ATXN2L

ATXN2L
Ідентифікатори
Символи	ATXN2L, A2D, A2LG, A2LP, A2RP, ataxin 2 like
Зовнішні ІД	OMIM: 607931 MGI: 2446242 HomoloGene: 16513 GeneCards: ATXN2L
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear speck • мембрана • cytoplasmic stress granule • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • stress granule assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11273	233871
Ensembl	ENSG00000168488	ENSMUSG00000032637
UniProt	Q8WWM7	Q7TQH0
RefSeq (мРНК)	NM_001308230 NM_007245 NM_017492 NM_145714 NM_148414 NM_148415 NM_148416	NM_183020 NM_001347658 NM_001361487
RefSeq (білок)	NP_001295159 NP_009176 NP_059867 NP_663760 NP_680780 NP_680781 NP_680782	NP_001334587 NP_898841 NP_001348416
Локус (UCSC)	Хр. 16: 28.82 – 28.84 Mb	Хр. 7: 126.49 – 126.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATXN2L (англ. Ataxin 2 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 075 амінокислот, а молекулярна маса — 113 374.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKPQPLQQP		SQPQQPPPTQ		QAVARRPPGG		TSPPNGGLPG		PLATSAAPPG
PPAAASPCLG		PVAAAGSGLR		RGAEGILAPQ		PPPPQQHQER		PGAAAIGSAR
GQSTGKGPPQ		SPVFEGVYNN		SRMLHFLTAV		VGSTCDVKVK		NGTTYEGIFK
TLSSKFELAV		DAVHRKASEP		AGGPRREDIV		DTMVFKPSDV		MLVHFRNVDF
NYATKDKFTD		SAIAMNSKVN		GEHKEKVLQR		WEGGDSNSDD		YDLESDMSNG
WDPNEMFKFN		EENYGVKTTY		DSSLSSYTVP		LEKDNSEEFR		QRELRAAQLA
REIESSPQYR		LRIAMENDDG		RTEEEKHSAV		QRQGSGRESP		SLASREGKYI
PLPQRVREGP		RGGVRCSSSR		GGRPGLSSLP		PRGPHHLDNS		SPGPGSEARG
INGGPSRMSP		KAQRPLRGAK		TLSSPSNRPS		GETSVPPPPA		VGRMYPPRSP
KSAAPAPISA		SCPEPPIGSA		VPTSSASIPV		TSSVSDPGVG		SISPASPKIS
LAPTDVKELS		TKEPGRTLEP		QELARIAGKV		PGLQNEQKRF		QLEELRKFGA
QFKLQPSSSP		ENSLDPFPPR		ILKEEPKGKE		KEVDGLLTSE		PMGSPVSSKT
ESVSDKEDKP		PLAPSGGTEG		PEQPPPPCPS		QTGSPPVGLI		KGEDKDEGPV
AEQVKKSTLN		PNAKEFNPTK		PLLSVNKSTS		TPTSPGPRTH		STPSIPVLTA
GQSGLYSPQY		ISYIPQIHMG		PAVQAPQMYP		YPVSNSVPGQ		QGKYRGAKGS
LPPQRSDQHQ		PASAPPMMQA		AAAAGPPLVA		ATPYSSYIPY		NPQQFPGQPA
MMQPMAHYPS		QPVFAPMLQS		NPRMLTSGSH		PQAIVSSSTP		QYPSAEQPTP
QALYATVHQS		YPHHATQLHA		HQPQPATTPT		GSQPQSQHAA		PSPVQHQAGQ
APHLGSGQPQ		QNLYHPGALT		GTPPSLPPGP		SAQSPQSSFP		QPAAVYAIHH
QQLPHGFTNM		AHVTQAHVQT		GITAAPPPHP		GAPHPPQVML		LHPPQSHGGP
PQGAVPQSGV		PALSASTPSP		YPYIGHPQGE		QPGQAPGFPG		GADDRIREFS
LAGGIWHGRA		EGLQVGQDAR		VLGGE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Figueroa K.P., Pulst S.M. (2003). Identification and expression of the gene for human ataxin-2-related protein on chromosome 16. Exp. Neurol. 184: 669—678. PMID 14769358 DOI:10.1016/S0014-4886(03)00287-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kaehler C., Guenther A., Uhlich A., Krobitsch S. (2015). PRMT1-mediated arginine methylation controls ATXN2L localization. Exp. Cell Res. 334: 114—125. PMID 25748791 DOI:10.1016/j.yexcr.2015.02.022

Див. також

• Хромосома 16