DDX59

DDX59
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YQP
Ідентифікатори
Символи	DDX59, OFD5, ZNHIT5, DEAD-box helicase 59
Зовнішні ІД	OMIM: 615464 MGI: 1915247 HomoloGene: 12222 GeneCards: DDX59
Пов'язані генетичні захворювання
orofaciodigital syndrome V
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма • мембрана • integral component of membrane Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83479	67997
Ensembl	ENSG00000118197	ENSMUSG00000026404
UniProt	Q5T1V6 Q5T1W1	Q9DBN9
RefSeq (мРНК)	NM_001031725 NM_031306 NM_001320181 NM_001320182 NM_001349799 NM_001349800 NM_001349801 NM_001349802 NM_001349803 NM_001349804	NM_026500 NM_178052
RefSeq (білок)	NP_001026895 NP_001307110 NP_001307111 NP_001336728 NP_001336729 NP_001336730 NP_001336731 NP_001336732 NP_001336733	NP_080776
Локус (UCSC)	Хр. 1: 200.62 – 200.67 Mb	Хр. 1: 136.34 – 136.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX59 (англ. DEAD-box helicase 59) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 68 810.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFVPRSLKIK		RNANDDGKSC		VAKIIKPDPE		DLQLDKSRDV		PVDAVATEAA
TIDRHISESC		PFPSPGGQLA		EVHSVSPEQG		AKDSHPSEEP		VKSFSKTQRW
AEPGEPICVV		CGRYGEYICD		KTDEDVCSLE		CKAKHLLQVK		EKEEKSKLSN
PQKADSEPES		PLNASYVYKE		HPFILNLQED		QIENLKQQLG		ILVQGQEVTR
PIIDFEHCSL		PEVLNHNLKK		SGYEVPTPIQ		MQMIPVGLLG		RDILASADTG
SGKTAAFLLP		VIMRALFESK		TPSALILTPT		RELAIQIERQ		AKELMSGLPR
MKTVLLVGGL		PLPPQLYRLQ		QHVKVIIATP		GRLLDIIKQS		SVELCGVKIV
VVDEADTMLK		MGFQQQVLDI		LENIPNDCQT		ILVSATIPTS		IEQLASQLLH
NPVRIITGEK		NLPCANVRQI		ILWVEDPAKK		KKLFEILNDK		KLFKPPVLVF
VDCKLGADLL		SEAVQKITGL		KSISIHSEKS		QIERKNILKG		LLEGDYEVVV
STGVLGRGLD		LISVRLVVNF		DMPSSMDEYV		HQIGRVGRLG		QNGTAITFIN
NNSKRLFWDI		AKRVKPTGSI		LPPQLLNSPY		LHDQKRKEQQ		KDKQTQNDLV
TGANLMDIIR		KHDKSNSQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1