CNOT2

CNOT2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4C0D, 4C0F, 5FU6, 5FU7
Ідентифікатори
Символи	CNOT2, CDC36, NOT2, NOT2H, HSPC131, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, IDNADFS
Зовнішні ІД	OMIM: 604909 MGI: 1919318 HomoloGene: 40953 GeneCards: CNOT2
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A)-specific ribonuclease activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • CCR4-NOT complex • P-body • CCR4-NOT core complex • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • negative regulation of translation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of stem cell population maintenance • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • trophectodermal cell differentiation • Сайленсинг генів • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • regulation of translation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4848	72068
Ensembl	ENSG00000111596	ENSMUSG00000020166
UniProt	Q9NZN8	Q8C5L3
RefSeq (мРНК)	NM_001199302 NM_001199303 NM_014515	NM_001037846 NM_001037847 NM_001037848 NM_028082 NM_001359247 NM_001359248 NM_001359249 NM_001359250 NM_001359251 NM_001359252 NM_001359253 NM_001359563
RefSeq (білок)	NP_001186231 NP_001186232 NP_055330	NP_001032935 NP_001032936 NP_001032937 NP_082358 NP_001346176 NP_001346177 NP_001346178 NP_001346179 NP_001346180 NP_001346181 NP_001346182 NP_001346492
Локус (UCSC)	Хр. 12: 70.24 – 70.35 Mb	Хр. 10: 116.32 – 116.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNOT2 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 59 738.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRTDGHTLS		EKRNYQVTNS		MFGASRKKFV		EGVDSDYHDE		NMYYSQSSMF
PHRSEKDMLA		SPSTSGQLSQ		FGASLYGQQS		ALGLPMRGMS		NNTPQLNRSL
SQGTQLPSHV		TPTTGVPTMS		LHTPPSPSRG		ILPMNPRNMM		NHSQVGQGIG
IPSRTNSMSS		SGLGSPNRSS		PSIICMPKQQ		PSRQPFTVNS		MSGFGMNRNQ
AFGMNNSLSS		NIFNGTDGSE		NVTGLDLSDF		PALADRNRRE		GSGNPTPLIN
PLAGRAPYVG		MVTKPANEQS		QDFSIHNEDF		PALPGSSYKD		PTSSNDDSKS
NLNTSGKTTS		STDGPKFPGD		KSSTTQNNNQ		QKKGIQVLPD		GRVTNIPQGM
VTDQFGMIGL		LTFIRAAETD		PGMVHLALGS		DLTTLGLNLN		SPENLYPKFA
SPWASSPCRP		QDIDFHVPSE		YLTNIHIRDK		LAAIKLGRYG		EDLLFYLYYM
NGGDVLQLLA		AVELFNRDWR		YHKEERVWIT		RAPGMEPTMK		TNTYERGTYY
FFDCLNWRKV		AKEFHLEYDK		LEERPHLPST		FNYNPAQQAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zwartjes C.G., Jayne S., van den Berg D.L., Timmers H.T. (2004). Repression of promoter activity by CNOT2, a subunit of the transcription regulatory Ccr4-not complex. J. Biol. Chem. 279: 10848—10854. PMID 14707134 DOI:10.1074/jbc.M311747200
• Jayne S., Zwartjes C.G., van Schaik F.M., Timmers H.T. (2006). Involvement of the SMRT/NCoR-HDAC3 complex in transcriptional repression by the CNOT2 subunit of the human Ccr4-Not complex. Biochem. J. 398: 461—467. PMID 16712523 DOI:10.1042/BJ20060406

Див. також

• Хромосома 12