EGFLAM

EGFLAM
Ідентифікатори
Символи	EGFLAM, AGRINL, AGRNL, PIKA, EGF like, fibronectin type III and laminin G domains, Smp_128580.1
Зовнішні ІД	OMIM: 617683 MGI: 2146149 HomoloGene: 65044 GeneCards: EGFLAM
Онтологія гена Молекулярна функція • glycosaminoglycan binding • calcium ion binding Клітинна компонента • extracellular region • Базальна мембрана • Міжклітинні контакти • interstitial matrix • синапс • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • peptide cross-linking via chondroitin 4-sulfate glycosaminoglycan • extracellular matrix organization • positive regulation of cell-substrate adhesion • animal organ morphogenesis • Гістогенез • cell migration • substrate adhesion-dependent cell spreading Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	133584	268780
Ensembl	ENSG00000164318	ENSMUSG00000042961
UniProt	Q63HQ2	Q4VBE4
RefSeq (мРНК)	NM_182801 NM_001205301 NM_152403 NM_182798 NM_182799	NM_001289496 NM_001289498 NM_178748
RefSeq (білок)	NP_001192230 NP_689616 NP_877950 NP_877953	NP_001276425 NP_001276427 NP_848863
Локус (UCSC)	Хр. 5: 38.26 – 38.47 Mb	Хр. 15: 7.24 – 7.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EGFLAM (англ. EGF like, fibronectin type III and laminin G domains) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 017 амінокислот, а молекулярна маса — 111 271.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLIRGVLLR		LLLLASSLGP		GAVSLRAAIR		KPGKVGPPLD		IKLGALNCTA
FSIQWKMPRH		PGSPILGYTV		FYSEVGADKS		LQEQLHSVPL		SRDIPTTEEV
IGDLKPGTEY		RVSIAAYSQA		GKGRLSSPRH		VTTLSQDSCL		PPAAPQQPHV
IVVSDSEVAL		SWKPGASEGS		APIQYYSVEF		IRPDFDKKWT		SIHERIQMDS
MVIKGLDPDT		NYQFAVRAMN		SHGPSPRSWP		SDIIRTLCPE		EAGSGRYGPR
YITDMGAGED		DEGFEDDLDL		DISFEEVKPL		PATKGGNKKF		LVESKKMSIS
NPKTISRLIP		PTSASLPVTT		VAPQPIPIQR		KGKNGVAIMS		RLFDMPCDET
LCSADSFCVN		DYTWGGSRCQ		CTLGKGGESC		SEDIVIQYPQ		FFGHSYVTFE
PLKNSYQAFQ		ITLEFRAEAE		DGLLLYCGEN		EHGRGDFMSL		AIIRRSLQFR
FNCGTGVAII		VSETKIKLGG		WHTVMLYRDG		LNGLLQLNNG		TPVTGQSQGQ
YSKITFRTPL		YLGGAPSAYW		LVRATGTNRG		FQGCVQSLAV		NGRRIDMRPW
PLGKALSGAD		VGECSSGICD		EASCIHGGTC		TAIKADSYIC		LCPLGFKGRH
CEDAFTLTIP		QFRESLRSYA		ATPWPLEPQH		YLSFMEFEIT		FRPDSGDGVL
LYSYDTGSKD		FLSINLAGGH		VEFRFDCGSG		TGVLRSEDPL		TLGNWHELRV
SRTAKNGILQ		VDKQKIVEGM		AEGGFTQIKC		NTDIFIGGVP		NYDDVKKNSG
VLKPFSGSIQ		KIILNDRTIH		VKHDFTSGVN		VENAAHPCVR		APCAHGGSCR
PRKEGYDCDC		PLGFEGLHCQ		KECGNYCLNT		IIEAIEIPQF		IGRSYLTYDN
PDILKRVSGS		RSNVFMRFKT		TAKDGLLLWR		GDSPMRPNSD		FISLGLRDGA
LVFSYNLGSG		VASIMVNGSF		NDGRWHRVKA		VRDGQSGKIT		VDDYGARTGK
SPGMMRQLNI		NGALYVGGMK		EIALHTNRQY		MRGLVGCISH		FTLSTDYHIS
LVEDAVDGKN		INTCGAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинних контактах, позаклітинному матриксі, синапсах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5