FXR2

FXR2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3H8Z
Ідентифікатори
Символи	FXR2, FMR1L2, FXR2P, FMR1 autosomal homolog 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605339 MGI: 1346074 HomoloGene: 21014 GeneCards: FXR2
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • protein homodimerization activity • identical protein binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • translation regulator activity Клітинна компонента • Полісома • cytosolic large ribosomal subunit • екзосома • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення • аксон • ribonucleoprotein granule • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • neuronal cell body • dendritic spine Біологічний процес • negative regulation of translation • regulation of translation • regulation of mRNA stability • positive regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9513	23879
Ensembl	ENSG00000129245	ENSMUSG00000018765
UniProt	P51116	Q9WVR4 Q6P5B5
RefSeq (мРНК)	NM_004860	NM_011814
RefSeq (білок)	NP_004851	NP_035944
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.59 – 7.61 Mb	Хр. 11: 69.52 – 69.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FXR2 (англ. FMR1 autosomal homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 673 амінокислот, а молекулярна маса — 74 223.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGLASGGDV		EPGLPVEVRG		SNGAFYKGFV		KDVHEDSVTI		FFENNWQSER
QIPFGDVRLP		PPADYNKEIT		EGDEVEVYSR		ANEQEPCGWW		LARVRMMKGD
FYVIEYAACD		ATYNEIVTLE		RLRPVNPNPL		ATKGSFFKVT		MAVPEDLREA
CSNENVHKEF		KKALGANCIF		LNITNSELFI		LSTTEAPVKR		ASLLGDMHFR
SLRTKLLLMS		RNEEATKHLE		TSKQLAAAFQ		EEFTVREDLM		GLAIGTHGAN
IQQARKVPGV		TAIELGEETC		TFRIYGETPE		ACRQARSYLE		FSEDSVQVPR
NLVGKVIGKN		GKVIQEIVDK		SGVVRVRVEG		DNDKKNPREE		GMVPFIFVGT
RENISNAQAL		LEYHLSYLQE		VEQLRLERLQ		IDEQLRQIGL		GFRPPGSGRG
SGGSDKAGYS		TDESSSSSLH		ATRTYGGSYG		GRGRGRRTGG		PAYGPSSDVS
TASETESEKR		EEPNRAGPGD		RDPPTRGEES		RRRPTGGRGR		GPPPAPRPTS
RYNSSSISSV		LKDPDSNPYS		LLDTSEPEPP		VDSEPGEPPP		ASARRRRSRR
RRTDEDRTVM		DGGLESDGPN		MTENGLEDES		RPQRRNRSRR		RRNRGNRTDG
SISGDRQPVT		VADYISRAES		QSRQRPPLER		TKPSEDSLSG		QKGDSVSKLP
KGPSENGELS		APLELGSMVN		GVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Joseph D.R. (1998). The rat androgen-binding protein (ABP/SHBG) gene contains triplet repeats similar to unstable triplets: evidence that the ABP/SHBG and the fragile X-related 2 genes overlap. Steroids. 63: 2—4. PMID 9437788 DOI:10.1016/S0039-128X(97)00087-1
• Siomi M.C., Zhang Y., Siomi H., Dreyfuss G. (1996). Specific sequences in the fragile X syndrome protein FMR1 and the FXR proteins mediate their binding to 60S ribosomal subunits and the interactions among them. Mol. Cell. Biol. 16: 3825—3832. PMID 8668200 DOI:10.1128/MCB.16.7.3825
• Laggerbauer B., Ostareck D., Keidel E.M., Ostareck-Lederer A., Fischer U. (2001). Evidence that fragile X mental retardation protein is a negative regulator of translation. Hum. Mol. Genet. 10: 329—338. PMID 11157796 DOI:10.1093/hmg/10.4.329

Див. також

• Хромосома 17