IRGM

IRGM
Ідентифікатори
Символи	IRGM, IFI1, IRGM1, LRG-47, LRG47, immunity-related GTPase M, immunity related GTPase M
Зовнішні ІД	OMIM: 608212 MGI: 1926262 HomoloGene: 78363 GeneCards: IRGM
Пов'язані генетичні захворювання
inflammatory bowel disease 19
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • protein serine/threonine kinase activator activity • CARD domain binding • BH3 domain binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • phagocytic vesicle membrane • autophagosome membrane • cell projection • phagocytic cup • клітинна мембрана • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Golgi membrane • мітохондрія • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • Автофагія • inflammatory response • процес імунної системи • autophagosome assembly • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of autophagy • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • protein destabilization • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • GO:0106159 regulation of protein-containing complex assembly • вроджений імунітет • protein stabilization • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • positive regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of protein complex stability • protein lipidation involved in autophagosome assembly • CAMKK-AMPK signaling cascade • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of autophagosome maturation • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • defense response • cellular response to interferon-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	345611	54396
Ensembl	ENSG00000237693	ENSMUSG00000069874
UniProt	A1A4Y4	Q9Z1M2
RefSeq (мРНК)	NM_001145805 NM_001346557	NM_019440
RefSeq (білок)	NP_001139277 NP_001333486	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 150.85 – 150.9 Mb	Хр. 11: 58.09 – 58.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRGM (англ. Immunity related GTPase M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 142.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAMNVEKAS		ADGNLPEVIS		NIKETLKIVS		RTPVNITMAG		DSGNGMSTFI
SALRNTGHEG		KASPPTELVK		ATQRCASYFS		SHFSNVVLWD		LPGTGSATTT
LENYLMEMQF		NRYDFIMVAS		AQFSMNHVML		AKTAEDMGKK		FYIVWTKLDM
DLSTGALPEV		QLLQIRENVL		ENLQKERVCE		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, автофагія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Singh S.B., Davis A.S., Taylor G.A., Deretic V. (2006). Human IRGM induces autophagy to eliminate intracellular mycobacteria. Science. 313: 1438—1441. PMID 16888103 DOI:10.1126/science.1129577

Див. також

• Хромосома 5