DDX3Y

DDX3Y
Ідентифікатори
Символи	DDX3Y, DBY, DEAD-box helicase 3, Y-linked, DEAD-box helicase 3 Y-linked
Зовнішні ІД	OMIM: 400010 MGI: 1349406 HomoloGene: 55839 GeneCards: DDX3Y
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • ядерце Біологічний процес • translational initiation • регуляція експресії генів • RNA secondary structure unwinding • chromosome segregation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8653	26900
Ensembl	ENSG00000067048	ENSMUSG00000069045
UniProt	O15523	Q62095
RefSeq (мРНК)	NM_001122665 NM_001302552 NM_004660 NM_001324195	NM_012008
RefSeq (білок)	NP_001116137 NP_001289481 NP_001311124 NP_004651	NP_036138
Локус (UCSC)	Хр. Y: 12.9 – 12.92 Mb	Хр. Y: 1.26 – 1.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX3Y (англ. DEAD-box helicase 3, Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 73 154.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSHVVVKNDP		ELDQQLANLD		LNSEKQSGGA		STASKGRYIP		PHLRNREASK
GFHDKDSSGW		SCSKDKDAYS		SFGSRDSRGK		PGYFSERGSG		SRGRFDDRGR
SDYDGIGNRE		RPGFGRFERS		GHSRWCDKSV		EDDWSKPLPP		SERLEQELFS
GGNTGINFEK		YDDIPVEATG		SNCPPHIENF		SDIDMGEIIM		GNIELTRYTR
PTPVQKHAIP		IIKGKRDLMA		CAQTGSGKTA		AFLLPILSQI		YTDGPGEALK
AVKENGRYGR		RKQYPISLVL		APTRELAVQI		YEEARKFSYR		SRVRPCVVYG
GADIGQQIRD		LERGCHLLVA		TPGRLVDMME		RGKIGLDFCK		YLVLDEADRM
LDMGFEPQIR		RIVEQDTMPP		KGVRHTMMFS		ATFPKEIQML		ARDFLDEYIF
LAVGRVGSTS		ENITQKVVWV		EDLDKRSFLL		DILGATGSDS		LTLVFVETKK
GADSLEDFLY		HEGYACTSIH		GDRSQRDREE		ALHQFRSGKS		PILVATAVAA
RGLDISNVRH		VINFDLPSDI		EEYVHRIGRT		GRVGNLGLAT		SFFNEKNMNI
TKDLLDLLVE		AKQEVPSWLE		NMAYEHHYKG		GSRGRSKSNR		FSGGFGARDY
RQSSGSSSSG		FGASRGSSSR		SGGGGYGNSR		GFGGGGYGGF		YNSDGYGGNY
NSQGVDWWGN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lahn B.T., Page D.C. (1997). Functional coherence of the human Y chromosome. Science. 278: 675—680. PMID 9381176 DOI:10.1126/science.278.5338.675
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sekiguchi T., Iida H., Fukumura J., Nishimoto T. (2004). Human DDX3Y, the Y-encoded isoform of RNA helicase DDX3, rescues a hamster temperature-sensitive ET24 mutant cell line with a DDX3X mutation. Exp. Cell Res. 300: 213—222. PMID 15383328 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.07.005
• Ditton H.J., Zimmer J., Kamp C., Rajpert-De Meyts E., Vogt P.H. (2004). The AZFa gene DBY (DDX3Y) is widely transcribed but the protein is limited to the male germ cells by translation control. Hum. Mol. Genet. 13: 2333—2341. PMID 15294876 DOI:10.1093/hmg/ddh240
• Goulet I., Boisvenue S., Mokas S., Mazroui R., Cote J. (2008). TDRD3, a novel Tudor domain-containing protein, localizes to cytoplasmic stress granules. Hum. Mol. Genet. 17: 3055—3074. PMID 18632687 DOI:10.1093/hmg/ddn203

Див. також

• Хромосома Y