EWSR1

EWSR1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CPE
Ідентифікатори
Символи	EWSR1, EWS, bK984G1.4, EWS-FLI1, Ewing sarcoma breakpoint region 1, EWS RNA binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 133450 HomoloGene: 136069 GeneCards: EWSR1
Пов'язані генетичні захворювання
Angiomatoid fibrous histiocytoma
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • identical protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинна мембрана • ядерце • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2130	323597
Ensembl	ENSG00000182944	н/д
UniProt	Q01844	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001163285 NM_001163286 NM_001163287 NM_005243 NM_013986	NM_001115138
RefSeq (білок)	NP_001156757 NP_001156758 NP_001156759 NP_005234 NP_053733	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 22: 29.27 – 29.3 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EWSR1 (англ. EWS RNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 656 амінокислот, а молекулярна маса — 68 478.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASTDYSTYS		QAAAQQGYSA		YTAQPTQGYA		QTTQAYGQQS		YGTYGQPTDV
SYTQAQTTAT		YGQTAYATSY		GQPPTGYTTP		TAPQAYSQPV		QGYGTGAYDT
TTATVTTTQA		SYAAQSAYGT		QPAYPAYGQQ		PAATAPTRPQ		DGNKPTETSQ
PQSSTGGYNQ		PSLGYGQSNY		SYPQVPGSYP		MQPVTAPPSY		PPTSYSSTQP
TSYDQSSYSQ		QNTYGQPSSY		GQQSSYGQQS		SYGQQPPTSY		PPQTGSYSQA
PSQYSQQSSS		YGQQSSFRQD		HPSSMGVYGQ		ESGGFSGPGE		NRSMSGPDNR
GRGRGGFDRG		GMSRGGRGGG		RGGMGSAGER		GGFNKPGGPM		DEGPDLDLGP
PVDPDEDSDN		SAIYVQGLND		SVTLDDLADF		FKQCGVVKMN		KRTGQPMIHI
YLDKETGKPK		GDATVSYEDP		PTAKAAVEWF		DGKDFQGSKL		KVSLARKKPP
MNSMRGGLPP		REGRGMPPPL		RGGPGGPGGP		GGPMGRMGGR		GGDRGGFPPR
GPRGSRGNPS		GGGNVQHRAG		DWQCPNPGCG		NQNFAWRTEC		NQCKAPKPEG
FLPPPFPPPG		GDRGRGGPGG		MRGGRGGLMD		RGGPGGMFRG		GRGGDRGGFR
GGRGMDRGGF		GGGRRGGPGG		PPGPLMEQMG		GRRGGRGGPG		KMDKGEHRQE
RRDRPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Plougastel B., Zucman J., Peter M., Thomas G., Delattre O. (1993). Genomic structure of the EWS gene and its relationship to EWSR1, a site of tumor-associated chromosome translocation. Genomics. 18: 609—615. PMID 8307570 DOI:10.1016/S0888-7543(05)80363-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zucman-Rossi J., Legoix P., Thomas G. (1996). Identification of new members of the Gas2 and Ras families in the 22q12 chromosome region. Genomics. 38: 247—254. PMID 8975699 DOI:10.1006/geno.1996.0625
• Belyanskaya L.L., Gehrig P.M., Gehring H. (2001). Exposure on cell surface and extensive arginine methylation of Ewing sarcoma (EWS) protein. J. Biol. Chem. 276: 18681—18687. PMID 11278906 DOI:10.1074/jbc.M011446200
• Bhagirath T., Abe S., Nojima T., Yoshida M.C. (1995). Molecular analysis of a t(11;22) translocation junction in a case of Ewing's sarcoma. Genes Chromosomes Cancer. 13: 126—132. PMID 7542907 DOI:10.1002/gcc.2870130209
• Deloulme J.C., Prichard L., Delattre O., Storm D.R. (1997). The prooncoprotein EWS binds calmodulin and is phosphorylated by protein kinase C through an IQ domain. J. Biol. Chem. 272: 27369—27377. PMID 9341188 DOI:10.1074/jbc.272.43.27369

Див. також

• Хромосома 22