HNRNPDL

HNRNPDL
Ідентифікатори
Символи	HNRNPDL, HNRNP, HNRPDL, JKTBP, JKTBP2, laAUF1, LGMD1G, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D like, LGMDD3
Зовнішні ІД	OMIM: 607137 MGI: 1355299 HomoloGene: 75314 GeneCards: HNRNPDL
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal dominant limb-girdle muscular dystrophy type 1G
Онтологія гена
Молекулярна функція	• poly(G) binding; • single-stranded DNA binding; • DNA binding; • double-stranded DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • poly(A) binding; • nucleic acid binding; • RNA binding; • sequence-specific DNA binding; • sequence-specific double-stranded DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • spliceosomal complex; • екзосома; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• регуляція експресії генів; • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • interleukin-12-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9987
	50926
	ENSG00000152795
	ENSMUSG00000029328
	O14979
	Q9Z130
	NM_001207000; NM_005463; NM_031372
	NM_016690
	NP_001193929; NP_112740
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HNRNPDL (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 46 438^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVPPRLSHV	PPPLFPSAPA	TLASRSLSHW	RPRPPRQLAP	LLPSLAPSSA
RQGARRAQRH	VTAQQPSRLA	GGAAIKGGRR	RRPDLFRRHF	KSSSIQRSAA
AAAATRTARQ	HPPADSSVTM	EDMNEYSNIE	EFAEGSKINA	SKNQQDDGKM
FIGGLSWDTS	KKDLTEYLSR	FGEVVDCTIK	TDPVTGRSRG	FGFVLFKDAA
SVDKVLELKE	HKLDGKLIDP	KRAKALKGKE	PPKKVFVGGL	SPDTSEEQIK
EYFGAFGEIE	NIELPMDTKT	NERRGFCFIT	YTDEEPVKKL	LESRYHQIGS
GKCEIKVAQP	KEVYRQQQQQ	QKGGRGAAAG	GRGGTRGRGR	GQGQNWNQGF
NNYYDQGYGN	YNSAYGGDQN	YSGYGGYDYT	GYNYGNYGYG	QGYADYSGQQ
STYGKASRGG	GNHQNNYQPY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література[ред. | ред. код]

Tsuchiya N., Kamei D., Takano A., Matsui T., Yamada M. (1998). Cloning and characterization of a cDNA encoding a novel heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-like protein and its expression in myeloid leukemia cells. J. Biochem. 123: 499—507. PMID 9538234 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021964
Kamei D., Tsuchiya N., Yamazaki M., Meguro H., Yamada M. (1999). Two forms of expression and genomic structure of the human heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like JKTBP gene (HNRPDL). Gene. 228: 13—22. PMID 10072754 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00020-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Doi A., Shiosaka T., Takaoka Y., Yanagisawa K., Fujita S. (1998). Molecular cloning of the cDNA encoding A + U-rich element RNA binding factor. Biochim. Biophys. Acta. 1396: 51—56. PMID 9524220 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00223-6
Kamei D., Yamada M. (2002). Interactions of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like protein JKTBP and its domains with high-affinity binding sites. Gene. 298: 49—57. PMID 12406575 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00926-5