CCDC169-SOHLH2

CCDC169-SOHLH2
Ідентифікатори
Символи	CCDC169-SOHLH2, C13orf38-SOHLH2, CCDC169-SOHLH2 readthrough, SOHLH2, TEB1
Зовнішні ІД	MGI: 1921684 HomoloGene: 9864 GeneCards: CCDC169-SOHLH2
Онтологія гена Молекулярна функція • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • protein dimerization activity • DNA binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • Оогенез • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • oocyte differentiation • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100526761	74434
Ensembl	ENSG00000250709	ENSMUSG00000027794
UniProt	Q9NX45	Q9D489
RefSeq (мРНК)	NM_001198910	NM_028937
RefSeq (білок)	NP_001269076 NP_060296	NP_083213
Локус (UCSC)	Хр. 13: 36.17 – 36.3 Mb	Хр. 3: 55.09 – 55.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC169-SOHLH2 (англ. CCDC169-SOHLH2 readthrough) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 46 941.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSIICQEH		CQISGQAKID		ILLVGDVTVG		YLADTVQKLF		ANIAEVTITI
SDTKEAAALL		DDCIFNMVLL		KVPSSLSAEE		LEAIKLIRFG		KKKNTHSLFV
FIIPENFKGC		ISGHGMDIAL		TEPLTMEKMS		NVVKYWTTCP		SNTVKTENAT
GPEELGLPLQ		RSYSEHLGYF		PTDLFACSES		LRNGNGLELN		ASLSEFEKNK
KISLLHSSKE		KLRRERIKYC		CEQLRTLLPY		VKGRKNDAAS		VLEATVDYVK
YIREKISPAV		MAQITEALQS		NMRFCKKQQT		PIELSLPGTV		MAQRENSVMS
TYSPERGLQF		LTNTCWNGCS		TPDAESSLDE		AVRVPSSSAS		ENAIGDPYKT
HISSAALSLN		SLHTVRYYSK		VTPSYDATAV		TNQNISIHLP		SAMPPVSKLL
PRHCTSGLGQ		TCTTHPNCLQ		QFWAY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13