CAMSAP3

CAMSAP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UGJ
Ідентифікатори
Символи	CAMSAP3, KIAA1543, NEZHA, PPP1R80, calmodulin regulated spectrin associated protein family member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612685 MGI: 1916947 HomoloGene: 18966 GeneCards: CAMSAP3
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • spectrin binding • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin filament binding • microtubule minus-end binding Клітинна компонента • цитоплазма • zonula adherens • Адгезивні контакти • Міжклітинні контакти • центросома • мікротрубочка • Цитоскелет • microtubule minus-end Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • regulation of microtubule cytoskeleton organization • microtubule anchoring • epithelial cell-cell adhesion • neuron projection development • zonula adherens maintenance • regulation of cell migration • regulation of focal adhesion assembly • regulation of Golgi organization • microtubule cytoskeleton organization • embryo development ending in birth or egg hatching • establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity • regulation of microtubule polymerization • regulation of organelle organization • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • protein transport along microtubule • negative regulation of microtubule depolymerization • cytoplasmic microtubule organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57662	69697
Ensembl	ENSG00000076826	ENSMUSG00000044433
UniProt	Q9P1Y5	Q80VC9
RefSeq (мРНК)	NM_001080429 NM_020902	NM_001163749 NM_027171 NM_001347111 NM_001347112 NM_001347113
RefSeq (білок)	NP_001073898 NP_065953	NP_001157221 NP_001334040 NP_001334041 NP_001334042 NP_081447 NP_001350168 NP_001350169 NP_001350170 NP_001350171 NP_001350172 NP_001350173 NP_001350174 NP_001350175 NP_001350176 NP_001350177 NP_001350178
Локус (UCSC)	Хр. 19: 7.6 – 7.62 Mb	Хр. 8: 3.59 – 3.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAMSAP3 (англ. Calmodulin regulated spectrin associated protein family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 249 амінокислот, а молекулярна маса — 134 750.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVEAAPPGPG		PLRRTFLVPE		IKSLDQYDFS		RAKAAASLAW		VLRAAFGGAE
HVPPELWEPF		YTDQYAQEHV		KPPVTRLLLS		AELYCRAWRQ		ALPQLETPPN
PSALLALLAR		RGTVPALPER		PVREADLRHQ		PILMGAHLAV		IDALMAAFAF
EWTKTLPGPL		ALTSLEHKLL		FWVDTTVRRL		QEKTEQEAAQ		RASPAAPADG
AAPAQPSIRY		RKDRVVARRA		PCFPTVTSLQ		DLASGAALAA		TIHCYCPQLL
RLEEVCLKDP		MSVADSLYNL		QLVQDFCASR		LPRGCPLSLE		DLLYVPPPLK
VNLVVMLAEL		FMCFEVLKPD		FVQVKDLPDG		HAASPRGTEA		SPPQNNSGSS
SPVFTFRHPL		LSSGGPQSPL		RGSTGSLKSS		PSMSHMEALG		KAWNRQLSRP
LSQAVSFSTP		FGLDSDVDVV		MGDPVLLRSV		SSDSLGPPRP		APARTPTQPP
PEPGDLPTIE		EALQIIHSAE		PRLLPDGAAD		GSFYLHSPEG		PSKPSLASPY
LPEGTSKPLS		DRPTKAPVYM		PHPETPSKPS		PCLVGEASKP		PAPSEGSPKA
VASSPAATNS		EVKMTSFAER		KKQLVKAEAE		AGAGSPTSTP		APPEALSSEM
SELSARLEEK		RRAIEAQKRR		IEAIFAKHRQ		RLGKSAFLQV		QPREASGEAE
AEAEEADSGP		VPGGERPAGE		GQGEPTSRPK		AVTFSPDLGP		VPHEGLGEYN
RAVSKLSAAL		SSLQRDMQRL		TDQQQRLLAP		PEAPGSAPPP		AAWVIPGPTT
GPKAASPSPA		RRVPATRRSP		GPGPSQSPRS		PKHTRPAELR		LAPLTRVLTP
PHDVDSLPHL		RKFSPSQVPV		QTRSSILLAE		ETPPEEPAAR		PGLIEIPLGS
LADPAAEDEG		DGSPAGAEDS		LEEEASSEGE		PRVGLGFFYK		DEDKPEDEMA
QKRASLLERQ		QRRAEEARRR		KQWQEVEKEQ		RREEAARLAQ		EEAPGPAPLV
SAVPMATPAP		AARAPAEEEV		GPRKGDFTRQ		EYERRAQLKL		MDDLDKVLRP
RAAGSGGPGR		GGRRATRPRS		GCCDDSALAR		SPARGLLGSR		LSKIYSQSTL
SLSTVANEAH		NNLGVKRPTS		RAPSPSGLMS		PSRLPGSRER		DWENGSNASS
PASVPEYTGP		RLYKEPSAKS		NKFIIHNALS		HCCLAGKVNE		PQKNRILEEI
EKSKANHFLI		LFRDSSCQFR		ALYTLSGETE		ELSRLAGYGP		RTVTPAMVEG
IYKYNSDRKR		FTQIPAKTMS		MSVDAFTIQG		HLWQGKKPTT		PKKGGGTPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Meng W., Mushika Y., Ichii T., Takeichi M. (2008). Anchorage of microtubule minus ends to adherens junctions regulates epithelial cell-cell contacts. Cell. 135: 948—959. PMID 19041755 DOI:10.1016/j.cell.2008.09.040
• Tanaka N., Meng W., Nagae S., Takeichi M. (2012). Nezha/CAMSAP3 and CAMSAP2 cooperate in epithelial-specific organization of noncentrosomal microtubules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 20029—20034. PMID 23169647 DOI:10.1073/pnas.1218017109

Див. також

• Хромосома 19