HMG20B

HMG20B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CRJ
Ідентифікатори
Символи	HMG20B, BRAF25, BRAF35, HMGX2, HMGXB2, PP7706, SMARCE1r, SOXL, pp8857, high mobility group 20B
Зовнішні ІД	OMIM: 605535 MGI: 1341190 HomoloGene: 74949 GeneCards: HMG20B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • histone deacetylase activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • хромосома; • Ядерні тільця;
Біологічний процес	• skeletal muscle cell differentiation; • клітинний цикл; • negative regulation of protein sumoylation; • зсідання крові; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of neuron differentiation; • transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10362
	15353
	ENSG00000064961
	ENSMUSG00000020232
	Q9P0W2
	Q9Z104
	NM_006339
	NM_001163165; NM_001163166; NM_010440
	NP_006330
	NP_001156637; NP_001156638; NP_034570
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HMG20B (англ. High mobility group 20B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 813^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSHGPKQPGA	AAAPAGGKAP	GQHGGFVVTV	KQERGEGPRA	GEKGSHEEEP
VKKRGWPKGK	KRKKILPNGP	KAPVTGYVRF	LNERREQIRT	RHPDLPFPEI
TKMLGAEWSK	LQPTEKQRYL	DEAEREKQQY	MKELRAYQQS	EAYKMCTEKI
QEKKIKKEDS	SSGLMNTLLN	GHKGGDCDGF	STFDVPIFTE	EFLDQNKARE
AELRRLRKMN	VAFEEQNAVL	QRHTQSMSSA	RERLEQELAL	EERRTLALQQ
QLQAVRQALT	ASFASLPVPG	TGETPTLGTL	DFYMARLHGA	IERDPAQHEK
LIVRIKEILA	QVASEHL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література[ред. | ред. код]

Lee Y.M., Shin H., Choi W., Ahn S., Kim W. (2002). Characterization of human SMARCE1r high-mobility-group protein. Biochim. Biophys. Acta. 1574: 269—276. PMID 11997092 DOI:10.1016/S0167-4781(01)00373-6
Wang C., McCarty I.M., Balazs L., Li Y., Steiner M.S. (2002). Cloning a cDNA encoding an alternatively spliced protein of BRCA2-associated factor 35. Biochem. Biophys. Res. Commun. 295: 129—135. PMID 12083779 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00624-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200