DOCK8

DOCK8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VHL
Ідентифікатори
Символи	DOCK8, HEL-205, MRD2, ZIR8, Dock8, dedicator of cytokinesis 8
Зовнішні ІД	OMIM: 611432 MGI: 1921396 HomoloGene: 52414 GeneCards: DOCK8
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • гіалоплазма • cell leading edge • leading edge membrane • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • lamellipodium membrane • cell projection • внутрішньоклітинний Біологічний процес • negative regulation of T cell apoptotic process • small GTPase mediated signal transduction • immunological synapse formation • зсідання крові • memory T cell proliferation • dendritic cell migration • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of establishment of T cell polarity • cellular response to chemokine • positive regulation of T cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81704	76088
Ensembl	ENSG00000107099	ENSMUSG00000052085
UniProt	Q8NF50	Q8C147
RefSeq (мРНК)	NM_001190458 NM_001193536 NM_203447	NM_028785 NM_175233
RefSeq (білок)	NP_001177387 NP_001180465 NP_982272 NP_001180465.1	NP_083061
Локус (UCSC)	Хр. 9: 0.21 – 0.47 Mb	Хр. 19: 24.98 – 25.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DOCK8 (англ. Dedicator of cytokinesis 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 099 амінокислот, а молекулярна маса — 238 529.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATLPSAERR		AFALKINRYS		SAEIRKQFTL		PPNLGQYHRQ		SISTSGFPSL
QLPQFYDPVE		PVDFEGLLMT		HLNSLDVQLA		QELGDFTDDD		LDVVFTPKEC
RTLQPSLPEE		GVELDPHVRD		CVQTYIREWL		IVNRKNQGSP		EICGFKKTGS
RKDFHKTLPK		QTFESETLEC		SEPAAQAGPR		HLNVLCDVSG		KGPVTACDFD
LRSLQPDKRL		ENLLQQVSAE		DFEKQNEEAR		RTNRQAELFA		LYPSVDEEDA
VEIRPVPECP		KEHLGNRILV		KLLTLKFEIE		IEPLFASIAL		YDVKERKKIS
ENFHCDLNSD		QFKGFLRAHT		PSVAASSQAR		SAVFSVTYPS		SDIYLVVKIE
KVLQQGEIGD		CAEPYTVIKE		SDGGKSKEKI		EKLKLQAESF		CQRLGKYRMP
FAWAPISLSS		FFNVSTLERE		VTDVDSVVGR		SSVGERRTLA		QSRRLSERAL
SLEENGVGSN		FKTSTLSVSS		FFKQEGDRLS		DEDLFKFLAD		YKRSSSLQRR
VKSIPGLLRL		EISTAPEIIN		CCLTPEMLPV		KPFPENRTRP		HKEILEFPTR
EVYVPHTVYR		NLLYVYPQRL		NFVNKLASAR		NITIKIQFMC		GEDASNAMPV
IFGKSSGPEF		LQEVYTAVTY		HNKSPDFYEE		VKIKLPAKLT		VNHHLLFTFY
HISCQQKQGA		SVETLLGYSW		LPILLNERLQ		TGSYCLPVAL		EKLPPNYSMH
SAEKVPLQNP		PIKWAEGHKG		VFNIEVQAVS		SVHTQDNHLE		KFFTLCHSLE
SQVTFPIRVL		DQKISEMALE		HELKLSIICL		NSSRLEPLVL		FLHLVLDKLF
QLSVQPMVIA		GQTANFSQFA		FESVVAIANS		LHNSKDLSKD		QHGRNCLLAS
YVHYVFRLPE		VQRDVPKSGA		PTALLDPRSY		HTYGRTSAAA		VSSKLLQARV
MSSSNPDLAG		THSAADEEVK		NIMSSKIADR		NCSRMSYYCS		GSSDAPSSPA
APRPASKKHF		HEELALQMVV		STGMVRETVF		KYAWFFFELL		VKSMAQHVHN
MDKRDSFRRT		RFSDRFMDDI		TTIVNVVTSE		IAALLVKPQK		ENEQAEKMNI
SLAFFLYDLL		SLMDRGFVFN		LIRHYCSQLS		AKLSNLPTLI		SMRLEFLRIL
CSHEHYLNLN		LFFMNADTAP		TSPCPSISSQ		NSSSCSSFQD		QKIASMFDLT
SEYRQQHFLT		GLLFTELAAA		LDAEGEGISK		VQRKAVSAIH		SLLSSHDLDP
RCVKPEVKVK		IAALYLPLVG		IILDALPQLC		DFTVADTRRY		RTSGSDEEQE
GAGAINQNVA		LAIAGNNFNL		KTSGIVLSSL		PYKQYNMLNA		DTTRNLMICF
LWIMKNADQS		LIRKWIADLP		STQLNRILDL		LFICVLCFEY		KGKQSSDKVS
TQVLQKSRDV		KARLEEALLR		GEGARGEMMR		RRAPGNDRFP		GLNENLRWKK
EQTHWRQANE		KLDKTKAELD		QEALISGNLA		TEAHLIILDM		QENIIQASSA
LDCKDSLLGG		VLRVLVNSLN		CDQSTTYLTH		CFATLRALIA		KFGDLLFEEE
VEQCFDLCHQ		VLHHCSSSMD		VTRSQACATL		YLLMRFSFGA		TSNFARVKMQ
VTMSLASLVG		RAPDFNEEHL		RRSLRTILAY		SEEDTAMQMT		PFPTQVEELL
CNLNSILYDT		VKMREFQEDP		EMLMDLMYRI		AKSYQASPDL		RLTWLQNMAE
KHTKKKCYTE		AAMCLVHAAA		LVAEYLSMLE		DHSYLPVGSV		SFQNISSNVL
EESVVSEDTL		SPDEDGVCAG		QYFTESGLVG		LLEQAAELFS		TGGLYETVNE
VYKLVIPILE		AHREFRKLTL		THSKLQRAFD		SIVNKDHKRM		FGTYFRVGFF
GSKFGDLDEQ		EFVYKEPAIT		KLPEISHRLE		AFYGQCFGAE		FVEVIKDSTP
VDKTKLDPNK		AYIQITFVEP		YFDEYEMKDR		VTYFEKNFNL		RRFMYTTPFT
LEGRPRGELH		EQYRRNTVLT		TMHAFPYIKT		RISVIQKEEF		VLTPIEVAIE
DMKKKTLQLA		VAINQEPPDA		KMLQMVLQGS		VGATVNQGPL		EVAQVFLAEI
PADPKLYRHH		NKLRLCFKEF		IMRCGEAVEK		NKRLITADQR		EYQQELKKNY
NKLKENLRPM		IERKIPELYK		PIFRVESQKR		DSFHRSSFRK		CETQLSQGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cote J.-F., Vuori K. (2002). Identification of an evolutionarily conserved superfamily of DOCK180-related proteins with guanine nucleotide exchange activity. J. Cell Sci. 115: 4901—4913. PMID 12432077 DOI:10.1242/jcs.00219
• Griggs B.L., Ladd S., Saul R.A., DuPont B.R., Srivastava A.K. (2008). Dedicator of cytokinesis 8 is disrupted in two patients with mental retardation and developmental disabilities. Genomics. 91: 195—202. PMID 18060736 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.10.011
• Ham H., Huynh W., Schoon R.A., Vale R.D., Billadeau D.D. (2015). HkRP3 is a microtubule-binding protein regulating lytic granule clustering and NK cell killing. J. Immunol. 194: 3984—3996. PMID 25762780 DOI:10.4049/jimmunol.1402897

Див. також

• Хромосома 9