EPHB6

EPHB6
Ідентифікатори
Символи	EPHB6, HEP, EPH receptor B6
Зовнішні ІД	OMIM: 602757 MGI: 1096338 HomoloGene: 20940 GeneCards: EPHB6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ephrin receptor activity • signaling receptor activity • protein tyrosine kinase activity • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity • transmembrane-ephrin receptor activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • гіалоплазма • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • цитоплазма • neuron projection • receptor complex Біологічний процес • protein phosphorylation • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • ephrin receptor signaling pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2051	13848
Ensembl	ENSG00000106123 ENSG00000275482	ENSMUSG00000029869
UniProt	O15197	O08644
RefSeq (мРНК)	NM_001280794 NM_001280795 NM_004445	NM_001146351 NM_007680
RefSeq (білок)	NP_001267723 NP_001267724 NP_004436	NP_001139823 NP_031706
Локус (UCSC)	Хр. 7: 142.86 – 142.87 Mb	Хр. 6: 41.58 – 41.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EPHB6 (англ. EPH receptor B6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 021 амінокислот, а молекулярна маса — 110 700.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATEGAAQLG		NRVAGMVCSL		WVLLLVSSVL		ALEEVLLDTT		GETSEIGWLT
YPPGGWDEVS		VLDDQRRLTR		TFEACHVAGA		PPGTGQDNWL		QTHFVERRGA
QRAHIRLHFS		VRACSSLGVS		GGTCRETFTL		YYRQAEEPDS		PDSVSSWHLK
RWTKVDTIAA		DESFPSSSSS		SSSSSSAAWA		VGPHGAGQRA		GLQLNVKERS
FGPLTQRGFY		VAFQDTGACL		ALVAVRLFSY		TCPAVLRSFA		SFPETQASGA
GGASLVAAVG		TCVAHAEPEE		DGVGGQAGGS		PPRLHCNGEG		KWMVAVGGCR
CQPGYQPARG		DKACQACPRG		LYKSSAGNAP		CSPCPARSHA		PNPAAPVCPC
LEGFYRASSD		PPEAPCTGPP		SAPQELWFEV		QGSALMLHWR		LPRELGGRGD
LLFNVVCKEC		EGRQEPASGG		GGTCHRCRDE		VHFDPRQRGL		TESRVLVGGL
RAHVPYILEV		QAVNGVSELS		PDPPQAAAIN		VSTSHEVPSA		VPVVHQVSRA
SNSITVSWPQ		PDQTNGNILD		YQLRYYDQAE		DESHSFTLTS		ETNTATVTQL
SPGHIYGFQV		RARTAAGHGP		YGGKVYFQTL		PQGELSSQLP		ERLSLVIGSI
LGALAFLLLA		AITVLAVVFQ		RKRRGTGYTE		QLQQYSSPGL		GVKYYIDPST
YEDPCQAIRE		LAREVDPAYI		KIEEVIGTGS		FGEVRQGRLQ		PRGRREQTVA
IQALWAGGAE		SLQMTFLGRA		AVLGQFQHPN		ILRLEGVVTK		SRPLMVLTEF
MELGPLDSFL		RQREGQFSSL		QLVAMQRGVA		AAMQYLSSFA		FVHRSLSAHS
VLVNSHLVCK		VARLGHSPQG		PSCLLRWAAP		EVIAHGKHTT		SSDVWSFGIL
MWEVMSYGER		PYWDMSEQEV		LNAIEQEFRL		PPPPGCPPGL		HLLMLDTWQK
DRARRPHFDQ		LVAAFDKMIR		KPDTLQAGGD		PGERPSQALL		TPVALDFPCL
DSPQAWLSAI		GLECYQDNFS		KFGLCTFSDV		AQLSLEDLPA		LGITLAGHQK
KLLHHIQLLQ		QHLRQQGSVE		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Freywald A., Sharfe N., Roifman C.M. (2002). The kinase-null EphB6 receptor undergoes transphosphorylation in a complex with EphB1. J. Biol. Chem. 277: 3823—3828. PMID 11713248 DOI:10.1074/jbc.M108011200
• Freywald A., Sharfe N., Rashotte C., Grunberger T., Roifman C.M. (2003). The EphB6 receptor inhibits JNK activation in T lymphocytes and modulates T cell receptor-mediated responses. J. Biol. Chem. 278: 10150—10156. PMID 12517763 DOI:10.1074/jbc.M208179200
• Matsuoka H., Obama H., Kelly M.L., Matsui T., Nakamoto M. (2005). Biphasic functions of the kinase-defective Ephb6 receptor in cell adhesion and migration. J. Biol. Chem. 280: 29355—29363. PMID 15955811 DOI:10.1074/jbc.M500010200
• Fox B.P., Kandpal R.P. (2009). EphB6 receptor significantly alters invasiveness and other phenotypic characteristics of human breast carcinoma cells. Oncogene. 28: 1706—1713. PMID 19234485 DOI:10.1038/onc.2009.18

Див. також

• Хромосома 7