GPC6

GPC6
Ідентифікатори
Символи	GPC6, OMIMD1, Glypican 6
Зовнішні ІД	OMIM: 604404 MGI: 1346322 HomoloGene: 55922 GeneCards: GPC6
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера, ожиріння, розлад дефіциту уваги та гіперактивності
Онтологія гена Молекулярна функція • heparan sulfate proteoglycan binding • coreceptor activity involved in Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Golgi lumen • клітинне ядро • integral component of plasma membrane • extracellular region • anchored component of membrane • lysosomal lumen • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинний простір • anchored component of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix • glutamatergic synapse • cell surface • синапс Біологічний процес • glycosaminoglycan metabolic process • retinoid metabolic process • cell migration • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of signal transduction • regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane • regulation of protein localization to membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10082	23888
Ensembl	ENSG00000183098	ENSMUSG00000058571
UniProt	Q9Y625	Q9R087
RefSeq (мРНК)	NM_005708	NM_001079844 NM_011821
RefSeq (білок)	NP_005699	NP_001073313 NP_035951
Локус (UCSC)	Хр. 13: 93.23 – 94.41 Mb	Хр. 14: 117.16 – 118.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GPC6 (англ. Glypican 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 555 амінокислот, а молекулярна маса — 62 736.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSWIGAVIL		PLLGLLLSLP		AGADVKARSC		GEVRQAYGAK		GFSLADIPYQ
EIAGEHLRIC		PQEYTCCTTE		MEDKLSQQSK		LEFENLVEET		SHFVRTTFVS
RHKKFDEFFR		ELLENAEKSL		NDMFVRTYGM		LYMQNSEVFQ		DLFTELKRYY
TGGNVNLEEM		LNDFWARLLE		RMFQLINPQY		HFSEDYLECV		SKYTDQLKPF
GDVPRKLKIQ		VTRAFIAART		FVQGLTVGRE		VANRVSKVSP		TPGCIRALMK
MLYCPYCRGL		PTVRPCNNYC		LNVMKGCLAN		QADLDTEWNL		FIDAMLLVAE
RLEGPFNIES		VMDPIDVKIS		EAIMNMQENS		MQVSAKVFQG		CGQPKPAPAL
RSARSAPENF		NTRFRPYNPE		ERPTTAAGTS		LDRLVTDIKE		KLKLSKKVWS
ALPYTICKDE		SVTAGTSNEE		ECWNGHSKAR		YLPEIMNDGL		TNQINNPEVD
VDITRPDTFI		RQQIMALRVM		TNKLKNAYNG		NDVNFQDTSD		ESSGSGSGSG
CMDDVCPTEF		EFVTTEAPAV		DPDRREVDSS		AAQRGHSLLS		WSLTCIVLAL
QRLCR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Paine-Saunders S., Viviano B.L., Saunders S. (1999). GPC6, a novel member of the glypican gene family, encodes a product structurally related to GPC4 and is colocalized with GPC5 on human chromosome 13. Genomics. 57: 455—458. PMID 10329016 DOI:10.1006/geno.1999.5793
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yiu G.K., Kaunisto A., Chin Y.R., Toker A. (2011). NFAT promotes carcinoma invasive migration through glypican-6. Biochem. J. 440: 157—166. PMID 21871017 DOI:10.1042/BJ20110530

Див. також

• Хромосома 13