GEMIN5

GEMIN5
Ідентифікатори
Символи	GEMIN5, GEMIN-5, gem nuclear organelle associated protein 5, NEDCAM
Зовнішні ІД	OMIM: 607005 MGI: 2449311 HomoloGene: 9155 GeneCards: GEMIN5
Онтологія гена Молекулярна функція • snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA 7-methylguanosine cap binding • mRNA 3'-UTR binding • U1 snRNA binding • U4 snRNA binding • U4atac snRNA binding • ribosome binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • SMN complex • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • Ядерні тільця • мембрана • gemini of coiled bodies • Нуклеоплазма • клітинне ядро • cytosolic large ribosomal subunit • SMN-Gemin2 complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • spliceosomal snRNP assembly • import into nucleus • Біосинтез білків • regulation of translation • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25929	216766
Ensembl	ENSG00000082516	ENSMUSG00000037275
UniProt	Q8TEQ6	Q8BX17
RefSeq (мРНК)	NM_015465 NM_001252156	NM_001166669 NM_001166670 NM_001166671 NM_172558 NM_001374702
RefSeq (білок)	NP_001239085 NP_056280	NP_001160141 NP_001160142 NP_001160143 NP_766146 NP_001361631
Локус (UCSC)	Хр. 5: 154.89 – 154.94 Mb	Хр. 11: 58.01 – 58.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GEMIN5 (англ. Gem nuclear organelle associated protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 508 амінокислот, а молекулярна маса — 168 589.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQEPRTLPP		SPNWYCARCS		DAVPGGLFGF		AARTSVFLVR		VGPGAGESPG
TPPFRVIGEL		VGHTERVSGF		TFSHHPGQYN		LCATSSDDGT		VKIWDVETKT
VVTEHALHQH		TISTLHWSPR		VKDLIVSGDE		KGVVFCYWFN		RNDSQHLFIE
PRTIFCLTCS		PHHEDLVAIG		YKDGIVVIID		ISKKGEVIHR		LRGHDDEIHS
IAWCPLPGED		CLSINQEETS		EEAEITNGNA		VAQAPVTKGC		YLATGSKDQT
IRIWSCSRGR		GVMILKLPFL		KRRGGGIDPT		VKERLWLTLH		WPSNQPTQLV
SSCFGGELLQ		WDLTQSWRRK		YTLFSASSEG		QNHSRIVFNL		CPLQTEDDKQ
LLLSTSMDRD		VKCWDIATLE		CSWTLPSLGG		FAYSLAFSSV		DIGSLAIGVG
DGMIRVWNTL		SIKNNYDVKN		FWQGVKSKVT		ALCWHPTKEG		CLAFGTDDGK
VGLYDTYSNK		PPQISSTYHK		KTVYTLAWGP		PVPPMSLGGE		GDRPSLALYS
CGGEGIVLQH		NPWKLSGEAF		DINKLIRDTN		SIKYKLPVHT		EISWKADGKI
MALGNEDGSI		EIFQIPNLKL		ICTIQQHHKL		VNTISWHHEH		GSQPELSYLM
ASGSNNAVIY		VHNLKTVIES		SPESPVTITE		PYRTLSGHTA		KITSVAWSPH
HDGRLVSASY		DGTAQVWDAL		REEPLCNFRG		HRGRLLCVAW		SPLDPDCIYS
GADDFCVHKW		LTSMQDHSRP		PQGKKSIELE		KKRLSQPKAK		PKKKKKPTLR
TPVKLESIDG		NEEESMKENS		GPVENGVSDQ		EGEEQAREPE		LPCGLAPAVS
REPVICTPVS		SGFEKSKVTI		NNKVILLKKE		PPKEKPETLI		KKRKARSLLP
LSTSLDHRSK		EELHQDCLVL		ATAKHSRELN		EDVSADVEER		FHLGLFTDRA
TLYRMIDIEG		KGHLENGHPE		LFHQLMLWKG		DLKGVLQTAA		ERGELTDNLV
AMAPAAGYHV		WLWAVEAFAK		QLCFQDQYVK		AASHLLSIHK		VYEAVELLKS
NHFYREAIAI		AKARLRPEDP		VLKDLYLSWG		TVLERDGHYA		VAAKCYLGAT
CAYDAAKVLA		KKGDAASLRT		AAELAAIVGE		DELSASLALR		CAQELLLANN
WVGAQEALQL		HESLQGQRLV		FCLLELLSRH		LEEKQLSEGK		SSSSYHTWNT
GTEGPFVERV		TAVWKSIFSL		DTPEQYQEAF		QKLQNIKYPS		ATNNTPAKQL
LLHICHDLTL		AVLSQQMASW		DEAVQALLRA		VVRSYDSGSF		TIMQEVYSAF
LPDGCDHLRD		KLGDHQSPAT		PAFKSLEAFF		LYGRLYEFWW		SLSRPCPNSS
VWVRAGHRTL		SVEPSQQLDT		ASTEETDPET		SQPEPNRPSE		LDLRLTEEGE
RMLSTFKELF		SEKHASLQNS		QRTVAEVQET		LAEMIRQHQK		SQLCKSTANG
PDKNEPEVEA		EQPLCSSQSQ		CKEEKNEPLS		LPELTKRLTE		ANQRMAKFPE
SIKAWPFPDV		LECCLVLLLI		RSHFPGCLAQ		EMQQQAQELL		QKYGNTKTYR
RHCQTFCM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, біосинтез білка, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lau C.K., Bachorik J.L., Dreyfuss G. (2009). Gemin5-snRNA interaction reveals an RNA binding function for WD repeat domains. Nat. Struct. Mol. Biol. 16: 486—491. PMID 19377484 DOI:10.1038/nsmb.1584
• Bradrick S.S., Gromeier M. (2009). Identification of gemin5 as a novel 7-methylguanosine cap-binding protein. PLoS ONE. 4: E7030—E7030. PMID 19750007 DOI:10.1371/journal.pone.0007030
• Yong J., Kasim M., Bachorik J.L., Wan L., Dreyfuss G. (2010). Gemin5 delivers snRNA precursors to the SMN complex for snRNP biogenesis. Mol. Cell. 38: 551—562. PMID 20513430 DOI:10.1016/j.molcel.2010.03.014
• Workman E., Kalda C., Patel A., Battle D.J. (2015). Gemin5 binds to the survival motor neuron mRNA to regulate SMN expression. J. Biol. Chem. 290: 15662—15669. PMID 25911097 DOI:10.1074/jbc.M115.646257
• Francisco-Velilla R., Fernandez-Chamorro J., Ramajo J., Martinez-Salas E. (2016). The RNA-binding protein Gemin5 binds directly to the ribosome and regulates global translation. Nucleic Acids Res. 44: 8335—8351. PMID 27507887 DOI:10.1093/nar/gkw702

Див. також

• Хромосома 5