CHMP1B

CHMP1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EAB, 4TXQ, 4TXR, 3JC1
Ідентифікатори
Символи	CHMP1B, C10orf2, C18-ORF2, C18orf2, CHMP1.5, Vps46-2, Vps46B, hVps46-2, charged multivesicular body protein 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 606486 MGI: 1914314 HomoloGene: 41374 GeneCards: CHMP1B
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ESCRT III complex • гіалоплазма • ендосома • late endosome membrane • мембрана • membrane coat • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро • midbody • multivesicular body Біологічний процес • regulation of centrosome duplication • nucleus organization • establishment of protein localization • multivesicular body assembly • regulation of mitotic spindle assembly • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • septum digestion after cytokinesis • mitotic metaphase plate congression • vacuolar transport • ESCRT III complex disassembly • GO:0015915 транспорт • viral budding via host ESCRT complex • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • late endosome to vacuole transport • midbody abscission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57132	67064
Ensembl	ENSG00000255112	ENSMUSG00000109901
UniProt	Q7LBR1	Q99LU0
RefSeq (мРНК)	NM_020412	NM_024190
RefSeq (білок)	NP_065145	NP_077152
Локус (UCSC)	Хр. 18: 11.85 – 11.85 Mb	Хр. 18: 67.34 – 67.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHMP1B (англ. Charged multivesicular body protein 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 199 амінокислот, а молекулярна маса — 22 109.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNMEKHLFN		LKFAAKELSR		SAKKCDKEEK		AEKAKIKKAI		QKGNMEVARI
HAENAIRQKN		QAVNFLRMSA		RVDAVAARVQ		TAVTMGKVTK		SMAGVVKSMD
ATLKTMNLEK		ISALMDKFEH		QFETLDVQTQ		QMEDTMSSTT		TLTTPQNQVD
MLLQEMADEA		GLDLNMELPQ		GQTGSVGTSV		ASAEQDELSQ		RLARLRDQV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
• Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
• Vuoristo J.T., Berrettini W.H., Ala-Kokko L. (2001). C18orf2, a novel, highly conserved intronless gene within intron 5 of the GNAL gene on chromosome 18p11. Cytogenet. Cell Genet. 93: 19—22. PMID 11474171
• Stauffer D.R., Howard T.L., Nyun T., Hollenberg S.M. (2001). CHMP1 is a novel nuclear matrix protein affecting chromatin structure and cell-cycle progression. J. Cell Sci. 114: 2383—2393. PMID 11559747

Див. також

• Хромосома 18