CPSF2

CPSF2
Ідентифікатори
Символи	CPSF2, CPSF100, cleavage and polyadenylation specific factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606028 MGI: 1861601 HomoloGene: 6460 GeneCards: CPSF2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • мембрана • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA processing • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53981	51786
Ensembl	ENSG00000165934	ENSMUSG00000041781
UniProt	Q9P2I0	O35218
RefSeq (мРНК)	NM_017437 NM_001322270 NM_001322271 NM_001322272	NM_016856
RefSeq (білок)	NP_001309199 NP_001309200 NP_001309201 NP_059133	NP_058552
Локус (UCSC)	Хр. 14: 92.12 – 92.17 Mb	Хр. 12: 101.94 – 101.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CPSF2 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 782 амінокислот, а молекулярна маса — 88 487.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSIIKLTTL		SGVQEESALC		YLLQVDEFRF		LLDCGWDEHF		SMDIIDSLRK
HVHQIDAVLL		SHPDPLHLGA		LPYAVGKLGL		NCAIYATIPV		YKMGQMFMYD
LYQSRHNTED		FTLFTLDDVD		AAFDKIQQLK		FSQIVNLKGK		GHGLSITPLP
AGHMIGGTIW		KIVKDGEEEI		VYAVDFNHKR		EIHLNGCSLE		MLSRPSLLIT
DSFNATYVQP		RRKQRDEQLL		TNVLETLRGD		GNVLIAVDTA		GRVLELAQLL
DQIWRTKDAG		LGVYSLALLN		NVSYNVVEFS		KSQVEWMSDK		LMRCFEDKRN
NPFQFRHLSL		CHGLSDLARV		PSPKVVLASQ		PDLECGFSRD		LFIQWCQDPK
NSIILTYRTT		PGTLARFLID		NPSEKITEIE		LRKRVKLEGK		ELEEYLEKEK
LKKEAAKKLE		QSKEADIDSS		DESDIEEDID		QPSAHKTKHD		LMMKGEGSRK
GSFFKQAKKS		YPMFPAPEER		IKWDEYGEII		KPEDFLVPEL		QATEEEKSKL
ESGLTNGDEP		MDQDLSDVPT		KCISTTESIE		IKARVTYIDY		EGRSDGDSIK
KIINQMKPRQ		LIIVHGPPEA		SQDLAECCRA		FGGKDIKVYM		PKLHETVDAT
SETHIYQVRL		KDSLVSSLQF		CKAKDAELAW		IDGVLDMRVS		KVDTGVILEE
GELKDDGEDS		EMQVEAPSDS		SVIAQQKAMK		SLFGDDEKET		GEESEIIPTL
EPLPPHEVPG		HQSVFMNEPR		LSDFKQVLLR		EGIQAEFVGG		VLVCNNQVAV
RRTETGRIGL		EGCLCQDFYR		IRDLLYEQYA		IV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
• Kolev N.G., Yario T.A., Benson E., Steitz J.A. (2008). Conserved motifs in both CPSF73 and CPSF100 are required to assemble the active endonuclease for histone mRNA 3'-end maturation. EMBO Rep. 9: 1013—1018. PMID 18688255 DOI:10.1038/embor.2008.146
• Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Див. також

• Хромосома 14