HLA-B

HLA-B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VCL, 4U1H, 4U1K, 5EO1, 5EO0,%%s1AGB, 1AGC, 1AGD, 1AGE, 1AGF, 1M05, 1MI5, 3FFC, 3SJV, 3SKM, 3SKO, 3SPV, 3X13, 3X14, 4QRP, 4QRQ, 4QRS, 4QRT, 4QRU,%%s4O2C, 4O2E, 4O2F,%%s3LN4, 3LN5,%%s4U1J, 4U1M, 4U1N,%%s4U1I, 4U1L, 4U1S,%%s1HSA, 1JGD, 1JGE, 1K5N, 1OF2, 1OGT, 1UXS, 1UXW, 1W0V, 1W0W, 2A83, 2BSR, 2BSS, 2BST, 3B3I, 3B6S, 3BP4, 3BP7, 3CZF, 3D18, 3DTX, 3HCV, 3LV3, 4G8G, 4G8I, 4G9D, 4G9F, 5DEF, 5DEG,%%s1A1N, 1A9B, 1A9E, 1CG9, 1XH3, 1ZHK, 1ZHL, 1ZSD, 2AK4, 2AXF, 2AXG, 2H6P, 2NW3, 2NX5, 3BW9, 3BWA, 3KWW, 3KXF, 3LKN, 3LKO, 3LKP, 3LKQ, 3LKR, 3LKS, 3MV7, 3MV8, 3MV9, 3VFS, 3VFT, 3VFU, 3VFV, 3VFW, 4LNR, 4PR5, 4PRN, 4QRR,%%s1A1M, 1A1O,%%s2BVO, 2BVP, 2BVQ, 2HJL, 2RFX, 2YPK, 2YPL, 3UPR, 3VH8, 3VRI, 3VRJ, 3WUW, 3X11, 3X12, 5B39, 5B38,%%s4JQV, 4XXC,%%s1XR8, 1XR9, 3C9N,%%s4LCY,%%s1M6O, 1N2R, 1SYV, 3DX6, 3DX7, 3DX8, 3DXA, 3KPL, 3KPM, 3KPN, 3KPO, 3KPP, 3KPQ, 3KPR, 3KPS, 3L3D, 3L3G, 3L3I, 3L3J, 4JQX,%%s1E27, 1E28, 4MJI,%%s3W39
Ідентифікатори
Символи	HLA-B, AS, SPDA1, Bw-47, Bw-50, major histocompatibility complex, class I, B, B-4901, B-5001, HEL-S-83, HLA-B*45ZJ, HLA-B-3506, HLA-B-3905, HLA-B-5502, HLA-B-5602, HLA-B15, HLA-B39, HLA-B49, HLA-B50, HLA-B55, HLA-B59, HLA-B61, HLA-Cw, HLA-DRB1
Зовнішні ІД	HomoloGene: 134029 GeneCards: HLA-B
Пов'язані генетичні захворювання
ВІЛ-заворювання
Онтологія гена Молекулярна функція • signaling receptor binding • peptide antigen binding Клітинна компонента • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • ендоплазматичний ретикулум • MHC class I protein complex • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • екзосома • secretory granule membrane • recycling endosome membrane Біологічний процес • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of interleukin-12 production • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • regulation of dendritic cell differentiation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • protection from natural killer cell mediated cytotoxicity • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • regulation of T cell anergy • GO:0022415 viral process • regulation of interleukin-6 production • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3106	30757
Ensembl	ENSG00000228964 ENSG00000234745 ENSG00000206450 ENSG00000224608 ENSG00000223532 ENSG00000232126	ENSDARG00000075963
UniProt	P01889	Q31365
RefSeq (мРНК)	NM_005514	NM_131471
RefSeq (білок)	NP_005505	NP_571546
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.35 – 31.37 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-B (англ. HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 40 460.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLVMAPRTVL		LLLSAALALT		ETWAGSHSMR		YFYTSVSRPG		RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF		DSDAASPREE		PRAPWIEQEG		PEYWDRNTQI		YKAQAQTDRE
SLRNLRGYYN		QSEAGSHTLQ		SMYGCDVGPD		GRLLRGHDQY		AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA		DTAAQITQRK		WEAAREAEQR		RAYLEGECVE		WLRRYLENGK
DKLERADPPK		THVTHHPISD		HEATLRCWAL		GFYPAEITLT		WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA		GDRTFQKWAA		VVVPSGEEQR		YTCHVQHEGL		PKPLTLRWEP
SSQSTVPIVG		IVAGLAVLAV		VVIGAVVAAV		MCRRKSSGGK		GGSYSQAACS
DSAQGSDVSL		TA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

• Ennis P.D., Zemmour J., Salter R.D., Parham P. (1990). Rapid cloning of HLA-A,B cDNA by using the polymerase chain reaction: frequency and nature of errors produced in amplification. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2833—2837. PMID 2320591 DOI:10.1073/pnas.87.7.2833
• Bergmans A., Tijssen H., Lardy J., Reekers P. (1993). Complete nucleotide sequence of HLA-B*0703, a B7-variant (BPOT). Hum. Immunol. 38: 159—162. PMID 8106270 DOI:10.1016/0198-8859(93)90533-7
• Kubens B.S., Arnett K.L., Adams E.J., Parham P., Grosse-Wilde H. (1995). Definition of a new HLA-B7 subtype (B*0704) by isoelectric focusing, family studies and DNA sequence analysis. Tissue Antigens. 45: 322—327. PMID 7652739 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02461.x
• Arnett K.L., Adams E.J., Domena J.D., Parham P. (1994). Structure of a novel subtype of B7 (B*0705) isolated from a Chinese individual. Tissue Antigens. 44: 318—321. PMID 7878658 DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02402.x
• Middleton D., Curran M.D., Anholts J.D., Reilly E.R., Schreuder G.M. (2001). Characterisation of a new HLA-B allele, HLA-B*0724. Tissue Antigens. 57: 471—473. PMID 11556973 DOI:10.1034/j.1399-0039.2001.057005471.x
• Orr H.T., Lopez de Castro J.A., Lancet D., Strominger J.L. (1979). Complete amino acid sequence of a papain-solubilized human histocompatibility antigen, HLA-B7. 2. Sequence determination and search for homologies. Biochemistry. 18: 5711—5720. PMID 518865 DOI:10.1021/bi00592a030

Див. також

• Хромосома 6