CD4

CD4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CDH, 1CDI, 1CDJ, 1CDU, 1CDY, 1G9M, 1G9N, 1GC1, 1JL4, 1Q68, 1RZJ, 1RZK, 1WIO, 1WIP, 1WIQ, 2B4C, 2JKR, 2JKT, 2KLU, 2NXY, 2NXZ, 2NY0, 2NY1, 2NY2, 2NY3, 2NY4, 2NY5, 2NY6, 2QAD, 3B71, 3CD4, 3JWD, 3JWO, 3LQA, 3O2D, 3S5L, 3T0E, 4JM2, 1WBR, 3S4S, 4H8W, 4P9H, 4Q6I, 4R2G, 4R4H, 4RQS, 3J70, 5A7X, 5A8H, 5CAY
Ідентифікатори
Символи	CD4, CD4mut, CD4 molecule, OKT4D, IMD79
Зовнішні ІД	OMIM: 186940 MGI: 88335 HomoloGene: 513 GeneCards: CD4
Пов'язані генетичні захворювання
ВІЛ-заворювання
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane signaling receptor activity • virus receptor activity • protein homodimerization activity • zinc ion binding • extracellular matrix structural constituent • enzyme binding • immunoglobulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • coreceptor activity • interleukin-16 binding • interleukin-16 receptor activity • MHC class II protein binding • identical protein binding • protein tyrosine kinase binding • signaling receptor activity • protein kinase binding • signaling receptor binding Клітинна компонента • endoplasmic reticulum lumen • integral component of membrane • early endosome • мембрана • cell surface • endoplasmic reticulum membrane • membrane raft • T cell receptor complex • external side of plasma membrane • клітинна мембрана • clathrin-coated vesicle membrane • integral component of plasma membrane Біологічний процес • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • positive regulation of protein kinase activity • GO:0019049, GO:0030683 mitigation of host defenses by virus • positive regulation of calcium-mediated signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • helper T cell enhancement of adaptive immune response • T cell selection • response to estradiol • induction by virus of host cell-cell fusion • адаптивна імунна відповідь • response to vitamin D • T cell differentiation • cell surface receptor signaling pathway • positive regulation of T cell proliferation • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • enzyme linked receptor protein signaling pathway • T cell activation • positive regulation of T cell activation • maintenance of protein location in cell • GO:0032617 творба цитокінів • T cell receptor signaling pathway • процес імунної системи • positive regulation of calcium ion transport into cytosol • regulation of T cell activation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • адгезія клітин • GO:0022415 viral process • fusion of virus membrane with host plasma membrane • membrane organization • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of kinase activity • interleukin-15-mediated signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of monocyte differentiation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of viral entry into host cell • regulation of calcium ion transport • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus • cytokine-mediated signaling pathway • macrophage differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	920	12504
Ensembl	ENSG00000010610	ENSMUSG00000023274
UniProt	P01730	P06332
RefSeq (мРНК)	NM_000616 NM_001195014 NM_001195015 NM_001195016 NM_001195017 NM_001382705 NM_001382706 NM_001382707 NM_001382714	NM_013488
RefSeq (білок)	NP_000607 NP_001181943 NP_001181944 NP_001181945 NP_001181946 NP_001369634 NP_001369635 NP_001369636 NP_001369643	NP_038516
Локус (UCSC)	Хр. 12: 6.79 – 6.82 Mb	Хр. 6: 124.84 – 124.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD4 (англ. CD4 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 51 111.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNRGVPFRHL		LLVLQLALLP		AATQGKKVVL		GKKGDTVELT		CTASQKKSIQ
FHWKNSNQIK		ILGNQGSFLT		KGPSKLNDRA		DSRRSLWDQG		NFPLIIKNLK
IEDSDTYICE		VEDQKEEVQL		LVFGLTANSD		THLLQGQSLT		LTLESPPGSS
PSVQCRSPRG		KNIQGGKTLS		VSQLELQDSG		TWTCTVLQNQ		KKVEFKIDIV
VLAFQKASSI		VYKKEGEQVE		FSFPLAFTVE		KLTGSGELWW		QAERASSSKS
WITFDLKNKE		VSVKRVTQDP		KLQMGKKLPL		HLTLPQALPQ		YAGSGNLTLA
LEAKTGKLHQ		EVNLVVMRAT		QLQKNLTCEV		WGPTSPKLML		SLKLENKEAK
VSKREKAVWV		LNPEAGMWQC		LLSDSGQVLL		ESNIKVLPTW		STPVQPMALI
VLGGVAGLLL		FIGLGIFFCV		RCRHRRRQAE		RMSQIKRLLS		EKKTCQCPHR
FQKTCSPI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Littman D.R., Maddon P.J., Axel R. (1988). Corrected CD4 sequence. Cell. 55: 541—541. PMID 3263213 doi:10.1016/0092-8674(88)90211-5
• Ansari-Lari M.A., Shen Y., Muzny D.M., Lee W., Gibbs R.A. (1997). Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination. Genome Res. 7: 268—280. PMID 9074930 doi:10.1101/gr.7.3.268
• Hodge T.W., Sasso D.R., McDougal J.S. (1991). Humans with OKT4-epitope deficiency have a single nucleotide base change in the CD4 gene, resulting in substitution of TRP240 for ARG240. Hum. Immunol. 30: 99—104. PMID 1708753 doi:10.1016/0198-8859(91)90077-M
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Fomsgaard A., Hirsch V.M., Johnson P.R. (1992). Cloning and sequences of primate CD4 molecules: diversity of the cellular receptor for simian immunodeficiency virus/human immunodeficiency virus. Eur. J. Immunol. 22: 2973—2981. PMID 1425921 doi:10.1002/eji.1830221132
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 12