CRABP2

CRABP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BLR, 1BM5, 1CBQ, 1CBS, 1XCA, 2CBS, 2FR3, 2FRS, 2FS6, 2FS7, 2G78, 2G79, 2G7B, 3CBS, 3CR6, 3CWK, 3D95, 3D96, 3D97, 3F8A, 3F9D, 3FA6, 3FA7, 3FA8, 3FA9, 3FEK, 3FEL, 3FEN, 3FEP, 3I17, 4I9R, 4I9S, 4M6S, 4M7M, 4QGV, 4QGW, 4QGX, 4YBP, 4YBU, 4YKM, 4YKO, 4YCH, 4YGZ, 4YFP, 4YFQ, 4YGH, 4YH0, 4YFR, 4YCE, 4YGG, 4YDA, 4YDB, 5HZQ
Ідентифікатори
Символи	CRABP2, CRABP-II, RBP6, cellular retinoic acid binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 180231 MGI: 88491 HomoloGene: 1415 GeneCards: CRABP2
Онтологія гена Молекулярна функція • transporter activity • lipid binding • retinol binding • retinoic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retinal binding • retinoid binding Клітинна компонента • екзосома • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • Нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of collateral sprouting • retinoic acid metabolic process • embryonic forelimb morphogenesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of retinoic acid receptor signaling pathway • epidermis development • retinoic acid biosynthetic process • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1382	12904
Ensembl	ENSG00000143320	ENSMUSG00000004885
UniProt	P29373	P22935
RefSeq (мРНК)	NM_001878 NM_001199723	NM_007759
RefSeq (білок)	NP_001186652 NP_001869	NP_031785
Локус (UCSC)	Хр. 1: 156.7 – 156.71 Mb	Хр. 3: 87.86 – 87.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CRABP2 (англ. Cellular retinoic acid binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 138 амінокислот, а молекулярна маса — 15 693.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPNFSGNWKI		IRSENFEELL		KVLGVNVMLR		KIAVAAASKP		AVEIKQEGDT
FYIKTSTTVR		TTEINFKVGE		EFEEQTVDGR		PCKSLVKWES		ENKMVCEQKL
LKGEGPKTSW		TRELTNDGEL		ILTMTADDVV		CTRVYVRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з ретинолом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Eller M.S., Oleksiak M.F., McQuaid T.J., McAfee S.G., Gilchrest B.A. (1992). The molecular cloning and expression of two CRABP cDNAs from human skin. Exp. Cell Res. 198: 328—336. PMID 1309505 DOI:10.1016/0014-4827(92)90387-N
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Budhu A.S., Noy N. (2002). Direct channeling of retinoic acid between cellular retinoic acid-binding protein II and retinoic acid receptor sensitizes mammary carcinoma cells to retinoic acid-induced growth arrest. Mol. Cell. Biol. 22: 2632—2641. PMID 11909957 DOI:10.1128/MCB.22.8.2632-2641.2002
• Sessler R.J., Noy N. (2005). A ligand-activated nuclear localization signal in cellular retinoic acid binding protein-II. Mol. Cell. 18: 343—353. PMID 15866176 DOI:10.1016/j.molcel.2005.03.026
• Majumdar A., Petrescu A.D., Xiong Y., Noy N. (2011). Nuclear translocation of cellular retinoic acid-binding protein II is regulated by retinoic acid-controlled SUMOylation. J. Biol. Chem. 286: 42749—42757. PMID 21998312 DOI:10.1074/jbc.M111.293464
• Wang L., Li Y., Abildgaard F., Markley J.L., Yan H. (1998). NMR solution structure of type II human cellular retinoic acid binding protein: implications for ligand binding. Biochemistry. 37: 12727—12736. PMID 9737849 DOI:10.1021/bi9808924

Див. також

• Хромосома 1