COL28A1

COL28A1
Ідентифікатори
Символи	COL28A1, COL28, collagen type XXVIII alpha 1, collagen type XXVIII alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 609996 MGI: 2685312 HomoloGene: 66345 GeneCards: COL28A1
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа
Реагує на сполуку
ocriplasmin
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Клітинна компонента • extracellular region • Базальна мембрана • Колаген • endoplasmic reticulum lumen • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • negative regulation of peptidase activity • адгезія клітин • negative regulation of endopeptidase activity • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	340267	213945
Ensembl	ENSG00000215018	ENSMUSG00000068794
UniProt	Q2UY09	Q2UY11
RefSeq (мРНК)	NM_001037763	NM_001037865
RefSeq (білок)	NP_001032852	NP_001032954
Локус (UCSC)	Хр. 7: 7.36 – 7.54 Mb	Хр. 6: 8 – 8.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL28A1 (англ. Collagen type XXVIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 125 амінокислот, а молекулярна маса — 116 657.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWNRYFVFYL		LLLSAFTSQT		VSGQRKKGPK		SNLLARKSDV		QGSICFIDIV
FIVDSSESSK		IALFDKQKDF		VDSLSDKIFQ		LTPGRSLEYD		IKLAALQFSS
SVQIDPPFSS		WKDLQTFKQK		VKSMNLIGQG		TFSYYAISNA		TRLLKREGRK
DGVKVVLLMT		DGIDHPKNPD		VQSISEDARI		SGISFITIAL		STVVNEAKLR
LISGDSSSEP		TLLLSDPTLV		DKIQDRLDIL		FEKKCERKIC		ECEKGDPGDP
GPPGTHGNPG		IKGERGPKGN		PGNAQKGEAG		ERGPGGIPGY		KGDKGERGEC
GKPGIKGDKG		SPGPYGPKGP		RGIQGITGPP		GDPGPKGFQG		NKGEPGPPGP
YGSPGAPGIG		QQGIKGERGQ		EGRPGAPGPI		GVGEPGQPGP		RGPEGVPGER
GLPGEGFPGP		KGEKGSEGPT		GPQGLQGLSI		KGEKGDIGPV		GPQGPMGIPG
IGSQGEQGIQ		GPIGPPGPQG		PAGQGLPGSK		GEVGQMGPTG		PRGPVGIGVQ
GPKGEPGSIG		LPGQPGVPGE		DGAAGKKGEA		GLPGARGPEG		PPGKGQPGPK
GDEGKKGSKG		NQGQRGLPGP		EGPKGEPGIM		GPFGMPGTSI		PGPPGPKGDR
GGPGIPGFKG		EPGLSIRGPK		GVQGPRGPVG		APGLKGDGYP		GVPGPRGLPG
PPGPMGLRGV		GDTGAKGEPG		VRGPPGPSGP		RGVGTQGPKG		DTGQKGLPGP
PGPPGYGSQG		IKGEQGPQGF		PGPKGTMGHG		LPGQKGEHGE		RGDVGKKGDK
GEIGEPGSPG		KQGLQGPKGD		LGLTKEEIIK		LITEICGCGP		KCKETPLELV
FVIDSSESVG		PENFQIIKNF		VKTMADRVAL		DLATARIGII		NYSHKVEKVA
NLKQFSSKDD		FKLAVDNMQY		LGEGTYTATA		LQAANDMFED		ARPGVKKVAL
VITDGQTDSR		DKEKLTEVVK		NASDTNVEIF		VIGVVKKNDP		NFEIFHKEMN
LIATDPEHVY		QFDDFFTLQD		TLKQKLFQKI		CEDFDSYLVQ		IFGSSSPQPG
FGMSGEELSE		STPEPQKEIS		ESLSVTRDQD		EDDKAPEPTW		ADDLPATTSS
EATTTPRPLL		STPVDGAEDP		RCLEALKPGN		CGEYVVRWYY		DKQVNSCARF
WFSGCNGSGN		RFNSEKECQE		TCIQG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7