DLC1

DLC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DKY, 2GYT, 2KAP, 2LOZ, 3KUQ, 5FZT
Ідентифікатори
Символи	DLC1, ARHGAP7, HP, STARD12, p122-RhoGAP, DLC1 Rho GTPase activating protein
Зовнішні ІД	OMIM: 604258 MGI: 1354949 HomoloGene: 4442 GeneCards: DLC1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, біполярний афективний розлад
Онтологія гена Молекулярна функція • SH2 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • ruffle membrane • Міжклітинні контакти • cortical actin cytoskeleton • caveola • клітинне ядро • цитоплазма • focal adhesion Біологічний процес • positive regulation of execution phase of apoptosis • regulation of actin cytoskeleton organization • positive regulation of protein dephosphorylation • negative regulation of Rho protein signal transduction • heart morphogenesis • focal adhesion assembly • neural tube closure • regulation of cell shape • hindbrain morphogenesis • forebrain development • negative regulation of stress fiber assembly • regulation of Rho protein signal transduction • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • negative regulation of focal adhesion assembly • actin cytoskeleton organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of cell migration • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10395	50768
Ensembl	ENSG00000164741 ENSG00000288673	ENSMUSG00000031523
UniProt	Q96QB1	Q9R0Z9
RefSeq (мРНК)	NM_001164271 NM_001316668 NM_006094 NM_024767 NM_182643 NM_001348081 NM_001348082 NM_001348083 NM_001348084	NM_001194940 NM_001194941 NM_015802 NM_178735
RefSeq (білок)	NP_001157743 NP_001303597 NP_006085 NP_079043 NP_872584 NP_001335010 NP_001335011 NP_001335012 NP_001335013	NP_001181869 NP_001181870 NP_056617
Локус (UCSC)	Хр. 8: 13.08 – 13.6 Mb	Хр. 8: 37.03 – 37.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DLC1 (англ. DLC1 Rho GTPase activating protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 528 амінокислот, а молекулярна маса — 170 591.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVAIRKRSW		EEHVTHWMGQ		PFNSDDRNTA		CHHGLVADSL		QASMEKDATL
NVDRKEKCVS		LPDCCHGSEL		RDFPGRPMGH		LSKDVDENDS		HEGEDQFLSL
EASTETLVHV		SDEDNNADLC		LTDDKQVLNT		QGQKTSGQHM		IQGAGSLEKA
LPIIQSNQVS		SNSWGIAGET		ELALVKESGE		RKVTDSISKS		LELCNEISLS
EIKDAPKVNA		VDTLNVKDIA		PEKQLLNSAV		IAQQRRKPDP		PKDENERSTC
NVVQNEFLDT		PCTNRGLPLL		KTDFGSCLLQ		PPSCPNGMSA		ENGLEKSGFS
QHQNKSPPKV		KAEDGMQCLQ		LKETLATQEP		TDNQVRLRKR		KEIREDRDRA
RLDSMVLLIM		KLDQLDQDIE		NALSTSSSPS		GTPTNLRRHV		PDLESGSESG
ADTISVNQTR		VNLSSDTEST		DLPSSTPVAN		SGTKPKTTAI		QGISEKEKAE
IEAKEACDWL		RATGFPQYAQ		LYEDFLFPID		ISLVKREHDF		LDRDAIEALC
RRLNTLNKCA		VMKLEISPHR		KRSDDSDEDE		PCAISGKWTF		QRDSKRWSRL
EEFDVFSPKQ		DLVPGSPDDS		HPKDGPSPGG		TLMDLSERQE		VSSVRSLSST
GSLPSHAPPS		EDAATPRTNS		VISVCSSSNL		AGNDDSFGSL		PSPKELSSFS
FSMKGHEKTA		KSKTRSLLKR		MESLKLKSSH		HSKHKAPSKL		GLIISGPILQ
EGMDEEKLKQ		LNCVEISALN		GNRINVPMVR		KRSVSNSTQT		SSSSSQSETS
SAVSTPSPVT		RTRSLSACNK		RVGMYLEGFD		PFNQSTFNNV		VEQNFKNRES
YPEDTVFYIP		EDHKPGTFPK		ALTNGSFSPS		GNNGSVNWRT		GSFHGPGHIS
LRRENSSDSP		KELKRRNSSS		SMSSRLSIYD		NVPGSILYSS		SGDLADLENE
DIFPELDDIL		YHVKGMQRIV		NQWSEKFSDE		GDSDSALDSV		SPCPSSPKQI
HLDVDNDRTT		PSDLDSTGNS		LNEPEEPSEI		PERRDSGVGA		SLTRSNRHRL
RWHSFQSSHR		PSLNSVSLQI		NCQSVAQMNL		LQKYSLLKLT		ALLEKYTPSN
KHGFSWAVPK		FMKRIKVPDY		KDRSVFGVPL		TVNVQRTGQP		LPQSIQQAMR
YLRNHCLDQV		GLFRKSGVKS		RIQALRQMNE		GAIDCVNYEG		QSAYDVADML
KQYFRDLPEP		LMTNKLSETF		LQIYQYVPKD		QRLQAIKAAI		MLLPDENREV
LQTLLYFLSD		VTAAVKENQM		TPTNLAVCLA		PSLFHLNTLK		RENSSPRVMQ
RKQSLGKPDQ		KDLNENLAAT		QGLAHMIAEC		KKLFQVPEEM		SRCRNSYTEQ
ELKPLTLEAL		GHLGNDDSAD		YQHFLQDCVD		GLFKEVKEKF		KGWVSYSTSE
QAELSYKKVS		EGPPLRLWRS		VIEVPAVPEE		ILKRLLKEQH		LWDVDLLDSK
VIEILDSQTE		IYQYVQNSMA		PHPARDYVVL		RTWRTNLPKG		ACALLLTSVD
HDRAPVVGVR		VNVLLSRYLI		EPCGPGKSKL		TYMCRVDLRG		HMPEWYTKSF
GHLCAAEVVK		IRDSFSNQNT		ETKDTKSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang S., Noble C.G., Yang D. (2009). Characterization of DLC1-SAM equilibrium unfolding at the amino acid residue level. Biochemistry. 48: 4040—4049. PMID 19317456 DOI:10.1021/bi9000936

Див. також

• Хромосома 8