CHAF1A

CHAF1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1S4Z
Ідентифікатори
Символи	CHAF1A, CAF-1, CAF1, CAF1B, CAF1P150, P150, chromatin assembly factor 1 subunit A
Зовнішні ІД	OMIM: 601246 MGI: 1351331 HomoloGene: 4003 GeneCards: CHAF1A
Онтологія гена Молекулярна функція • unfolded protein binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromo shadow domain binding • identical protein binding Клітинна компонента • CAF-1 complex • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • Реплікація ДНК • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • nucleosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10036	27221
Ensembl	ENSG00000167670	ENSMUSG00000002835
UniProt	Q13111	Q9QWF0
RefSeq (мРНК)	NM_005483	NM_013733
RefSeq (білок)	NP_005474	NP_038761
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.4 – 4.45 Mb	Хр. 17: 56.35 – 56.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHAF1A (англ. Chromatin assembly factor 1 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 956 амінокислот, а молекулярна маса — 106 926.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLEELECGAP		GARGAATAMD		CKDRPAFPVK		KLIQARLPFK		RLNLVPKGKA
DDMSDDQGTS		VQSKSPDLEA		SLDTLENNCH		VGSDIDFRPK		LVNGKGPLDN
FLRNRIETSI		GQSTVIIDLT		EDSNEQPDSL		VDHNKLNSEA		SPSREAINGQ
REDTGDQQGL		LKAIQNDKLA		FPGETLSDIP		CKTEEEGVGC		GGAGRRGDSQ
ECSPRSCPEL		TSGPRMCPRK		EQDSWSEAGG		ILFKGKVPMV		VLQDILAVRP
PQIKSLPATP		QGKNMTPESE		VLESFPEEDS		VLSHSSLSSP		SSTSSPEGPP
APPKQHSSTS		PFPTSTPLRR		ITKKFVKGST		EKNKLRLQRD		QERLGKQLKL
RAEREEKEKL		KEEAKRAKEE		AKKKKEEEKE		LKEKERREKR		EKDEKEKAEK
QRLKEERRKE		RQEALEAKLE		EKRKKEEEKR		LREEEKRIKA		EKAEITRFFQ
KPKTPQAPKT		LAGSCGKFAP		FEIKEHMVLA		PRRRTAFHPD		LCSQLDQLLQ
QQSGEFSFLK		DLKGRQPLRS		GPTHVSTRNA		DIFNSDVVIV		ERGKGDGVPE
RRKFGRMKLL		QFCENHRPAY		WGTWNKKTAL		IRARDPWAQD		TKLLDYEVDS
DEEWEEEEPG		ESLSHSEGDD		DDDMGEDEDE		DDGFFVPHGY		LSEDEGVTEE
CADPENHKVR		QKLKAKEWDE		FLAKGKRFRV		LQPVKIGCVW		AADRDCAGDD
LKVLQQFAAC		FLETLPAQEE		QTPKASKRER		RDEQILAQLL		PLLHGNVNGS
KVIIREFQEH		CRRGLLSNHT		GSPRSPSTTY		LHTPTPSEDA		AIPSKSRLKR
LISENSVYEK		RPDFRMCWYV		HPQVLQSFQQ		EHLPVPCQWS		YVTSVPSAPK
EDSGSVPSTG		PSQGTPISLK		RKSAGSMCIT		QFMKKRRHDG		QIGAEDMDGF
QADTEEEEEE		EGDCMIVDVP		DAAEVQAPCG		AASGAGGGVG		VDTGKATLTS
SPLGAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kaufman P.D., Kobayashi R., Kessler N., Stillman B. (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication. Cell. 81: 1105—1114. PMID 7600578 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80015-7
• Shibahara K., Stillman B. (1999). Replication-dependent marking of DNA by PCNA facilitates CAF-1-coupled inheritance of chromatin. Cell. 96: 575—585. PMID 10052459 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80661-3
• Quivy J.-P., Grandi P., Almouzni G. (2001). Dimerization of the largest subunit of chromatin assembly factor 1: importance in vitro and during Xenopus early development. EMBO J. 20: 2015—2027. PMID 11296234 DOI:10.1093/emboj/20.8.2015
• Reese B.E., Bachman K.E., Baylin S.B., Rountree M.R. (2003). The methyl-CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1. Mol. Cell. Biol. 23: 3226—3236. PMID 12697822 DOI:10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003
• Sarraf S.A., Stancheva I. (2004). Methyl-CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly. Mol. Cell. 15: 595—605. PMID 15327775 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.043

Див. також

• Хромосома 19