GABARAPL1

GABARAPL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L8J, 2R2Q
Ідентифікатори
Символи	GABARAPL1, APG8-LIKE, APG8L, ATG8, ATG8B, ATG8L, GEC1, GABA type A receptor associated protein like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607420 MGI: 1914980 HomoloGene: 134420 GeneCards: GABARAPL1
Онтологія гена Молекулярна функція • GABA receptor binding • Tat protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинний • dendrite membrane • autophagosome • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • dendrite cytoplasm • мікротрубочка • Цитоскелет • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • autophagosome membrane • гіалоплазма Біологічний процес • Автофагія • macroautophagy • GO:0000046 autophagosome maturation • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • cellular response to nitrogen starvation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23710	57436
Ensembl	ENSG00000139112	ENSMUSG00000030161
UniProt	Q9H0R8	Q8R3R8
RefSeq (мРНК)	NM_031412 NM_001363598	NM_020590
RefSeq (білок)	NP_113600 NP_001350527	NP_065615
Локус (UCSC)	Хр. 12: 10.21 – 10.22 Mb	Хр. 6: 129.51 – 129.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GABARAPL1 (англ. GABA type A receptor associated protein like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 14 044.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKFQYKEDHP		FEYRKKEGEK		IRKKYPDRVP		VIVEKAPKAR		VPDLDKRKYL
VPSDLTVGQF		YFLIRKRIHL		RPEDALFFFV		NNTIPPTSAT		MGQLYEDNHE
EDYFLYVAYS		DESVYGK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Behrends C., Sowa M.E., Gygi S.P., Harper J.W. (2010). Network organization of the human autophagy system. Nature. 466: 68—76. PMID 20562859 DOI:10.1038/nature09204

Див. також

• Хромосома 12