ITGB4

ITGB4
Ідентифікатори
Символи
Зовнішні ІД	GeneCards: [1]
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	н/д	н/д
Ensembl	н/д	н/д
UniProt	н/д	н/д
RefSeq (мРНК)	н/д	н/д
RefSeq (білок)	н/д	н/д
Локус (UCSC)	н/д	н/д
PubMed search	н/д	н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

ITGB4 (англ. Integrin subunit beta 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 822 амінокислот, а молекулярна маса — 202 167.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGPRPSPWA		RLLLAALISV		SLSGTLANRC		KKAPVKSCTE		CVRVDKDCAY
CTDEMFRDRR		CNTQAELLAA		GCQRESIVVM		ESSFQITEET		QIDTTLRRSQ
MSPQGLRVRL		RPGEERHFEL		EVFEPLESPV		DLYILMDFSN		SMSDDLDNLK
KMGQNLARVL		SQLTSDYTIG		FGKFVDKVSV		PQTDMRPEKL		KEPWPNSDPP
FSFKNVISLT		EDVDEFRNKL		QGERISGNLD		APEGGFDAIL		QTAVCTRDIG
WRPDSTHLLV		FSTESAFHYE		ADGANVLAGI		MSRNDERCHL		DTTGTYTQYR
TQDYPSVPTL		VRLLAKHNII		PIFAVTNYSY		SYYEKLHTYF		PVSSLGVLQE
DSSNIVELLE		EAFNRIRSNL		DIRALDSPRG		LRTEVTSKMF		QKTRTGSFHI
RRGEVGIYQV		QLRALEHVDG		THVCQLPEDQ		KGNIHLKPSF		SDGLKMDAGI
ICDVCTCELQ		KEVRSARCSF		NGDFVCGQCV		CSEGWSGQTC		NCSTGSLSDI
QPCLREGEDK		PCSGRGECQC		GHCVCYGEGR		YEGQFCEYDN		FQCPRTSGFL
CNDRGRCSMG		QCVCEPGWTG		PSCDCPLSNA		TCIDSNGGIC		NGRGHCECGR
CHCHQQSLYT		DTICEINYSA		IHPGLCEDLR		SCVQCQAWGT		GEKKGRTCEE
CNFKVKMVDE		LKRAEEVVVR		CSFRDEDDDC		TYSYTMEGDG		APGPNSTVLV
HKKKDCPPGS		FWWLIPLLLL		LLPLLALLLL		LCWKYCACCK		ACLALLPCCN
RGHMVGFKED		HYMLRENLMA		SDHLDTPMLR		SGNLKGRDVV		RWKVTNNMQR
PGFATHAASI		NPTELVPYGL		SLRLARLCTE		NLLKPDTREC		AQLRQEVEEN
LNEVYRQISG		VHKLQQTKFR		QQPNAGKKQD		HTIVDTVLMA		PRSAKPALLK
LTEKQVEQRA		FHDLKVAPGY		YTLTADQDAR		GMVEFQEGVE		LVDVRVPLFI
RPEDDDEKQL		LVEAIDVPAG		TATLGRRLVN		ITIIKEQARD		VVSFEQPEFS
VSRGDQVARI		PVIRRVLDGG		KSQVSYRTQD		GTAQGNRDYI		PVEGELLFQP
GEAWKELQVK		LLELQEVDSL		LRGRQVRRFH		VQLSNPKFGA		HLGQPHSTTI
IIRDPDELDR		SFTSQMLSSQ		PPPHGDLGAP		QNPNAKAAGS		RKIHFNWLPP
SGKPMGYRVK		YWIQGDSESE		AHLLDSKVPS		VELTNLYPYC		DYEMKVCAYG
AQGEGPYSSL		VSCRTHQEVP		SEPGRLAFNV		VSSTVTQLSW		AEPAETNGEI
TAYEVCYGLV		NDDNRPIGPM		KKVLVDNPKN		RMLLIENLRE		SQPYRYTVKA
RNGAGWGPER		EAIINLATQP		KRPMSIPIIP		DIPIVDAQSG		EDYDSFLMYS
DDVLRSPSGS		QRPSVSDDTG		CGWKFEPLLG		EELDLRRVTW		RLPPELIPRL
SASSGRSSDA		EAPHGPPDDG		GAGGKGGSLP		RSATPGPPGE		HLVNGRMDFA
FPGSTNSLHR		MTTTSAAAYG		THLSPHVPHR		VLSTSSTLTR		DYNSLTRSEH
SHSTTLPRDY		STLTSVSSHD		SRLTAGVPDT		PTRLVFSALG		PTSLRVSWQE
PRCERPLQGY		SVEYQLLNGG		ELHRLNIPNP		AQTSVVVEDL		LPNHSYVFRV
RAQSQEGWGR		EREGVITIES		QVHPQSPLCP		LPGSAFTLST		PSAPGPLVFT
ALSPDSLQLS		WERPRRPNGD		IVGYLVTCEM		AQGGGPATAF		RVDGDSPESR
LTVPGLSENV		PYKFKVQART		TEGFGPEREG		IITIESQDGG		PFPQLGSRAG
LFQHPLQSEY		SSITTTHTSA		TEPFLVDGLT		LGAQHLEAGG		SLTRHVTQEF
VSRTLTTSGT		LSTHMDQQFF		QT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Iacovacci S., Gagnoux-Palacios L., Zambruno G., Meneguzzi G., D'Alessio M. (1997). Genomic organization of the human integrin beta 4 gene. Mamm. Genome. 8: 448—450. PMID 9166594 DOI:10.1007/s003359900467
• van Leusden M.R., Kuikman I., Sonnenberg A. (1997). The unique cytoplasmic domain of the human integrin variant beta4E is produced by partial retention of intronic sequences. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 826—830. PMID 9207246 DOI:10.1006/bbrc.1997.6892
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hopkinson S.B., Jones J.C. (2000). The N terminus of the transmembrane protein BP180 interacts with the N-terminal domain of BP230, thereby mediating keratin cytoskeleton anchorage to the cell surface at the site of the hemidesmosome. Mol. Biol. Cell. 11: 277—286. PMID 10637308 DOI:10.1091/mbc.11.1.277
• Koster J., Geerts D., Favre B., Borradori L., Sonnenberg A. (2003). Analysis of the interactions between BP180, BP230, plectin and the integrin alpha6beta4 important for hemidesmosome assembly. J. Cell Sci. 116: 387—399. PMID 12482924 DOI:10.1242/jcs.00241
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 17