COL8A1
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
COL8A1 (англ. Collagen type VIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 73 364[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAVLPGPLQL | LGVLLTISLS | SIRLIQAGAY | YGIKPLPPQI | PPQMPPQIPQ | ||||
YQPLGQQVPH | MPLAKDGLAM | GKEMPHLQYG | KEYPHLPQYM | KEIQPAPRMG | ||||
KEAVPKKGKE | IPLASLRGEQ | GPRGEPGPRG | PPGPPGLPGH | GIPGIKGKPG | ||||
PQGYPGVGKP | GMPGMPGKPG | AMGMPGAKGE | IGQKGEIGPM | GIPGPQGPPG | ||||
PHGLPGIGKP | GGPGLPGQPG | PKGDRGPKGL | PGPQGLRGPK | GDKGFGMPGA | ||||
PGVKGPPGMH | GPPGPVGLPG | VGKPGVTGFP | GPQGPLGKPG | APGEPGPQGP | ||||
IGVPGVQGPP | GIPGIGKPGQ | DGIPGQPGFP | GGKGEQGLPG | LPGPPGLPGI | ||||
GKPGFPGPKG | DRGMGGVPGA | LGPRGEKGPI | GAPGIGGPPG | EPGLPGIPGP | ||||
MGPPGAIGFP | GPKGEGGIVG | PQGPPGPKGE | PGLQGFPGKP | GFLGEVGPPG | ||||
MRGLPGPIGP | KGEAGQKGVP | GLPGVPGLLG | PKGEPGIPGD | QGLQGPPGIP | ||||
GIGGPSGPIG | PPGIPGPKGE | PGLPGPPGFP | GIGKPGVAGL | HGPPGKPGAL | ||||
GPQGQPGLPG | PPGPPGPPGP | PAVMPPTPPP | QGEYLPDMGL | GIDGVKPPHA | ||||
YGAKKGKNGG | PAYEMPAFTA | ELTAPFPPVG | APVKFNKLLY | NGRQNYNPQT | ||||
GIFTCEVPGV | YYFAYHVHCK | GGNVWVALFK | NNEPVMYTYD | EYKKGFLDQA | ||||
SGSAVLLLRP | GDRVFLQMPS | EQAAGLYAGQ | YVHSSFSGYL | LYPM |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, ангіогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
- Muragaki Y., Mattei M.-G., Yamaguchi N., Olsen B.R., Ninomiya Y. (1991). The complete primary structure of the human alpha 1 (VIII) chain and assignment of its gene (COL8A1) to chromosome 3. Eur. J. Biochem. 197: 615—622. PMID 2029894 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb15951.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kittelberger R., Davis P.F., Flynn D.W., Greenhill N.S. (1990). Distribution of type VIII collagen in tissues: an immunohistochemical study. Connect. Tissue Res. 24: 303—318. PMID 2376131 DOI:10.3109/03008209009152157
- Kittelberger R., Neale T.J., Francky K.T., Greenhill N.S., Gibson G.J. (1992). Cleavage of type VIII collagen by human neutrophil elastase. Biochim. Biophys. Acta. 1139: 295—299. PMID 1515454 DOI:10.1016/0925-4439(92)90103-T
- Greenhill N.S., Ruger B.M., Hasan Q., Davis P.F. (2000). The alpha1(VIII) and alpha2(VIII) collagen chains form two distinct homotrimeric proteins in vivo. Matrix Biol. 19: 19—28. PMID 10686422 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00053-0
- Stephan S., Sherratt M.J., Hodson N., Shuttleworth C.A., Kielty C.M. (2004). Expression and supramolecular assembly of recombinant alpha1(viii) and alpha2(viii) collagen homotrimers. J. Biol. Chem. 279: 21469—21477. PMID 14990571 DOI:10.1074/jbc.M305805200
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL8A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2215 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P27658 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |