQGYRNF
GSALGSSGRQ		APCGETDSTL		LIWQVPLML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Winkler S., Mohl M., Wieland T., Lutz S. (2005). GrinchGEF -- a novel Rho-specific guanine nucleotide exchange factor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 335: 1280—1286. PMID 16112081 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.08.025
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1