CCDC116

CCDC116
Ідентифікатори
Символи	CCDC116, coiled-coil domain containing 116
Зовнішні ІД	MGI: 1924122 HomoloGene: 51873 GeneCards: CCDC116
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	164592	76872
Ensembl	ENSG00000161180	ENSMUSG00000022768
UniProt	Q8IYX3	Q80X53
RefSeq (мРНК)	NM_152612 NM_001331066	NM_001164606 NM_029779 NM_001306169 NM_001373948
RefSeq (білок)	NP_001317995 NP_689825	NP_001293098 NP_084055
Локус (UCSC)	Хр. 22: 21.63 – 21.64 Mb	Хр. 16: 16.96 – 16.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC116 (англ. Coiled-coil domain containing 116) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 515 амінокислот, а молекулярна маса — 56 940.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARCRHHSGY		LADDEASHSM		CSARVQLPKK		PLVPEMRPAC		KPGRVPHPPS
TCGSSALQGQ		RRNKRHPQPF		GHFLDFLTES		QVLDSLETVV		EKATERMAAM
KTEAGVPLVE		VQDPVEVPSG		GRRAHARPSL		STVHRHRVRP		TLCTGHPNNY
PSSSSSMSNC		HSSLMAGCLG		SHSRDSDLGA		QGSLPPVRDK		LLLEKNLKRL
LQLEREGKGL		SQSCSQRDSL		LWDSLGSQTS		FQWTQEQPLS		WFSGLLGSSS
GVPEASEPRP		GEQEPIFRKR		EFNKEIKSLL		SQLESLDLPG		YCPLREPHRT
LNFLADHRLF		PALQSVVSQA		VDKLRGAHCR		DGRPLFPTSL		EPTSDLPPLG
SEPAKPTNGG		QPYASPRPTV		SSPKMLQRKR		KDRGGSPSMS		SAQVATRFKL
KSPCSSSRFT		KKKPLPSISS		KSSMSHFSNR		LYEELADFLT		QQAASLVIRK
YEFEKDLSKQ		LGFFSFPITH		VLRDLSLGLK		KVKGSRIHLS		SETHRSCLLR
KLEESKRAAA		VSLEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Firat-Karalar E.N., Sante J., Elliott S., Stearns T. (2014). Proteomic analysis of mammalian sperm cells identifies new components of the centrosome. J. Cell Sci. 127: 4128—4133. PMID 25074808 DOI:10.1242/jcs.157008

Див. також

• Хромосома 22