C11orf54

C11orf54
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XCR
Ідентифікатори
Символи	C11orf54, PTD012, PTOD012, chromosome 11 open reading frame 54
Зовнішні ІД	OMIM: 615810 MGI: 1918234 HomoloGene: 8531 GeneCards: C11orf54
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • hydrolase activity, acting on ester bonds • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • екзосома • клітинне ядро • Нуклеоплазма • Ядерні тільця Біологічний процес • Обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	28970	70984
Ensembl	ENSG00000182919	ENSMUSG00000031938
UniProt	Q9H0W9	Q91V76
RefSeq (мРНК)	NM_001286067 NM_001286068 NM_001286069 NM_001286070 NM_001286071 NM_014039 NM_001351985 NM_001351986 NM_001351988 NM_001351989 NM_001351990 NM_001351991 NM_001351992 NM_001351993 NM_001351987 NM_001369406	NM_001199484 NM_001199485 NM_133732 NM_001359258
RefSeq (білок)	NP_001272996 NP_001272997 NP_001272998 NP_001272999 NP_001273000 NP_054758 NP_001338914 NP_001338915 NP_001338916 NP_001338917 NP_001338918 NP_001338919 NP_001338920 NP_001338921 NP_001338922 NP_001356335	NP_001186413 NP_001186414 NP_598493 NP_001346187
Локус (UCSC)	Хр. 11: 93.74 – 93.76 Mb	Хр. 9: 15.19 – 15.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C11orf54 (англ. Chromosome 11 open reading frame 54) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 315 амінокислот, а молекулярна маса — 35 117.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MACAEFSFHV		PSLEELAGVM		QKGLKDNFAD		VQVSVVDCPD		LTKEPFTFPV
KGICGKTRIA		EVGGVPYLLP		LVNQKKVYDL		NKIAKEIKLP		GAFILGAGAG
PFQTLGFNSE		FMPVIQTESE		HKPPVNGSYF		AHVNPADGGC		LLEKYSEKCH
DFQCALLANL		FASEGQPGKV		IEVKAKRRTG		PLNFVTCMRE		TLEKHYGNKP
IGMGGTFIIQ		KGKVKSHIMP		AEFSSCPLNS		DEEVNKWLHF		YEMKAPLVCL
PVFVSRDPGF		DLRLEHTHFF		SRHGEGGHYH		YDTTPDIVEY		LGYFLPAEFL
YRIDQPKETH		SIGRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11