GARNL3

GARNL3
Ідентифікатори
Символи	GARNL3, bA356B19.1, GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3
Зовнішні ІД	MGI: 2139309 HomoloGene: 13003 GeneCards: GARNL3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84253	99326
Ensembl	ENSG00000136895	ENSMUSG00000038860
UniProt	Q5VVW2	Q3V0G7
RefSeq (мРНК)	NM_001286779 NM_032293	NM_178888 NM_001355200 NM_001355201 NM_001355202
RefSeq (білок)	NP_001273708 NP_115669	NP_849219 NP_001342129 NP_001342130 NP_001342131
Локус (UCSC)	Хр. 9: 127.22 – 127.39 Mb	Хр. 2: 32.88 – 33.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GARNL3 (англ. GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 013 амінокислот, а молекулярна маса — 112 852.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVVDFCRRFV		ARSLCIILMK		HFCSSSVSED		LGCRRGDFSR		KHYGSVELLI
SSDADGAIQR		AGRFRVENGS		SDENATALPG		TWRRTDVHLE		NPEYHTRWYF
KYFLGQVHQN		YIGNDAEKSP		FFLSVTLSDQ		NNQRVPQYRA		ILWRKTGTQK
ICLPYSPTKT		LSVKSILSAM		NLDKFEKGPR		EIFHPEIQKD		LLVLEEQEGS
VNFKFGVLFA		KDGQLTDDEM		FSNEIGSEPF		QKFLNLLGDT		ITLKGWTGYR
GGLDTKNDTT		GIHSVYTVYQ		GHEIMFHVST		MLPYSKENKQ		QVERKRHIGN
DIVTIVFQEG		EESSPAFKPS		MIRSHFTHIF		ALVRYNQQND		NYRLKIFSEE
SVPLFGPPLP		TPPVFTDHQE		FRDFLLVKLI		NGEKATLETP		TFAQKRRRTL
DMLIRSLHQD		LMPDLHKNML		NRRSFSDVLP		ESPKSARKKE		EARQAEFVRI
GQALKLKSIV		RGDAPSSLAA		SGICKKEPWE		PQCFCSNFPH		EAVCADPWGQ
ALLVSTDAGV		LLVDDDLPSV		PVFDRTLPVK		QMHVLETLDL		LVLRADKGKD
ARLFVFRLSA		LQKGLEGKQA		GKSRSDCREN		KLEKTKGCHL		YAINTHHSRE
LRIVVAIRNK		LLLITRKHNK		PSGVTSTSLL		SPLSESPVEE		FQYIREICLS
DSPMVMTLVD		GPAEESDNLI		CVAYRHQFDV		VNESTGEAFR		LHHVEANRVN
FVAAIDVYED		GEAGLLLCYN		YSCIYKKVCP		FNGGSFLVQP		SASDFQFCWN
QAPYAIVCAF		PYLLAFTTDS		MEIRLVVNGN		LVHTAVVPQL		QLVASRSDIY
FTATAAVNEV		SSGGSSKGAS		ARNSPQTPPG		RDTPVFPSSL		GEGEIQSKNL
YKIPLRNLVG		RSIERPLKSP		LVSKVITPPT		PISVGLAAIP		VTHSLSLSRM
EIKEIASRTR		RELLGLSDEG		GPKSEGAPKA		KSKPRKRLEE		SQGGPKPGAV
RSSSSDRIPS		GSLESASTSE		ANPEGHSASS		DQDPVADREG		SPVSGSSPFQ
LTAFSDEDII		DLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9