BAZ1B

BAZ1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1F62
Ідентифікатори
Символи	BAZ1B, WBSCR10, WBSCR9, WSTF, bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 605681 MGI: 1353499 HomoloGene: 22651 GeneCards: BAZ1B
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • histone kinase activity • GO:0031493 histone binding • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • zinc ion binding Клітинна компонента • pericentric heterochromatin • nuclear replication fork • Нуклеоплазма • condensed chromosome • клітинне ядро • Ядерні тільця Біологічний процес • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • Ремоделювання хроматину • фосфорилювання • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9031	22385
Ensembl	ENSG00000009954	ENSMUSG00000002748
UniProt	Q9UIG0	Q9Z277
RefSeq (мРНК)	NM_023005 NM_032408 NM_001370402	NM_011714
RefSeq (білок)	NP_115784 NP_001357331	NP_035844
Локус (UCSC)	Хр. 7: 73.44 – 73.52 Mb	Хр. 5: 135.22 – 135.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BAZ1B (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 483 амінокислот, а молекулярна маса — 170 903.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPLLGRKPF		PLVKPLPGEE		PLFTIPHTQE		AFRTREEYEA		RLERYSERIW
TCKSTGSSQL		THKEAWEEEQ		EVAELLKEEF		PAWYEKLVLE		MVHHNTASLE
KLVDTAWLEI		MTKYAVGEEC		DFEVGKEKML		KVKIVKIHPL		EKVDEEATEK
KSDGACDSPS		SDKENSSQIA		QDHQKKETVV		KEDEGRRESI		NDRARRSPRK
LPTSLKKGER		KWAPPKFLPH		KYDVKLQNED		KIISNVPADS		LIRTERPPNK
EIVRYFIRHN		ALRAGTGENA		PWVVEDELVK		KYSLPSKFSD		FLLDPYKYMT
LNPSTKRKNT		GSPDRKPSKK		SKTDNSSLSS		PLNPKLWCHV		HLKKSLSGSP
LKVKNSKNSK		SPEEHLEEMM		KMMSPNKLHT		NFHIPKKGPP		AKKPGKHSDK
PLKAKGRSKG		ILNGQKSTGN		SKSPKKGLKT		PKTKMKQMTL		LDMAKGTQKM
TRAPRNSGGT		PRTSSKPHKH		LPPAALHLIA		YYKENKDRED		KRSALSCVIS
KTARLLSSED		RARLPEELRS		LVQKRYELLE		HKKRWASMSE		EQRKEYLKKK
REELKKKLKE		KAKERREKEM		LERLEKQKRY		EDQELTGKNL		PAFRLVDTPE
GLPNTLFGDV		AMVVEFLSCY		SGLLLPDAQY		PITAVSLMEA		LSADKGGFLY
LNRVLVILLQ		TLLQDEIAED		YGELGMKLSE		IPLTLHSVSE		LVRLCLRRSD
VQEESEGSDT		DDNKDSAAFE		DNEVQDEFLE		KLETSEFFEL		TSEEKLQILT
ALCHRILMTY		SVQDHMETRQ		QMSAELWKER		LAVLKEENDK		KRAEKQKRKE
MEAKNKENGK		VENGLGKTDR		KKEIVKFEPQ		VDTEAEDMIS		AVKSRRLLAI
QAKKEREIQE		REMKVKLERQ		AEEERIRKHK		AAAEKAFQEG		IAKAKLVMRR
TPIGTDRNHN		RYWLFSDEVP		GLFIEKGWVH		DSIDYRFNHH		CKDHTVSGDE
DYCPRSKKAN		LGKNASMNTQ		HGTATEVAVE		TTTPKQGQNL		WFLCDSQKEL
DELLNCLHPQ		GIRESQLKER		LEKRYQDIIH		SIHLARKPNL		GLKSCDGNQE
LLNFLRSDLI		EVATRLQKGG		LGYVEETSEF		EARVISLEKL		KDFGECVIAL
QASVIKKFLQ		GFMAPKQKRR		KLQSEDSAKT		EEVDEEKKMV		EEAKVASALE
KWKTAIREAQ		TFSRMHVLLG		MLDACIKWDM		SAENARCKVC		RKKGEDDKLI
LCDECNKAFH		LFCLRPALYE		VPDGEWQCPA		CQPATARRNS		RGRNYTEESA
SEDSEDDESD		EEEEEEEEEE		EEEDYEVAGL		RLRPRKTIRG		KHSVIPPAAR
SGRRPGKKPH		STRRSQPKAP		PVDDAEVDEL		VLQTKRSSRR		QSLELQKCEE
ILHKIVKYRF		SWPFREPVTR		DEAEDYYDVI		THPMDFQTVQ		NKCSCGSYRS
VQEFLTDMKQ		VFTNAEVYNC		RGSHVLSCMV		KTEQCLVALL		HKHLPGHPYV
RRKRKKFPDR		LAEDEGDSEP		EAVGQSRGRR		QKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Lu X., Meng X., Morris C.A., Keating M.T. (1998). A novel human gene, WSTF, is deleted in Williams Syndrome. Genomics. 54: 241—249. PMID 9828126 DOI:10.1006/geno.1998.5578
• Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 DOI:10.1006/geno.1999.6071
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci. EMBO J. 21: 2231—2241. PMID 11980720 DOI:10.1093/emboj/21.9.2231
• Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 7