DHX15

DHX15
Ідентифікатори
Символи	DHX15, DBP1, DDX15, HRH2, PRP43, PRPF43, PrPp43p, DEAH-box helicase 15, hPrp43
Зовнішні ІД	OMIM: 603403 MGI: 1099786 HomoloGene: 1040 GeneCards: DHX15
Пов'язані генетичні захворювання
короткозорість
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA helicase activity • nucleotide binding • double-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity Клітинна компонента • U12-type spliceosomal complex • ядерце • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • цитоплазма • клітинне ядро • Нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • mRNA processing • response to alkaloid • response to toxic substance • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1665	13204
Ensembl	ENSG00000109606	ENSMUSG00000029169
UniProt	O43143	O35286
RefSeq (мРНК)	NM_001358	NM_001042620 NM_007839
RefSeq (білок)	NP_001349	NP_001036085 NP_031865
Локус (UCSC)	Хр. 4: 24.52 – 24.58 Mb	Хр. 5: 52.31 – 52.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DHX15 (англ. DEAH-box helicase 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 795 амінокислот, а молекулярна маса — 90 933.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKRHRLDLG		EDYPSGKKRA		GTDGKDRDRD		RDREDRSKDR		DRERDRGDRE
REREKEKEKE		LRASTNAMLI		SAGLPPLKAS		HSAHSTHSAH		STHSTHSAHS
THAGHAGHTS		LPQCINPFTN		LPHTPRYYDI		LKKRLQLPVW		EYKDRFTDIL
VRHQSFVLVG		ETGSGKTTQI		PQWCVEYMRS		LPGPKRGVAC		TQPRRVAAMS
VAQRVADEMD		VMLGQEVGYS		IRFEDCSSAK		TILKYMTDGM		LLREAMNDPL
LERYGVIILD		EAHERTLATD		ILMGVLKEVV		RQRSDLKVIV		MSATLDAGKF
QIYFDNCPLL		TIPGRTHPVE		IFYTPEPERD		YLEAAIRTVI		QIHMCEEEEG
DLLLFLTGQE		EIDEACKRIK		REVDDLGPEV		GDIKIIPLYS		TLPPQQQQRI
FEPPPPKKQN		GAIGRKVVVS		TNIAETSLTI		DGVVFVIDPG		FAKQKVYNPR
IRVESLLVTA		ISKASAQQRA		GRAGRTRPGK		CFRLYTEKAY		KTEMQDNTYP
EILRSNLGSV		VLQLKKLGID		DLVHFDFMDP		PAPETLMRAL		ELLNYLAALN
DDGDLTELGS		MMAEFPLDPQ		LAKMVIASCD		YNCSNEVLSI		TAMLSVPQCF
VRPTEAKKAA		DEAKMRFAHI		DGDHLTLLNV		YHAFKQNHES		VQWCYDNFIN
YRSLMSADNV		RQQLSRIMDR		FNLPRRSTDF		TSRDYYINIR		KALVTGYFMQ
VAHLERTGHY		LTVKDNQVVQ		LHPSTVLDHK		PEWVLYNEFV		LTTKNYIRTC
TDIKPEWLVK		IAPQYYDMSN		FPQCEAKRQL		DRIIAKLQSK		EYSQY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Imamura O., Sugawara M., Furuichi Y. (1997). Cloning and characterization of a putative human RNA helicase gene of the DEAH-box protein family. Biochem. Biophys. Res. Commun. 240: 335—340. PMID 9388478 DOI:10.1006/bbrc.1997.7585
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoshimoto R., Kataoka N., Okawa K., Ohno M. (2009). Isolation and characterization of post-splicing lariat-intron complexes. Nucleic Acids Res. 37: 891—902. PMID 19103666 DOI:10.1093/nar/gkn1002
• Ahmad Y., Boisvert F.M., Lundberg E., Uhlen M., Lamond A.I. (2012). Systematic analysis of protein pools, isoforms, and modifications affecting turnover and subcellular localization. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.013680.01 — M111.013680.15. PMID 22002106 DOI:10.1074/mcp.M111.013680

Див. також

• Хромосома 4