ITGAX

ITGAX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N3Y, 2LUV, 3K6S, 3K71, 3K72, 4NEH, 4NEN, 5ES4
Ідентифікатори
Символи	ITGAX, CD11C, SLEB6, integrin subunit alpha X
Зовнішні ІД	OMIM: 151510 MGI: 96609 HomoloGene: 55493 GeneCards: ITGAX
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • integrin complex • клітинна мембрана • мембрана • secretory granule membrane • tertiary granule membrane • ficolin-1-rich granule membrane Біологічний процес • animal organ morphogenesis • integrin-mediated signaling pathway • heterotypic cell-cell adhesion • адгезія клітин • extracellular matrix organization • leukocyte migration • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • neutrophil degranulation • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3687	16411
Ensembl	ENSG00000140678	ENSMUSG00000030789
UniProt	P20702	Q9QXH4
RefSeq (мРНК)	NM_000887 NM_001286375	NM_021334 NM_001363984 NM_001363985
RefSeq (білок)	NP_000878 NP_001273304	NP_067309 NP_001350913 NP_001350914
Локус (UCSC)	Хр. 16: 31.36 – 31.38 Mb	Хр. 7: 127.73 – 127.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITGAX (англ. Integrin subunit alpha X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 163 амінокислот, а молекулярна маса — 127 829.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTRTRAALLL		FTALATSLGF		NLDTEELTAF		RVDSAGFGDS		VVQYANSWVV
VGAPQKITAA		NQTGGLYQCG		YSTGACEPIG		LQVPPEAVNM		SLGLSLASTT
SPSQLLACGP		TVHHECGRNM		YLTGLCFLLG		PTQLTQRLPV		SRQECPRQEQ
DIVFLIDGSG		SISSRNFATM		MNFVRAVISQ		FQRPSTQFSL		MQFSNKFQTH
FTFEEFRRSS		NPLSLLASVH		QLQGFTYTAT		AIQNVVHRLF		HASYGARRDA
AKILIVITDG		KKEGDSLDYK		DVIPMADAAG		IIRYAIGVGL		AFQNRNSWKE
LNDIASKPSQ		EHIFKVEDFD		ALKDIQNQLK		EKIFAIEGTE		TTSSSSFELE
MAQEGFSAVF		TPDGPVLGAV		GSFTWSGGAF		LYPPNMSPTF		INMSQENVDM
RDSYLGYSTE		LALWKGVQSL		VLGAPRYQHT		GKAVIFTQVS		RQWRMKAEVT
GTQIGSYFGA		SLCSVDVDSD		GSTDLVLIGA		PHYYEQTRGG		QVSVCPLPRG
WRRWWCDAVL		YGEQGHPWGR		FGAALTVLGD		VNGDKLTDVV		IGAPGEEENR
GAVYLFHGVL		GPSISPSHSQ		RIAGSQLSSR		LQYFGQALSG		GQDLTQDGLV
DLAVGARGQV		LLLRTRPVLW		VGVSMQFIPA		EIPRSAFECR		EQVVSEQTLV
QSNICLYIDK		RSKNLLGSRD		LQSSVTLDLA		LDPGRLSPRA		TFQETKNRSL
SRVRVLGLKA		HCENFNLLLP		SCVEDSVTPI		TLRLNFTLVG		KPLLAFRNLR
PMLAADAQRY		FTASLPFEKN		CGADHICQDN		LGISFSFPGL		KSLLVGSNLE
LNAEVMVWND		GEDSYGTTIT		FSHPAGLSYR		YVAEGQKQGQ		LRSLHLTCDS
APVGSQGTWS		TSCRINHLIF		RGGAQITFLA		TFDVSPKAVL		GDRLLLTANV
SSENNTPRTS		KTTFQLELPV		KYAVYTVVSS		HEQFTKYLNF		SESEEKESHV
AMHRYQVNNL		GQRDLPVSIN		FWVPVELNQE		AVWMDVEVSH		PQNPSLRCSS
EKIAPPASDF		LAHIQKNPVL		DCSIAGCLRF		RCDVPSFSVQ		EELDFTLKGN
LSFGWVRQIL		QKKVSVVSVA		EITFDTSVYS		QLPGQEAFMR		AQTTTVLEKY
KVHNPTPLIV		GSSIGGLLLL		ALITAVLYKV		GFFKRQYKEM		MEEANGQIAP
ENGTQTPSPP		SEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Chua G.L., Tang X.Y., Patra A.T., Tan S.M., Bhattacharjya S. (2012). Structure and binding interface of the cytosolic tails of alphaXbeta2 integrin. PLoS ONE. 7: E41924—E41924. PMID 22844534 doi:10.1371/journal.pone.0041924
• Corbi A.L., Miller L.J., O'Connor K., Larson R.S., Springer T.A. (1987). cDNA cloning and complete primary structure of the alpha subunit of a leukocyte adhesion glycoprotein, p150,95. EMBO J. 6: 4023—4028. PMID 3327687
• Corbi A.L., Garcia-Aguilar J., Springer T.A. (1990). Genomic structure of an integrin alpha subunit, the leukocyte p150,95 molecule. J. Biol. Chem. 265: 2782—2788. PMID 2303426
• Miller L.J., Wiebe M., Springer T.A. (1987). Purification and alpha subunit N-terminal sequences of human Mac-1 and p150,95 leukocyte adhesion proteins. J. Immunol. 138: 2381—2383. PMID 3549901
• Corbi A.L., Garcia-Aguilar J., Springer T.A. (1990). J. Biol. Chem. 265: 12750—12751. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 16