CRYBG1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CRYBG1
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CRYBG1, ST4, AIM1, absent in melanoma 1, crystallin beta-gamma domain containing 1
Зовнішні ІД OMIM: 601797 MGI: 109544 HomoloGene: 18168 GeneCards: CRYBG1
Пов'язані генетичні захворювання
інсульт, цереброваскулярні хвороби[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001624
NM_001371242
NM_172393
NM_001368305
NM_001368306
RefSeq (білок)
NP_001615
NP_001358171
н/д
Локус (UCSC) Хр. 6: 106.36 – 106.57 Mb Хр. 10: 43.83 – 44.02 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CRYBG1 (англ. Crystallin beta-gamma domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 723 амінокислот, а молекулярна маса — 188 676[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEKRSSGRRSGRRRGSQKSTDSPGADAELPESAARDDAVFDDEVAPNAAS
DNASAEKKVKSPRAALDGGVASAASPESKPSPGTKGQLRGESDRSKQPPP
ASSPTKRKGRSRALEAVPAPPASGPRAPAKESPPKRVPDPSPVTKGTAAE
SGEEAARAIPRELPVKSSSLLPEIKPEHKRGPLPNHFNGRAEGGRSRELG
RAAGAPGASDADGLKPRNHFGVGRSTVTTKVTLPAKPKHVELNLKTPKNL
DSLGNEHNPFSQPVHKGNTATKISLFENKRTNSSPRHTDIRGQRNTPASS
KTFVGRAKLNLAKKAKEMEQPEKKVMPNSPQNGVLVKETAIETKVTVSEE
EILPATRGMNGDSSENQALGPQPNQDDKADVQTDAGCLSEPVASALIPVK
DHKLLEKEDSEAADSKSLVLENVTDTAQDIPTTVDTKDLPPTAMPKPQHT
FSDSQSPAESSPGPSLSLSAPAPGDVPKDTCVQSPISSFPCTDLKVSENH
KGCVLPVSRQNNEKMPLLELGGETTPPLSTERSPEAVGSECPSRVLVQVR
SFVLPVESTQDVSSQVIPESSEVREVQLPTCHSNEPEVVSVASCAPPQEE
VLGNEHSHCTAELAAKSGPQVIPPASEKTLPIQAQSQGSRTPLMAESSPT
NSPSSGNHLATPQRPDQTVTNGQDSPASLLNISAGSDDSVFDSSSDMEKF
TEIIKQMDSAVCMPMKRKKARMPNSPAPHFAMPPIHEDHLEKVFDPKVFT
FGLGKKKESQPEMSPALHLMQNLDTKSKLRPKRASAEQSVLFKSLHTNTN
GNSEPLVMPEINDKENRDVTNGGIKRSRLEKSALFSSLLSSLPQDKIFSP
SVTSVNTMTTAFSTSQNGSLSQSSVSQPTTEGAPPCGLNKEQSNLLPDNS
LKVFNFNSSSTSHSSLKSPSHMEKYPQKEKTKEDLDSRSNLHLPETKFSE
LSKLKNDDMEKANHIESVIKSNLPNCANSDTDFMGLFKSSRYDPSISFSG
MSLSDTMTLRGSVQNKLNPRPGKVVIYSEPDVSEKCIEVFSDIQDCSSWS
LSPVILIKVVRGCWILYEQPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDILERHE
EAESDKPVVIGSIRHVVQDYRVSHIDLFTEPEGLGILSSYFDDTEEMQGF
GVMQKTCSMKVHWGTWLIYEEPGFQGVPFILEPGEYPDLSFWDTEEAYIG
SMRPLKMGGRKVEFPTDPKVVVYEKPFFEGKCVELETGMCSFVMEGGETE
EATGDDHLPFTSVGSMKVLRGIWVAYEKPGFTGHQYLLEEGEYRDWKAWG
GYNGELQSLRPILGDFSNAHMIMYSEKNFGSKGSSIDVLGIVANLKETGY
GVKTQSINVLSGVWVAYENPDFTGEQYILDKGFYTSFEDWGGKNCKISSV
QPICLDSFTGPRRRNQIHLFSEPQFQGHSQSFEETTSQIDDSFSTKSCRV
SGGSWVVYDGENFTGNQYVLEEGHYPCLSAMGCPPGATFKSLRFIDVEFS
EPTIILFEREDFKGKKIELNAETVNLRSLGFNTQIRSVQVIGGIWVTYEY
GSYRGRQFLLSPAEVPNWYEFSGCRQIGSLRPFVQKRIYFRLRNKATGLF
MSTNGNLEDLKLLRIQVMEDVGADDQIWIYQEGCIKCRIAEDCCLTIVGS
LVTSGSKLGLALDQNADSQFWSLKSDGRIYSKLKPNLVLDIKGGTQYDQN
HIILNTVSKEKFTQVWEAMVLYT

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами.

Література[ред. | ред. код]

  • Ray M.E., Wistow G., Su Y.A., Meltzer P.S., Trent J.M. (1997). AIM1, a novel non-lens member of the betagamma-crystallin superfamily, is associated with the control of tumorigenicity in human malignant melanoma.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 3229 — 3234.  PMID 9096375 DOI:10.1073/pnas.94.7.3229
  • Aravind P., Wistow G., Sharma Y., Sankaranarayanan R. (2008). Exploring the limits of sequence and structure in a variant betagamma-crystallin domain of the protein absent in melanoma-1 (AIM1).. J. Mol. Biol. 381: 509 — 518.  PMID 18582473 DOI:10.1016/j.jmb.2008.06.019

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CRYBG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:356 (англ.). Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. 
  5. UniProt, Q9Y4K1 (англ.). Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]